MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI01

Total Repeats: 3792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009955	GTG	2	6	100389	100394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046238
2002	NC_009955	TCGG	2	8	100417	100424	0 %	25 %	50 %	25 %	159046238
2003	NC_009955	CG	3	6	100428	100433	0 %	0 %	50 %	50 %	159046238
2004	NC_009955	GTC	2	6	100447	100452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046238
2005	NC_009955	CG	3	6	100701	100706	0 %	0 %	50 %	50 %	159046238
2006	NC_009955	GCA	2	6	100736	100741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046238
2007	NC_009955	GCA	2	6	100859	100864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046238
2008	NC_009955	GCAA	2	8	100909	100916	50 %	0 %	25 %	25 %	159046238
2009	NC_009955	CTT	2	6	100925	100930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046238
2010	NC_009955	ATC	3	9	100987	100995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046238
2011	NC_009955	AGGC	2	8	101005	101012	25 %	0 %	50 %	25 %	159046238
2012	NC_009955	CGA	2	6	101027	101032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046238
2013	NC_009955	CGC	2	6	101052	101057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046238
2014	NC_009955	CGGA	2	8	101077	101084	25 %	0 %	50 %	25 %	159046238
2015	NC_009955	CTT	2	6	101096	101101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046238
2016	NC_009955	GCA	2	6	101195	101200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046238
2017	NC_009955	CGG	2	6	101335	101340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046239
2018	NC_009955	ATC	2	6	101349	101354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046239
2019	NC_009955	AGA	2	6	101358	101363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046239
2020	NC_009955	AGGT	2	8	101415	101422	25 %	25 %	50 %	0 %	159046239
2021	NC_009955	CTGC	2	8	101449	101456	0 %	25 %	25 %	50 %	159046239
2022	NC_009955	GTT	2	6	101459	101464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046239
2023	NC_009955	GGGCC	2	10	101520	101529	0 %	0 %	60 %	40 %	159046239
2024	NC_009955	CGAA	2	8	101565	101572	50 %	0 %	25 %	25 %	159046239
2025	NC_009955	CATGAC	2	12	101602	101613	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159046239
2026	NC_009955	TCG	2	6	101628	101633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046239
2027	NC_009955	CG	3	6	101651	101656	0 %	0 %	50 %	50 %	159046239
2028	NC_009955	GAC	2	6	101710	101715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046239
2029	NC_009955	CCG	2	6	101752	101757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046239
2030	NC_009955	TCG	2	6	101763	101768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046239
2031	NC_009955	AGC	2	6	101814	101819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046239
2032	NC_009955	CATG	2	8	101881	101888	25 %	25 %	25 %	25 %	159046239
2033	NC_009955	GCC	2	6	101929	101934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046239
2034	NC_009955	CGT	2	6	101937	101942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046239
2035	NC_009955	GACC	2	8	101943	101950	25 %	0 %	25 %	50 %	159046239
2036	NC_009955	CAG	2	6	101951	101956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046239
2037	NC_009955	GCA	2	6	102039	102044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046239
2038	NC_009955	GCC	2	6	102059	102064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046239
2039	NC_009955	GC	3	6	102132	102137	0 %	0 %	50 %	50 %	159046239
2040	NC_009955	GCG	2	6	102153	102158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046239
2041	NC_009955	CTT	2	6	102161	102166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046239
2042	NC_009955	CTT	2	6	102246	102251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046240
2043	NC_009955	CG	3	6	102294	102299	0 %	0 %	50 %	50 %	159046240
2044	NC_009955	CAG	2	6	102541	102546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046240
2045	NC_009955	GCGGCA	2	12	102564	102575	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	159046240
2046	NC_009955	ACGCC	2	10	102581	102590	20 %	0 %	20 %	60 %	159046240
2047	NC_009955	CG	3	6	102664	102669	0 %	0 %	50 %	50 %	159046240
2048	NC_009955	GAG	3	9	102685	102693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046240
2049	NC_009955	AGG	2	6	102738	102743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046240
2050	NC_009955	CAG	2	6	102807	102812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046240
2051	NC_009955	GAT	2	6	102905	102910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046240
2052	NC_009955	TTC	2	6	102919	102924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046240
2053	NC_009955	GCC	2	6	102953	102958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046240
2054	NC_009955	TCC	2	6	102968	102973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046240
2055	NC_009955	CCAG	2	8	102993	103000	25 %	0 %	25 %	50 %	159046240
2056	NC_009955	TCT	2	6	103091	103096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046240
2057	NC_009955	CGT	2	6	103104	103109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046240
2058	NC_009955	TCG	2	6	103136	103141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046240
2059	NC_009955	TGT	2	6	103298	103303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046240
2060	NC_009955	GGC	2	6	103324	103329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046240
2061	NC_009955	ATG	2	6	103341	103346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046240
2062	NC_009955	CG	3	6	103347	103352	0 %	0 %	50 %	50 %	159046240
2063	NC_009955	CTT	2	6	103381	103386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046240
2064	NC_009955	A	6	6	103465	103470	100 %	0 %	0 %	0 %	159046240
2065	NC_009955	GTG	2	6	103537	103542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046240
2066	NC_009955	GAA	2	6	103545	103550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046240
2067	NC_009955	CG	3	6	103704	103709	0 %	0 %	50 %	50 %	159046240
2068	NC_009955	CAT	2	6	103774	103779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2069	NC_009955	AAC	2	6	103817	103822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2070	NC_009955	CGA	2	6	103920	103925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046241
2071	NC_009955	TCC	2	6	103931	103936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046241
2072	NC_009955	GAT	2	6	104038	104043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046241
2073	NC_009955	GAA	2	6	104077	104082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046241
2074	NC_009955	CGT	2	6	104226	104231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046241
2075	NC_009955	ACC	2	6	104342	104347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046241
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2078	NC_009955	CG	3	6	104441	104446	0 %	0 %	50 %	50 %	159046241
2079	NC_009955	AGA	2	6	104493	104498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046241
2080	NC_009955	TGC	2	6	104512	104517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046241
2081	NC_009955	CTG	2	6	104545	104550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046241
2082	NC_009955	C	6	6	104562	104567	0 %	0 %	0 %	100 %	159046241
2083	NC_009955	GCATG	2	10	104595	104604	20 %	20 %	40 %	20 %	159046241
2084	NC_009955	TCA	2	6	104609	104614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046241
2085	NC_009955	GTG	2	6	104672	104677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046241
2086	NC_009955	GCC	2	6	104791	104796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046241
2087	NC_009955	ATC	3	9	104974	104982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046241
2088	NC_009955	GC	3	6	104984	104989	0 %	0 %	50 %	50 %	159046241
2089	NC_009955	TGGTC	2	10	104997	105006	0 %	40 %	40 %	20 %	159046241
2090	NC_009955	ACCG	2	8	105021	105028	25 %	0 %	25 %	50 %	159046241
2091	NC_009955	CAT	2	6	105048	105053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046241
2092	NC_009955	ATG	3	9	105059	105067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046241
2093	NC_009955	GA	3	6	105086	105091	50 %	0 %	50 %	0 %	159046241
2094	NC_009955	CTC	2	6	105097	105102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046241
2095	NC_009955	TCA	2	6	105128	105133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046241
2096	NC_009955	GCG	2	6	105192	105197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046241
2097	NC_009955	GC	3	6	105210	105215	0 %	0 %	50 %	50 %	159046241
2098	NC_009955	GC	3	6	105244	105249	0 %	0 %	50 %	50 %	159046241
2099	NC_009955	CG	3	6	105276	105281	0 %	0 %	50 %	50 %	159046241
2100	NC_009955	GCGG	2	8	105306	105313	0 %	0 %	75 %	25 %	159046241
2101	NC_009955	GGC	2	6	105337	105342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046241
2102	NC_009955	GGGCG	2	10	105420	105429	0 %	0 %	80 %	20 %	159046241
2103	NC_009955	AAGG	2	8	105465	105472	50 %	0 %	50 %	0 %	159046241
2104	NC_009955	TCC	2	6	105515	105520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046241
2105	NC_009955	GCG	2	6	105606	105611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046241
2106	NC_009955	CGG	2	6	105667	105672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046241
2107	NC_009955	CCA	2	6	105681	105686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046241
2108	NC_009955	GCC	2	6	105687	105692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046241
2109	NC_009955	CGA	2	6	105720	105725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046241
2110	NC_009955	GGC	2	6	105733	105738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046241
2111	NC_009955	GAG	2	6	105767	105772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046241
2112	NC_009955	TCA	2	6	105786	105791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046241
2113	NC_009955	ACG	2	6	105794	105799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046241
2114	NC_009955	GCA	2	6	105819	105824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046241
2115	NC_009955	TCG	2	6	105827	105832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046241
2116	NC_009955	CGC	2	6	105861	105866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046241
2117	NC_009955	CG	3	6	105874	105879	0 %	0 %	50 %	50 %	159046241
2118	NC_009955	AGG	2	6	105881	105886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046241
2119	NC_009955	GCG	2	6	105938	105943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046241
2120	NC_009955	AGC	2	6	105946	105951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046241
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2122	NC_009955	GCG	2	6	106038	106043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046241
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2243	NC_009955	CCA	2	6	111174	111179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2248	NC_009955	CTTT	2	8	111694	111701	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2249	NC_009955	GCA	2	6	111706	111711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2251	NC_009955	GTC	2	6	111827	111832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2252	NC_009955	GCC	2	6	111969	111974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2253	NC_009955	GAGC	2	8	111997	112004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2254	NC_009955	ATC	2	6	112016	112021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2256	NC_009955	ATC	2	6	112065	112070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2367	NC_009955	GCC	2	6	117542	117547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046252
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2371	NC_009955	CG	3	6	117769	117774	0 %	0 %	50 %	50 %	159046252
2372	NC_009955	ACG	2	6	117906	117911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046252
2373	NC_009955	GC	3	6	117996	118001	0 %	0 %	50 %	50 %	159046252
2374	NC_009955	GTT	2	6	118022	118027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046252
2375	NC_009955	CGC	2	6	118042	118047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046252
2376	NC_009955	CGC	2	6	118076	118081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046252
2377	NC_009955	GCT	2	6	118085	118090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046252
2378	NC_009955	TCG	2	6	118092	118097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046252
2379	NC_009955	GCC	2	6	118127	118132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046252
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2382	NC_009955	GGC	2	6	118455	118460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2489	NC_009955	CCG	2	6	123162	123167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046257
2490	NC_009955	TGC	2	6	123177	123182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046257
2491	NC_009955	GCG	2	6	123183	123188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046257
2492	NC_009955	GGCAAA	2	12	123331	123342	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	159046257
2493	NC_009955	GGC	2	6	123399	123404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046257
2494	NC_009955	CGG	2	6	123475	123480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046257
2495	NC_009955	GTC	2	6	123569	123574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046257
2496	NC_009955	ACCG	2	8	123588	123595	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2497	NC_009955	GAG	2	6	123665	123670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046258
2498	NC_009955	CCG	2	6	123678	123683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046258
2499	NC_009955	GCT	2	6	123735	123740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046258
2500	NC_009955	TCG	2	6	123824	123829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046258

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