MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI02

Total Repeats: 3471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009956	AGC	2	6	82646	82651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046407
2002	NC_009956	CGC	2	6	82734	82739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046407
2003	NC_009956	ACC	2	6	82751	82756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046407
2004	NC_009956	CAG	2	6	82759	82764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046407
2005	NC_009956	CCG	2	6	82765	82770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046407
2006	NC_009956	CCTGGG	2	12	82803	82814	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159046407
2007	NC_009956	CCA	2	6	82824	82829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046407
2008	NC_009956	CCCG	2	8	82881	82888	0 %	0 %	25 %	75 %	159046407
2009	NC_009956	CGC	3	9	82903	82911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046407
2010	NC_009956	CAC	2	6	82915	82920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046407
2011	NC_009956	GCC	2	6	82992	82997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046407
2012	NC_009956	GGC	2	6	83002	83007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046407
2013	NC_009956	CGT	2	6	83073	83078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046407
2014	NC_009956	GCC	2	6	83299	83304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2015	NC_009956	GGCCC	2	10	83351	83360	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2016	NC_009956	G	6	6	83411	83416	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_009956	GCCGC	2	10	83474	83483	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2018	NC_009956	GTG	2	6	83614	83619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046408
2019	NC_009956	CCG	2	6	83624	83629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046408
2020	NC_009956	CGC	2	6	83636	83641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046408
2021	NC_009956	GCG	2	6	83675	83680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046408
2022	NC_009956	GGC	2	6	83700	83705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046408
2023	NC_009956	AGG	2	6	83708	83713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046408
2024	NC_009956	CCGCC	2	10	83726	83735	0 %	0 %	20 %	80 %	159046408
2025	NC_009956	CCAGCA	2	12	83879	83890	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	159046408
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2027	NC_009956	CAGC	2	8	84033	84040	25 %	0 %	25 %	50 %	159046408
2028	NC_009956	GC	3	6	84045	84050	0 %	0 %	50 %	50 %	159046408
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2030	NC_009956	CCA	2	6	84095	84100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046408
2031	NC_009956	CCG	2	6	84133	84138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046408
2032	NC_009956	GGGCG	2	10	84165	84174	0 %	0 %	80 %	20 %	159046408
2033	NC_009956	GCG	3	9	84172	84180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046408
2034	NC_009956	GCGCCT	2	12	84299	84310	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	159046408
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2036	NC_009956	GCA	2	6	84353	84358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046408
2037	NC_009956	CT	3	6	84365	84370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2038	NC_009956	CG	3	6	84385	84390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2039	NC_009956	GCA	2	6	84418	84423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2040	NC_009956	CGG	2	6	84538	84543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2041	NC_009956	CTG	2	6	84640	84645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2042	NC_009956	AAAG	2	8	84704	84711	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_009956	GGA	2	6	84900	84905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046409
2044	NC_009956	ATT	2	6	84946	84951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159046409
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2047	NC_009956	AGA	2	6	85040	85045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046409
2048	NC_009956	AAT	2	6	85061	85066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159046409
2049	NC_009956	GAATG	2	10	85100	85109	40 %	20 %	40 %	0 %	159046409
2050	NC_009956	TCAG	2	8	85360	85367	25 %	25 %	25 %	25 %	159046409
2051	NC_009956	CAA	2	6	85451	85456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046409
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2054	NC_009956	CTT	2	6	85704	85709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046409
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2056	NC_009956	TC	3	6	85791	85796	0 %	50 %	0 %	50 %	159046409
2057	NC_009956	ACG	2	6	85851	85856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046409
2058	NC_009956	AAT	2	6	86048	86053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159046409
2059	NC_009956	GAGC	2	8	86099	86106	25 %	0 %	50 %	25 %	159046409
2060	NC_009956	GAT	2	6	86118	86123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046409
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2062	NC_009956	TGT	2	6	86365	86370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046409
2063	NC_009956	GCG	3	9	86398	86406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046409
2064	NC_009956	CGA	2	6	86411	86416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046409
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2067	NC_009956	ACG	2	6	86479	86484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046409
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2070	NC_009956	ATCT	2	8	86596	86603	25 %	50 %	0 %	25 %	159046409
2071	NC_009956	GAC	2	6	86609	86614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046409
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2095	NC_009956	CGA	2	6	87560	87565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046409
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2097	NC_009956	G	6	6	87602	87607	0 %	0 %	100 %	0 %	159046409
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2099	NC_009956	GGC	2	6	87765	87770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046409
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2109	NC_009956	TC	3	6	88333	88338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2110	NC_009956	TG	3	6	88351	88356	0 %	50 %	50 %	0 %	159046410
2111	NC_009956	CGC	2	6	88529	88534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046410
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2250	NC_009956	GAC	2	6	93556	93561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046410
2251	NC_009956	GGC	2	6	93625	93630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046410
2252	NC_009956	G	7	7	93650	93656	0 %	0 %	100 %	0 %	159046410
2253	NC_009956	CGA	2	6	93663	93668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046410
2254	NC_009956	CGG	2	6	93705	93710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046410
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2257	NC_009956	GGC	2	6	93787	93792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046410
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2282	NC_009956	CGG	2	6	95295	95300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046412
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2363	NC_009956	GCGCA	2	10	100178	100187	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2364	NC_009956	CCAG	2	8	100191	100198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2365	NC_009956	CGC	2	6	100213	100218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2366	NC_009956	GGC	2	6	100231	100236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2367	NC_009956	TA	3	6	100241	100246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2368	NC_009956	CAA	2	6	100284	100289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2369	NC_009956	T	6	6	100297	100302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2370	NC_009956	CGC	2	6	100329	100334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2371	NC_009956	GTT	2	6	100361	100366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2372	NC_009956	T	6	6	100372	100377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2373	NC_009956	GCA	2	6	100412	100417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2374	NC_009956	GTTG	2	8	100473	100480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2375	NC_009956	CGC	2	6	100608	100613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046416
2376	NC_009956	CTTT	2	8	100680	100687	0 %	75 %	0 %	25 %	159046416
2377	NC_009956	CGC	2	6	100688	100693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046416
2378	NC_009956	GGCG	2	8	100731	100738	0 %	0 %	75 %	25 %	159046416
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2491	NC_009956	GCCGT	2	10	106984	106993	0 %	20 %	40 %	40 %	159046422
2492	NC_009956	TCA	2	6	107000	107005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046422
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2494	NC_009956	GGCG	2	8	107096	107103	0 %	0 %	75 %	25 %	159046422
2495	NC_009956	GAT	2	6	107136	107141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046422
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2497	NC_009956	GCG	2	6	107203	107208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046422
2498	NC_009956	CCG	2	6	107222	107227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046422
2499	NC_009956	CGG	3	9	107243	107251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046422
2500	NC_009956	CCG	2	6	107270	107275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046422

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