MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 chromosome

Total Repeats: 87795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009952	GCG	2	6	39200	39205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042592
1002	NC_009952	TCG	2	6	39272	39277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042592
1003	NC_009952	GCA	2	6	39279	39284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042592
1004	NC_009952	GC	3	6	39286	39291	0 %	0 %	50 %	50 %	159042592
1005	NC_009952	CGGA	2	8	39311	39318	25 %	0 %	50 %	25 %	159042592
1006	NC_009952	G	6	6	39426	39431	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009952	GTT	2	6	39458	39463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009952	CG	3	6	39530	39535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_009952	CA	3	6	39564	39569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_009952	TAA	2	6	39576	39581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_009952	TG	3	6	39671	39676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009952	CTT	2	6	39701	39706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042593
1013	NC_009952	TC	3	6	39713	39718	0 %	50 %	0 %	50 %	159042593
1014	NC_009952	CGA	2	6	39747	39752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042593
1015	NC_009952	GTG	2	6	39809	39814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042593
1016	NC_009952	CAA	2	6	39874	39879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159042593
1017	NC_009952	CTG	2	6	39881	39886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042593
1018	NC_009952	CAG	2	6	39925	39930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042593
1019	NC_009952	TCA	2	6	39936	39941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042593
1020	NC_009952	ACG	2	6	39957	39962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042593
1021	NC_009952	GGGC	2	8	40116	40123	0 %	0 %	75 %	25 %	159042593
1022	NC_009952	GCTCC	2	10	40151	40160	0 %	20 %	20 %	60 %	159042593
1023	NC_009952	TGC	2	6	40161	40166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042593
1024	NC_009952	GCG	3	9	40192	40200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042593
1025	NC_009952	GC	3	6	40205	40210	0 %	0 %	50 %	50 %	159042593
1026	NC_009952	CGA	2	6	40232	40237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_009952	CTT	2	6	40261	40266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_009952	A	7	7	40289	40295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009952	GCA	2	6	40386	40391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_009952	TGCG	2	8	40420	40427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_009952	GCC	2	6	40450	40455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042594
1032	NC_009952	CAG	2	6	40468	40473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042594
1033	NC_009952	TCT	2	6	40500	40505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042594
1034	NC_009952	GTC	2	6	40541	40546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042594
1035	NC_009952	GCA	3	9	40575	40583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042594
1036	NC_009952	CAG	2	6	40681	40686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042594
1037	NC_009952	AGC	2	6	40778	40783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042594
1038	NC_009952	TCAGCA	2	12	40869	40880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159042594
1039	NC_009952	GGC	2	6	40911	40916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042594
1040	NC_009952	TCA	2	6	41040	41045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042594
1041	NC_009952	GTT	2	6	41049	41054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159042594
1042	NC_009952	TCG	2	6	41084	41089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042594
1043	NC_009952	TCC	2	6	41123	41128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_009952	AGGG	2	8	41246	41253	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009952	CG	3	6	41296	41301	0 %	0 %	50 %	50 %	159042595
1046	NC_009952	GC	3	6	41306	41311	0 %	0 %	50 %	50 %	159042595
1047	NC_009952	GTG	2	6	41346	41351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042595
1048	NC_009952	GCTGGC	2	12	41375	41386	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159042595
1049	NC_009952	GGT	2	6	41417	41422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042595
1050	NC_009952	CGGCG	2	10	41455	41464	0 %	0 %	60 %	40 %	159042595
1051	NC_009952	GC	3	6	41477	41482	0 %	0 %	50 %	50 %	159042595
1052	NC_009952	CG	3	6	41504	41509	0 %	0 %	50 %	50 %	159042595
1053	NC_009952	GCGG	2	8	41546	41553	0 %	0 %	75 %	25 %	159042595
1054	NC_009952	GAT	2	6	41568	41573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042595
1055	NC_009952	TGC	2	6	41605	41610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042595
1056	NC_009952	GCG	2	6	41676	41681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042595
1057	NC_009952	GTG	2	6	41694	41699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042595
1058	NC_009952	CGG	2	6	41713	41718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042595
1059	NC_009952	GCC	2	6	41739	41744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042595
1060	NC_009952	GTC	2	6	41775	41780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042595
1061	NC_009952	TGTCGG	2	12	41797	41808	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159042595
1062	NC_009952	GGCGG	2	10	41810	41819	0 %	0 %	80 %	20 %	159042595
1063	NC_009952	GAG	2	6	41850	41855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042595
1064	NC_009952	CGC	3	9	41878	41886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042595
1065	NC_009952	CTG	2	6	41937	41942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042595
1066	NC_009952	GGGC	2	8	42007	42014	0 %	0 %	75 %	25 %	159042595
1067	NC_009952	AGG	2	6	42034	42039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042595
1068	NC_009952	CAA	2	6	42059	42064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159042595
1069	NC_009952	GC	3	6	42068	42073	0 %	0 %	50 %	50 %	159042595
1070	NC_009952	ACC	2	6	42115	42120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042595
1071	NC_009952	GCG	2	6	42173	42178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042595
1072	NC_009952	AAC	2	6	42210	42215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159042595
1073	NC_009952	GAT	2	6	42230	42235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042595
1074	NC_009952	CGC	2	6	42289	42294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042595
1075	NC_009952	GGC	2	6	42320	42325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042595
1076	NC_009952	TGT	2	6	42340	42345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159042595
1077	NC_009952	GGCC	2	8	42347	42354	0 %	0 %	50 %	50 %	159042595
1078	NC_009952	AGG	2	6	42361	42366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_009952	G	7	7	42365	42371	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_009952	TCG	2	6	42391	42396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042596
1081	NC_009952	GCA	2	6	42406	42411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042596
1082	NC_009952	CGC	4	12	42437	42448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042596
1083	NC_009952	TGG	2	6	42541	42546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042596
1084	NC_009952	CGA	2	6	42551	42556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042596
1085	NC_009952	GC	3	6	42567	42572	0 %	0 %	50 %	50 %	159042596
1086	NC_009952	CGG	2	6	42598	42603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042596
1087	NC_009952	CGG	2	6	42713	42718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042597
1088	NC_009952	TGC	2	6	42724	42729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042597
1089	NC_009952	CGGG	2	8	42740	42747	0 %	0 %	75 %	25 %	159042597
1090	NC_009952	CGC	2	6	42787	42792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042597
1091	NC_009952	TGG	2	6	42808	42813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042597
1092	NC_009952	TGT	2	6	42817	42822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159042597
1093	NC_009952	GAC	2	6	42891	42896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042597
1094	NC_009952	GGCG	2	8	42961	42968	0 %	0 %	75 %	25 %	159042597
1095	NC_009952	GC	3	6	43017	43022	0 %	0 %	50 %	50 %	159042597
1096	NC_009952	GGGC	2	8	43027	43034	0 %	0 %	75 %	25 %	159042597
1097	NC_009952	CCA	2	6	43049	43054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042597
1098	NC_009952	GGGC	2	8	43068	43075	0 %	0 %	75 %	25 %	159042597
1099	NC_009952	CG	4	8	43099	43106	0 %	0 %	50 %	50 %	159042597
1100	NC_009952	GCTG	2	8	43114	43121	0 %	25 %	50 %	25 %	159042597
1101	NC_009952	CGC	2	6	43243	43248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042598
1102	NC_009952	GCGG	2	8	43280	43287	0 %	0 %	75 %	25 %	159042598
1103	NC_009952	TTC	2	6	43322	43327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042598
1104	NC_009952	GCCT	2	8	43418	43425	0 %	25 %	25 %	50 %	159042598
1105	NC_009952	TCG	2	6	43434	43439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042598
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1107	NC_009952	CCG	2	6	43555	43560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042598
1108	NC_009952	TTG	2	6	43569	43574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159042598
1109	NC_009952	CCT	2	6	43648	43653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042598
1110	NC_009952	CGG	2	6	43750	43755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042598
1111	NC_009952	CGGC	2	8	43761	43768	0 %	0 %	50 %	50 %	159042598
1112	NC_009952	GCGG	2	8	43772	43779	0 %	0 %	75 %	25 %	159042598
1113	NC_009952	AAAAG	2	10	43849	43858	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009952	TCAA	2	8	43885	43892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_009952	GGT	2	6	43933	43938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042599
1116	NC_009952	GTC	3	9	43945	43953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042599
1117	NC_009952	GCC	2	6	43996	44001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042599
1118	NC_009952	GGT	2	6	44032	44037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042599
1119	NC_009952	GCC	2	6	44194	44199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042599
1120	NC_009952	CAC	2	6	44220	44225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042599
1121	NC_009952	TCG	2	6	44252	44257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042599
1122	NC_009952	CGA	2	6	44307	44312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042599
1123	NC_009952	CCG	2	6	44360	44365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042599
1124	NC_009952	ATG	2	6	44381	44386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042599
1125	NC_009952	GCC	2	6	44395	44400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042599
1126	NC_009952	CAACGC	2	12	44460	44471	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	159042599
1127	NC_009952	CGT	2	6	44472	44477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042599
1128	NC_009952	TGA	2	6	44562	44567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042599
1129	NC_009952	GTT	2	6	44584	44589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159042599
1130	NC_009952	GTCGGA	2	12	44614	44625	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159042599
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1139	NC_009952	GTG	2	6	45058	45063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1154	NC_009952	CCG	2	6	46074	46079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1157	NC_009952	CGGG	2	8	46124	46131	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1162	NC_009952	AAG	2	6	46495	46500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042602
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1165	NC_009952	TTG	2	6	46729	46734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1168	NC_009952	GCCG	2	8	46911	46918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1169	NC_009952	CAC	2	6	46922	46927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1171	NC_009952	GCC	2	6	46976	46981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1172	NC_009952	TCTT	2	8	47010	47017	0 %	75 %	0 %	25 %	159042603
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1237	NC_009952	CG	4	8	49916	49923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1238	NC_009952	GCC	2	6	50018	50023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042609
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1244	NC_009952	TGGC	2	8	50315	50322	0 %	25 %	50 %	25 %	159042609
1245	NC_009952	GCGCTG	2	12	50356	50367	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159042609
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1247	NC_009952	GCGG	2	8	50431	50438	0 %	0 %	75 %	25 %	159042609
1248	NC_009952	GGGCG	2	10	50452	50461	0 %	0 %	80 %	20 %	159042609
1249	NC_009952	GGC	3	9	50466	50474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042609
1250	NC_009952	GC	3	6	50517	50522	0 %	0 %	50 %	50 %	159042609
1251	NC_009952	GC	3	6	50573	50578	0 %	0 %	50 %	50 %	159042609
1252	NC_009952	GTC	2	6	50611	50616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042609
1253	NC_009952	GTG	2	6	50624	50629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042609
1254	NC_009952	CG	3	6	50631	50636	0 %	0 %	50 %	50 %	159042609
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1256	NC_009952	CG	3	6	50761	50766	0 %	0 %	50 %	50 %	159042609
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