MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI03

Total Repeats: 2557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009957	GAA	2	6	24401	24406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046497
502	NC_009957	TGC	2	6	24524	24529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046497
503	NC_009957	GCT	2	6	24580	24585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046497
504	NC_009957	GC	3	6	24629	24634	0 %	0 %	50 %	50 %	159046497
505	NC_009957	CGA	2	6	24736	24741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046497
506	NC_009957	GAA	2	6	24779	24784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046497
507	NC_009957	TCGGG	2	10	24886	24895	0 %	20 %	60 %	20 %	159046497
508	NC_009957	GGC	2	6	24911	24916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046497
509	NC_009957	CCG	2	6	24918	24923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046497
510	NC_009957	CGT	2	6	24966	24971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046497
511	NC_009957	GA	3	6	24995	25000	50 %	0 %	50 %	0 %	159046498
512	NC_009957	CAG	2	6	25006	25011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046498
513	NC_009957	ATC	2	6	25016	25021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046498
514	NC_009957	CGA	2	6	25029	25034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046498
515	NC_009957	GTC	2	6	25075	25080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046498
516	NC_009957	CGG	2	6	25164	25169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046498
517	NC_009957	CCA	2	6	25219	25224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046498
518	NC_009957	GAT	2	6	25240	25245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046498
519	NC_009957	CAG	2	6	25277	25282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046498
520	NC_009957	GAT	2	6	25348	25353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046498
521	NC_009957	CCAGG	2	10	25354	25363	20 %	0 %	40 %	40 %	159046498
522	NC_009957	TC	3	6	25374	25379	0 %	50 %	0 %	50 %	159046498
523	NC_009957	CGG	2	6	25436	25441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046499
524	NC_009957	GAAAAG	2	12	25485	25496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046499
525	NC_009957	GAT	2	6	25614	25619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046499
526	NC_009957	TGC	2	6	25707	25712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046499
527	NC_009957	AGA	2	6	25793	25798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046499
528	NC_009957	GAT	2	6	25847	25852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046499
529	NC_009957	GGT	2	6	25879	25884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046499
530	NC_009957	CGC	3	9	25950	25958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046499
531	NC_009957	CGC	2	6	26003	26008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046499
532	NC_009957	TG	3	6	26034	26039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_009957	ATCG	2	8	26082	26089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
534	NC_009957	CAA	2	6	26092	26097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_009957	GAA	2	6	26204	26209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046500
536	NC_009957	G	6	6	26282	26287	0 %	0 %	100 %	0 %	159046500
537	NC_009957	ACG	2	6	26291	26296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046500
538	NC_009957	GCAC	2	8	26336	26343	25 %	0 %	25 %	50 %	159046500
539	NC_009957	CTC	2	6	26379	26384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046500
540	NC_009957	ATC	2	6	26395	26400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046500
541	NC_009957	CGGA	2	8	26487	26494	25 %	0 %	50 %	25 %	159046500
542	NC_009957	GCG	2	6	26521	26526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046500
543	NC_009957	GACC	2	8	26582	26589	25 %	0 %	25 %	50 %	159046500
544	NC_009957	CGA	2	6	26617	26622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_009957	GTTA	2	8	26651	26658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
546	NC_009957	TTC	2	6	26770	26775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046501
547	NC_009957	GC	3	6	26801	26806	0 %	0 %	50 %	50 %	159046501
548	NC_009957	GCG	2	6	26899	26904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046501
549	NC_009957	CTG	2	6	26920	26925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046501
550	NC_009957	CGG	2	6	26973	26978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046501
551	NC_009957	GCG	2	6	27022	27027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046501
552	NC_009957	GCT	2	6	27051	27056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046501
553	NC_009957	GCG	2	6	27091	27096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046501
554	NC_009957	TCG	3	9	27137	27145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046501
555	NC_009957	GA	3	6	27243	27248	50 %	0 %	50 %	0 %	159046501
556	NC_009957	GAG	2	6	27369	27374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009957	CCG	2	6	27389	27394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046502
558	NC_009957	GCT	2	6	27417	27422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046502
559	NC_009957	GAG	2	6	27457	27462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046502
560	NC_009957	CGA	2	6	27486	27491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046502
561	NC_009957	CGA	2	6	27552	27557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046502
562	NC_009957	CTC	2	6	27616	27621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046502
563	NC_009957	CTG	2	6	27628	27633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046502
564	NC_009957	CGTGG	2	10	27634	27643	0 %	20 %	60 %	20 %	159046502
565	NC_009957	AG	3	6	27689	27694	50 %	0 %	50 %	0 %	159046502
566	NC_009957	CGT	2	6	27696	27701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046502
567	NC_009957	TCC	2	6	27737	27742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046502
568	NC_009957	CGC	2	6	27859	27864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046502
569	NC_009957	CCG	2	6	27867	27872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046502
570	NC_009957	GCC	2	6	27882	27887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046502
571	NC_009957	ACC	2	6	27911	27916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046502
572	NC_009957	GAG	2	6	27922	27927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046502
573	NC_009957	TCG	2	6	27982	27987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046503
574	NC_009957	CCT	2	6	28015	28020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046503
575	NC_009957	TCG	2	6	28035	28040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046503
576	NC_009957	CTT	2	6	28120	28125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046503
577	NC_009957	CG	3	6	28126	28131	0 %	0 %	50 %	50 %	159046503
578	NC_009957	TCGC	2	8	28137	28144	0 %	25 %	25 %	50 %	159046503
579	NC_009957	CGG	2	6	28149	28154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046503
580	NC_009957	TCG	2	6	28191	28196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046503
581	NC_009957	TCA	2	6	28203	28208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046503
582	NC_009957	CCA	2	6	28274	28279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046503
583	NC_009957	GGT	2	6	28297	28302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046503
584	NC_009957	GTC	2	6	28325	28330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046503
585	NC_009957	GCT	2	6	28345	28350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046503
586	NC_009957	TCA	2	6	28434	28439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046503
587	NC_009957	CGG	2	6	28441	28446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046503
588	NC_009957	TCC	2	6	28455	28460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046503
589	NC_009957	ACA	2	6	28464	28469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046503
590	NC_009957	CT	3	6	28506	28511	0 %	50 %	0 %	50 %	159046503
591	NC_009957	CGG	2	6	28540	28545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046503
592	NC_009957	CGT	2	6	28597	28602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046503
593	NC_009957	TCA	2	6	28639	28644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046503
594	NC_009957	GGC	2	6	28675	28680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046503
595	NC_009957	CGT	2	6	28693	28698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046503
596	NC_009957	AGG	2	6	28860	28865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046503
597	NC_009957	GAC	2	6	28899	28904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046503
598	NC_009957	CCG	2	6	29096	29101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046504
599	NC_009957	TGG	2	6	29110	29115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046504
600	NC_009957	TTG	2	6	29127	29132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046504
601	NC_009957	CGG	2	6	29191	29196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_009957	GGC	2	6	29204	29209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_009957	AGA	2	6	29261	29266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_009957	CAG	2	6	29301	29306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_009957	GTAT	2	8	29499	29506	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
606	NC_009957	AAG	2	6	29551	29556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046505
607	NC_009957	CGAT	2	8	29633	29640	25 %	25 %	25 %	25 %	159046505
608	NC_009957	TC	3	6	29658	29663	0 %	50 %	0 %	50 %	159046505
609	NC_009957	TGG	2	6	29664	29669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046505
610	NC_009957	CGG	2	6	29716	29721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046505
611	NC_009957	GCC	2	6	29742	29747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046505
612	NC_009957	AAC	2	6	29839	29844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046505
613	NC_009957	GCT	2	6	29899	29904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046505
614	NC_009957	CG	3	6	29971	29976	0 %	0 %	50 %	50 %	159046505
615	NC_009957	GTT	2	6	30094	30099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046505
616	NC_009957	ACT	2	6	30275	30280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046505
617	NC_009957	GCT	2	6	30421	30426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_009957	GCA	2	6	30454	30459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_009957	GGCA	2	8	30488	30495	25 %	0 %	50 %	25 %	159046506
620	NC_009957	CGAA	2	8	30577	30584	50 %	0 %	25 %	25 %	159046506
621	NC_009957	TGC	2	6	30593	30598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046506
622	NC_009957	CAG	2	6	30621	30626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046506
623	NC_009957	CGA	2	6	30674	30679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046506
624	NC_009957	AGC	2	6	30843	30848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_009957	CGCC	2	8	30858	30865	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
626	NC_009957	AGCC	2	8	30888	30895	25 %	0 %	25 %	50 %	159046507
627	NC_009957	CCT	2	6	30919	30924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046507
628	NC_009957	GCC	2	6	30969	30974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046507
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878	NC_009957	CGG	2	6	42693	42698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046522
879	NC_009957	GCA	2	6	42757	42762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046522
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