MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI01

Total Repeats: 429

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009955	CG	3	6	487	492	0 %	0 %	50 %	50 %	159046136
2	NC_009955	GC	3	6	552	557	0 %	0 %	50 %	50 %	159046136
3	NC_009955	GC	3	6	1291	1296	0 %	0 %	50 %	50 %	159046137
4	NC_009955	CG	3	6	1411	1416	0 %	0 %	50 %	50 %	159046137
5	NC_009955	GC	3	6	1511	1516	0 %	0 %	50 %	50 %	159046137
6	NC_009955	AC	3	6	1770	1775	50 %	0 %	0 %	50 %	159046138
7	NC_009955	CG	3	6	2753	2758	0 %	0 %	50 %	50 %	159046138
8	NC_009955	TC	3	6	3125	3130	0 %	50 %	0 %	50 %	159046139
9	NC_009955	CG	3	6	3904	3909	0 %	0 %	50 %	50 %	159046140
10	NC_009955	TC	3	6	7533	7538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009955	CG	3	6	8379	8384	0 %	0 %	50 %	50 %	159046145
12	NC_009955	CG	3	6	8408	8413	0 %	0 %	50 %	50 %	159046145
13	NC_009955	CG	3	6	8713	8718	0 %	0 %	50 %	50 %	159046145
14	NC_009955	GC	3	6	9947	9952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009955	CG	3	6	10319	10324	0 %	0 %	50 %	50 %	159046146
16	NC_009955	GC	4	8	12202	12209	0 %	0 %	50 %	50 %	159046148
17	NC_009955	CG	4	8	12341	12348	0 %	0 %	50 %	50 %	159046148
18	NC_009955	CG	3	6	12510	12515	0 %	0 %	50 %	50 %	159046148
19	NC_009955	GC	3	6	12866	12871	0 %	0 %	50 %	50 %	159046148
20	NC_009955	GC	3	6	13358	13363	0 %	0 %	50 %	50 %	159046149
21	NC_009955	CG	4	8	13417	13424	0 %	0 %	50 %	50 %	159046149
22	NC_009955	CA	3	6	13692	13697	50 %	0 %	0 %	50 %	159046149
23	NC_009955	GC	3	6	15218	15223	0 %	0 %	50 %	50 %	159046151
24	NC_009955	CG	3	6	15364	15369	0 %	0 %	50 %	50 %	159046151
25	NC_009955	CG	3	6	15396	15401	0 %	0 %	50 %	50 %	159046151
26	NC_009955	AC	3	6	15407	15412	50 %	0 %	0 %	50 %	159046151
27	NC_009955	GC	3	6	15527	15532	0 %	0 %	50 %	50 %	159046151
28	NC_009955	CG	3	6	15794	15799	0 %	0 %	50 %	50 %	159046151
29	NC_009955	GC	3	6	15882	15887	0 %	0 %	50 %	50 %	159046151
30	NC_009955	CG	5	10	16131	16140	0 %	0 %	50 %	50 %	159046151
31	NC_009955	GC	3	6	16170	16175	0 %	0 %	50 %	50 %	159046151
32	NC_009955	CG	3	6	17165	17170	0 %	0 %	50 %	50 %	159046153
33	NC_009955	CG	3	6	17281	17286	0 %	0 %	50 %	50 %	159046153
34	NC_009955	CG	3	6	17492	17497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009955	CG	3	6	17870	17875	0 %	0 %	50 %	50 %	159046155
36	NC_009955	CG	3	6	17921	17926	0 %	0 %	50 %	50 %	159046155
37	NC_009955	CG	3	6	18004	18009	0 %	0 %	50 %	50 %	159046155
38	NC_009955	CG	3	6	18014	18019	0 %	0 %	50 %	50 %	159046155
39	NC_009955	GC	3	6	18162	18167	0 %	0 %	50 %	50 %	159046155
40	NC_009955	CG	4	8	18428	18435	0 %	0 %	50 %	50 %	159046155
41	NC_009955	GC	3	6	18696	18701	0 %	0 %	50 %	50 %	159046155
42	NC_009955	AC	3	6	18726	18731	50 %	0 %	0 %	50 %	159046155
43	NC_009955	GC	3	6	19124	19129	0 %	0 %	50 %	50 %	159046155
44	NC_009955	GC	3	6	19592	19597	0 %	0 %	50 %	50 %	159046156
45	NC_009955	CG	3	6	20445	20450	0 %	0 %	50 %	50 %	159046157
46	NC_009955	AG	4	8	21182	21189	50 %	0 %	50 %	0 %	159046159
47	NC_009955	TG	3	6	21300	21305	0 %	50 %	50 %	0 %	159046159
48	NC_009955	CG	3	6	21445	21450	0 %	0 %	50 %	50 %	159046159
49	NC_009955	TG	3	6	21470	21475	0 %	50 %	50 %	0 %	159046159
50	NC_009955	GC	3	6	22448	22453	0 %	0 %	50 %	50 %	159046160
51	NC_009955	CG	3	6	23059	23064	0 %	0 %	50 %	50 %	159046161
52	NC_009955	GC	3	6	23848	23853	0 %	0 %	50 %	50 %	159046162
53	NC_009955	GA	3	6	24214	24219	50 %	0 %	50 %	0 %	159046163
54	NC_009955	TC	3	6	24593	24598	0 %	50 %	0 %	50 %	159046163
55	NC_009955	TG	3	6	25253	25258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009955	GC	3	6	26020	26025	0 %	0 %	50 %	50 %	159046166
57	NC_009955	GA	3	6	26462	26467	50 %	0 %	50 %	0 %	159046166
58	NC_009955	AG	3	6	26908	26913	50 %	0 %	50 %	0 %	159046167
59	NC_009955	CG	3	6	27345	27350	0 %	0 %	50 %	50 %	159046168
60	NC_009955	CT	3	6	27725	27730	0 %	50 %	0 %	50 %	159046168
61	NC_009955	GC	5	10	28834	28843	0 %	0 %	50 %	50 %	159046170
62	NC_009955	CG	3	6	29140	29145	0 %	0 %	50 %	50 %	159046170
63	NC_009955	GC	3	6	29849	29854	0 %	0 %	50 %	50 %	159046171
64	NC_009955	CA	3	6	30119	30124	50 %	0 %	0 %	50 %	159046171
65	NC_009955	GC	3	6	30828	30833	0 %	0 %	50 %	50 %	159046172
66	NC_009955	CA	3	6	31542	31547	50 %	0 %	0 %	50 %	159046172
67	NC_009955	AT	3	6	32438	32443	50 %	50 %	0 %	0 %	159046173
68	NC_009955	GC	3	6	34597	34602	0 %	0 %	50 %	50 %	159046174
69	NC_009955	CG	3	6	35092	35097	0 %	0 %	50 %	50 %	159046174
70	NC_009955	GC	3	6	35181	35186	0 %	0 %	50 %	50 %	159046174
71	NC_009955	CG	3	6	35435	35440	0 %	0 %	50 %	50 %	159046174
72	NC_009955	AT	3	6	35477	35482	50 %	50 %	0 %	0 %	159046174
73	NC_009955	CG	3	6	35497	35502	0 %	0 %	50 %	50 %	159046174
74	NC_009955	CG	3	6	35621	35626	0 %	0 %	50 %	50 %	159046174
75	NC_009955	GC	3	6	36170	36175	0 %	0 %	50 %	50 %	159046175
76	NC_009955	GC	3	6	36353	36358	0 %	0 %	50 %	50 %	159046175
77	NC_009955	CG	3	6	36361	36366	0 %	0 %	50 %	50 %	159046175
78	NC_009955	CG	3	6	36489	36494	0 %	0 %	50 %	50 %	159046175
79	NC_009955	CG	3	6	36666	36671	0 %	0 %	50 %	50 %	159046175
80	NC_009955	GC	4	8	36974	36981	0 %	0 %	50 %	50 %	159046175
81	NC_009955	CA	3	6	37197	37202	50 %	0 %	0 %	50 %	159046175
82	NC_009955	CG	3	6	37835	37840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009955	GC	4	8	38006	38013	0 %	0 %	50 %	50 %	159046177
84	NC_009955	GC	3	6	38062	38067	0 %	0 %	50 %	50 %	159046177
85	NC_009955	GA	3	6	38071	38076	50 %	0 %	50 %	0 %	159046177
86	NC_009955	GC	3	6	38131	38136	0 %	0 %	50 %	50 %	159046177
87	NC_009955	CG	3	6	38365	38370	0 %	0 %	50 %	50 %	159046178
88	NC_009955	CA	3	6	38880	38885	50 %	0 %	0 %	50 %	159046179
89	NC_009955	CT	3	6	39203	39208	0 %	50 %	0 %	50 %	159046180
90	NC_009955	GC	3	6	39434	39439	0 %	0 %	50 %	50 %	159046180
91	NC_009955	CG	4	8	39563	39570	0 %	0 %	50 %	50 %	159046180
92	NC_009955	CG	3	6	39586	39591	0 %	0 %	50 %	50 %	159046180
93	NC_009955	TC	3	6	39877	39882	0 %	50 %	0 %	50 %	159046181
94	NC_009955	CG	4	8	40410	40417	0 %	0 %	50 %	50 %	159046183
95	NC_009955	GC	3	6	40698	40703	0 %	0 %	50 %	50 %	159046183
96	NC_009955	GC	3	6	40799	40804	0 %	0 %	50 %	50 %	159046183
97	NC_009955	CT	3	6	40870	40875	0 %	50 %	0 %	50 %	159046183
98	NC_009955	GC	3	6	40940	40945	0 %	0 %	50 %	50 %	159046183
99	NC_009955	GC	3	6	41887	41892	0 %	0 %	50 %	50 %	159046183
100	NC_009955	CG	3	6	42363	42368	0 %	0 %	50 %	50 %	159046183
101	NC_009955	CG	3	6	42484	42489	0 %	0 %	50 %	50 %	159046183
102	NC_009955	GC	3	6	42769	42774	0 %	0 %	50 %	50 %	159046184
103	NC_009955	GC	3	6	42859	42864	0 %	0 %	50 %	50 %	159046184
104	NC_009955	CG	4	8	42969	42976	0 %	0 %	50 %	50 %	159046185
105	NC_009955	CG	3	6	43315	43320	0 %	0 %	50 %	50 %	159046185
106	NC_009955	GC	3	6	43341	43346	0 %	0 %	50 %	50 %	159046185
107	NC_009955	GC	4	8	43391	43398	0 %	0 %	50 %	50 %	159046185
108	NC_009955	GC	4	8	43505	43512	0 %	0 %	50 %	50 %	159046185
109	NC_009955	CG	3	6	43911	43916	0 %	0 %	50 %	50 %	159046185
110	NC_009955	GA	3	6	44033	44038	50 %	0 %	50 %	0 %	159046186
111	NC_009955	CT	3	6	44412	44417	0 %	50 %	0 %	50 %	159046186
112	NC_009955	GC	3	6	44554	44559	0 %	0 %	50 %	50 %	159046186
113	NC_009955	CG	3	6	44680	44685	0 %	0 %	50 %	50 %	159046186
114	NC_009955	CG	3	6	45583	45588	0 %	0 %	50 %	50 %	159046188
115	NC_009955	CG	4	8	45785	45792	0 %	0 %	50 %	50 %	159046188
116	NC_009955	GC	3	6	45961	45966	0 %	0 %	50 %	50 %	159046188
117	NC_009955	GC	5	10	46792	46801	0 %	0 %	50 %	50 %	159046189
118	NC_009955	CG	3	6	47175	47180	0 %	0 %	50 %	50 %	159046189
119	NC_009955	AC	3	6	47340	47345	50 %	0 %	0 %	50 %	159046189
120	NC_009955	GC	4	8	47538	47545	0 %	0 %	50 %	50 %	159046189
121	NC_009955	GC	4	8	47714	47721	0 %	0 %	50 %	50 %	159046190
122	NC_009955	GC	3	6	47996	48001	0 %	0 %	50 %	50 %	159046190
123	NC_009955	GC	3	6	48005	48010	0 %	0 %	50 %	50 %	159046190
124	NC_009955	CG	3	6	48113	48118	0 %	0 %	50 %	50 %	159046190
125	NC_009955	CT	3	6	48126	48131	0 %	50 %	0 %	50 %	159046190
126	NC_009955	CA	3	6	49360	49365	50 %	0 %	0 %	50 %	159046193
127	NC_009955	GC	3	6	49475	49480	0 %	0 %	50 %	50 %	159046193
128	NC_009955	CG	3	6	49764	49769	0 %	0 %	50 %	50 %	159046193
129	NC_009955	GC	3	6	49898	49903	0 %	0 %	50 %	50 %	159046193
130	NC_009955	CG	3	6	49969	49974	0 %	0 %	50 %	50 %	159046193
131	NC_009955	GC	3	6	50119	50124	0 %	0 %	50 %	50 %	159046193
132	NC_009955	AT	3	6	50584	50589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009955	CA	3	6	50798	50803	50 %	0 %	0 %	50 %	159046194
134	NC_009955	CG	3	6	50824	50829	0 %	0 %	50 %	50 %	159046194
135	NC_009955	GC	3	6	51140	51145	0 %	0 %	50 %	50 %	159046194
136	NC_009955	CG	3	6	51177	51182	0 %	0 %	50 %	50 %	159046194
137	NC_009955	GT	3	6	51909	51914	0 %	50 %	50 %	0 %	159046195
138	NC_009955	GC	3	6	52856	52861	0 %	0 %	50 %	50 %	159046195
139	NC_009955	CG	3	6	52975	52980	0 %	0 %	50 %	50 %	159046195
140	NC_009955	AC	3	6	53655	53660	50 %	0 %	0 %	50 %	159046196
141	NC_009955	AG	3	6	54365	54370	50 %	0 %	50 %	0 %	159046196
142	NC_009955	AC	3	6	54865	54870	50 %	0 %	0 %	50 %	159046196
143	NC_009955	AT	3	6	54928	54933	50 %	50 %	0 %	0 %	159046196
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426	NC_009955	GC	3	6	189616	189621	0 %	0 %	50 %	50 %	159046329
427	NC_009955	CG	3	6	189749	189754	0 %	0 %	50 %	50 %	159046330
428	NC_009955	CT	4	8	189857	189864	0 %	50 %	0 %	50 %	159046330
429	NC_009955	GC	3	6	190019	190024	0 %	0 %	50 %	50 %	159046330

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.