MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfovibrio vulgaris DP4 plasmid pDVUL01

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008741	CCTGC	2	10	909	918	0 %	20 %	20 %	60 %	120586809
2	NC_008741	CGTGC	2	10	1071	1080	0 %	20 %	40 %	40 %	120586809
3	NC_008741	TCGTG	2	10	1829	1838	0 %	40 %	40 %	20 %	120586809
4	NC_008741	CCCAC	2	10	4353	4362	20 %	0 %	0 %	80 %	120586810
5	NC_008741	CGCAG	2	10	6250	6259	20 %	0 %	40 %	40 %	120586812
6	NC_008741	GGGGT	2	10	7789	7798	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008741	GGGCG	2	10	8971	8980	0 %	0 %	80 %	20 %	120586814
8	NC_008741	GCCGT	2	10	9802	9811	0 %	20 %	40 %	40 %	120586815
9	NC_008741	CCGCG	2	10	9975	9984	0 %	0 %	40 %	60 %	120586815
10	NC_008741	GGGGC	2	10	10214	10223	0 %	0 %	80 %	20 %	120586815
11	NC_008741	GCGGG	3	15	11652	11666	0 %	0 %	80 %	20 %	120586816
12	NC_008741	CGGGG	2	10	12287	12296	0 %	0 %	80 %	20 %	120586816
13	NC_008741	GACGA	2	10	13778	13787	40 %	0 %	40 %	20 %	120586816
14	NC_008741	CCATG	2	10	13834	13843	20 %	20 %	20 %	40 %	120586816
15	NC_008741	GCAGC	2	10	17424	17433	20 %	0 %	40 %	40 %	120586819
16	NC_008741	CGCCA	2	10	20129	20138	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_008741	TGCCG	2	10	22431	22440	0 %	20 %	40 %	40 %	120586820
18	NC_008741	ACGGT	2	10	23874	23883	20 %	20 %	40 %	20 %	120586822
19	NC_008741	GGGCA	2	10	24836	24845	20 %	0 %	60 %	20 %	120586822
20	NC_008741	ACGGC	2	10	25527	25536	20 %	0 %	40 %	40 %	120586822
21	NC_008741	CAAAT	2	10	25703	25712	60 %	20 %	0 %	20 %	120586822
22	NC_008741	GGGCT	2	10	26976	26985	0 %	20 %	60 %	20 %	120586823
23	NC_008741	GCTGC	2	10	27713	27722	0 %	20 %	40 %	40 %	120586823
24	NC_008741	CGTAT	2	10	31252	31261	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008741	AAGCC	2	10	33928	33937	40 %	0 %	20 %	40 %	120586827
26	NC_008741	GACCA	2	10	35498	35507	40 %	0 %	20 %	40 %	120586829
27	NC_008741	CGACA	2	10	38782	38791	40 %	0 %	20 %	40 %	120586832
28	NC_008741	CGGCA	2	10	38792	38801	20 %	0 %	40 %	40 %	120586832
29	NC_008741	TGTCC	2	10	39432	39441	0 %	40 %	20 %	40 %	120586832
30	NC_008741	TTGCG	2	10	40636	40645	0 %	40 %	40 %	20 %	120586833
31	NC_008741	TGCAC	2	10	41522	41531	20 %	20 %	20 %	40 %	120586833
32	NC_008741	TGGGC	2	10	42659	42668	0 %	20 %	60 %	20 %	120586833
33	NC_008741	CATCG	2	10	43664	43673	20 %	20 %	20 %	40 %	120586834
34	NC_008741	GCCGG	2	10	44700	44709	0 %	0 %	60 %	40 %	120586835
35	NC_008741	GCGTT	2	10	46486	46495	0 %	40 %	40 %	20 %	120586838
36	NC_008741	GGCGT	2	10	47274	47283	0 %	20 %	60 %	20 %	120586839
37	NC_008741	TCCGT	2	10	48718	48727	0 %	40 %	20 %	40 %	120586840
38	NC_008741	GCGCC	2	10	49646	49655	0 %	0 %	40 %	60 %	120586842
39	NC_008741	GGCGA	2	10	53079	53088	20 %	0 %	60 %	20 %	120586845
40	NC_008741	CCGGC	2	10	53865	53874	0 %	0 %	40 %	60 %	120586846
41	NC_008741	CGTGC	2	10	55601	55610	0 %	20 %	40 %	40 %	120586850
42	NC_008741	CGGGG	2	10	55635	55644	0 %	0 %	80 %	20 %	120586850
43	NC_008741	TGCCG	2	10	56124	56133	0 %	20 %	40 %	40 %	120586850
44	NC_008741	TGCGC	2	10	56399	56408	0 %	20 %	40 %	40 %	120586850
45	NC_008741	TGCCG	2	10	56766	56775	0 %	20 %	40 %	40 %	120586850
46	NC_008741	CGTGG	2	10	57029	57038	0 %	20 %	60 %	20 %	120586850
47	NC_008741	GTGGC	2	10	59287	59296	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008741	CCGCC	2	10	61587	61596	0 %	0 %	20 %	80 %	120586854
49	NC_008741	ATGCC	2	10	63118	63127	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_008741	ACGGT	2	10	63651	63660	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_008741	GCGTG	2	10	63789	63798	0 %	20 %	60 %	20 %	120586858
52	NC_008741	CCCGA	2	10	64138	64147	20 %	0 %	20 %	60 %	120586858
53	NC_008741	GACGG	2	10	64798	64807	20 %	0 %	60 %	20 %	120586858
54	NC_008741	GGCCC	2	10	65359	65368	0 %	0 %	40 %	60 %	120586860
55	NC_008741	GCGCA	2	10	66519	66528	20 %	0 %	40 %	40 %	120586862
56	NC_008741	GGTCT	2	10	66726	66735	0 %	40 %	40 %	20 %	120586862
57	NC_008741	GCGCG	2	10	68978	68987	0 %	0 %	60 %	40 %	120586864
58	NC_008741	GTGGC	2	10	69198	69207	0 %	20 %	60 %	20 %	120586864
59	NC_008741	AGGAC	2	10	70269	70278	40 %	0 %	40 %	20 %	120586865
60	NC_008741	GTGAC	2	10	75053	75062	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_008741	GCCGC	2	10	79141	79150	0 %	0 %	40 %	60 %	120586872
62	NC_008741	AGGGC	2	10	79544	79553	20 %	0 %	60 %	20 %	120586872
63	NC_008741	TGCGC	2	10	79887	79896	0 %	20 %	40 %	40 %	120586872
64	NC_008741	GTGGC	2	10	80381	80390	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008741	CGGGC	2	10	81564	81573	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_008741	CATCG	2	10	82387	82396	20 %	20 %	20 %	40 %	120586874
67	NC_008741	CACGG	2	10	83557	83566	20 %	0 %	40 %	40 %	120586875
68	NC_008741	ACGCC	2	10	85352	85361	20 %	0 %	20 %	60 %	120586876
69	NC_008741	ACGGC	2	10	87594	87603	20 %	0 %	40 %	40 %	120586877
70	NC_008741	GCCGC	2	10	88248	88257	0 %	0 %	40 %	60 %	120586878
71	NC_008741	CACCG	2	10	88823	88832	20 %	0 %	20 %	60 %	120586878
72	NC_008741	CAGTC	2	10	91082	91091	20 %	20 %	20 %	40 %	120586879
73	NC_008741	CGCGG	2	10	95064	95073	0 %	0 %	60 %	40 %	120586882
74	NC_008741	GGTCG	2	10	95990	95999	0 %	20 %	60 %	20 %	120586882
75	NC_008741	GCCGT	2	10	96369	96378	0 %	20 %	40 %	40 %	120586882
76	NC_008741	GGGGC	2	10	96558	96567	0 %	0 %	80 %	20 %	120586882
77	NC_008741	CCGGC	2	10	97200	97209	0 %	0 %	40 %	60 %	120586883
78	NC_008741	GGGCA	2	10	97258	97267	20 %	0 %	60 %	20 %	120586883
79	NC_008741	TGCAC	2	10	98666	98675	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_008741	ACGGC	2	10	100005	100014	20 %	0 %	40 %	40 %	120586886
81	NC_008741	CGCCT	2	10	100130	100139	0 %	20 %	20 %	60 %	120586886
82	NC_008741	ATGCC	2	10	100222	100231	20 %	20 %	20 %	40 %	120586886
83	NC_008741	CTTCT	2	10	101641	101650	0 %	60 %	0 %	40 %	120586887
84	NC_008741	GACGG	2	10	102916	102925	20 %	0 %	60 %	20 %	120586888
85	NC_008741	GGGGC	2	10	104143	104152	0 %	0 %	80 %	20 %	120586889
86	NC_008741	ACCTG	2	10	105624	105633	20 %	20 %	20 %	40 %	120586889
87	NC_008741	CCGGC	2	10	105981	105990	0 %	0 %	40 %	60 %	120586889
88	NC_008741	CACGA	2	10	106753	106762	40 %	0 %	20 %	40 %	120586890
89	NC_008741	CGCGC	2	10	106770	106779	0 %	0 %	40 %	60 %	120586890
90	NC_008741	GCTTC	2	10	108200	108209	0 %	40 %	20 %	40 %	120586891
91	NC_008741	ACGCC	2	10	110095	110104	20 %	0 %	20 %	60 %	120586892
92	NC_008741	TTCGC	2	10	110221	110230	0 %	40 %	20 %	40 %	120586892
93	NC_008741	GCACC	2	10	111440	111449	20 %	0 %	20 %	60 %	120586892
94	NC_008741	TCCGT	2	10	112189	112198	0 %	40 %	20 %	40 %	120586893
95	NC_008741	ACTCG	2	10	114355	114364	20 %	20 %	20 %	40 %	120586894
96	NC_008741	TTCGG	2	10	115928	115937	0 %	40 %	40 %	20 %	120586895
97	NC_008741	CATGC	2	10	117059	117068	20 %	20 %	20 %	40 %	120586896
98	NC_008741	CTGCC	2	10	117434	117443	0 %	20 %	20 %	60 %	120586896
99	NC_008741	GCATC	2	10	117636	117645	20 %	20 %	20 %	40 %	120586896
100	NC_008741	GCATC	2	10	117726	117735	20 %	20 %	20 %	40 %	120586896
101	NC_008741	CCGCG	2	10	118553	118562	0 %	0 %	40 %	60 %	120586896
102	NC_008741	GGTGC	2	10	120093	120102	0 %	20 %	60 %	20 %	120586897
103	NC_008741	GCCGC	2	10	121402	121411	0 %	0 %	40 %	60 %	120586898
104	NC_008741	CCGTC	2	10	121843	121852	0 %	20 %	20 %	60 %	120586898
105	NC_008741	GCCCC	2	10	122506	122515	0 %	0 %	20 %	80 %	120586898
106	NC_008741	TTCCC	2	10	122716	122725	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_008741	GCCGT	2	10	122757	122766	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_008741	GGCGT	2	10	123726	123735	0 %	20 %	60 %	20 %	120586899
109	NC_008741	CGCCC	2	10	124535	124544	0 %	0 %	20 %	80 %	120586900
110	NC_008741	CCTGC	2	10	125333	125342	0 %	20 %	20 %	60 %	120586900
111	NC_008741	GGTAC	2	10	126373	126382	20 %	20 %	40 %	20 %	120586901
112	NC_008741	GCGTG	2	10	127028	127037	0 %	20 %	60 %	20 %	120586902
113	NC_008741	AGCCA	2	10	127310	127319	40 %	0 %	20 %	40 %	120586902
114	NC_008741	GCCCC	2	10	128941	128950	0 %	0 %	20 %	80 %	120586903
115	NC_008741	AGCGC	2	10	129154	129163	20 %	0 %	40 %	40 %	120586903
116	NC_008741	CGTGC	2	10	131800	131809	0 %	20 %	40 %	40 %	120586905
117	NC_008741	CGGAA	2	10	133056	133065	40 %	0 %	40 %	20 %	120586905
118	NC_008741	GCCCT	2	10	133195	133204	0 %	20 %	20 %	60 %	120586905
119	NC_008741	CCTGC	2	10	135785	135794	0 %	20 %	20 %	60 %	120586907
120	NC_008741	CCCGT	2	10	139022	139031	0 %	20 %	20 %	60 %	120586911
121	NC_008741	CACGC	2	10	139095	139104	20 %	0 %	20 %	60 %	120586911
122	NC_008741	CGCGC	2	10	141002	141011	0 %	0 %	40 %	60 %	120586912
123	NC_008741	AGCGC	2	10	141447	141456	20 %	0 %	40 %	40 %	120586913
124	NC_008741	TGCGG	2	10	141806	141815	0 %	20 %	60 %	20 %	120586913
125	NC_008741	GTCTC	2	10	142460	142469	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_008741	ACCCC	2	10	143880	143889	20 %	0 %	0 %	80 %	120586914
127	NC_008741	GGGAC	2	10	144358	144367	20 %	0 %	60 %	20 %	120586915
128	NC_008741	GCGCG	2	10	145513	145522	0 %	0 %	60 %	40 %	120586916
129	NC_008741	TGCCG	2	10	146001	146010	0 %	20 %	40 %	40 %	120586916
130	NC_008741	CACGG	2	10	147328	147337	20 %	0 %	40 %	40 %	120586917
131	NC_008741	CGCGG	2	10	147685	147694	0 %	0 %	60 %	40 %	120586917
132	NC_008741	GGCAG	2	10	148239	148248	20 %	0 %	60 %	20 %	120586918
133	NC_008741	GCCCT	2	10	148933	148942	0 %	20 %	20 %	60 %	120586918
134	NC_008741	GCCGG	2	10	149044	149053	0 %	0 %	60 %	40 %	120586918
135	NC_008741	GTGCC	2	10	149660	149669	0 %	20 %	40 %	40 %	120586918
136	NC_008741	CGAGA	2	10	150659	150668	40 %	0 %	40 %	20 %	120586919
137	NC_008741	CCCAG	2	10	151568	151577	20 %	0 %	20 %	60 %	120586920
138	NC_008741	TCCCC	2	10	151748	151757	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
139	NC_008741	CCGCA	2	10	152315	152324	20 %	0 %	20 %	60 %	120586921
140	NC_008741	CCCGA	2	10	152630	152639	20 %	0 %	20 %	60 %	120586921
141	NC_008741	GCCGT	2	10	153108	153117	0 %	20 %	40 %	40 %	120586921
142	NC_008741	GGCGA	2	10	155929	155938	20 %	0 %	60 %	20 %	120586924
143	NC_008741	GTACC	2	10	159508	159517	20 %	20 %	20 %	40 %	120586926
144	NC_008741	CGCCC	2	10	161055	161064	0 %	0 %	20 %	80 %	120586927
145	NC_008741	CGCTG	2	10	161526	161535	0 %	20 %	40 %	40 %	120586927
146	NC_008741	TGCGC	2	10	161565	161574	0 %	20 %	40 %	40 %	120586927
147	NC_008741	ACGGG	2	10	162567	162576	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
148	NC_008741	CGGGC	2	10	162714	162723	0 %	0 %	60 %	40 %	120586928
149	NC_008741	TGCAT	2	10	163090	163099	20 %	40 %	20 %	20 %	120586928
150	NC_008741	CTGCA	2	10	165605	165614	20 %	20 %	20 %	40 %	120586929
151	NC_008741	GCGCA	2	10	165782	165791	20 %	0 %	40 %	40 %	120586929
152	NC_008741	CGAGG	2	10	166725	166734	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
153	NC_008741	CGGCA	2	10	168594	168603	20 %	0 %	40 %	40 %	120586931
154	NC_008741	CCGCG	2	10	170234	170243	0 %	0 %	40 %	60 %	120586932
155	NC_008741	GGGCG	2	10	170596	170605	0 %	0 %	80 %	20 %	120586933
156	NC_008741	CGTGG	2	10	170746	170755	0 %	20 %	60 %	20 %	120586933
157	NC_008741	TGGCG	2	10	170963	170972	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
158	NC_008741	GGCAA	2	10	171194	171203	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_008741	ACTAT	2	10	172475	172484	40 %	40 %	0 %	20 %	120586936
160	NC_008741	TGCCC	2	10	173935	173944	0 %	20 %	20 %	60 %	120586936
161	NC_008741	GGCGC	2	10	173956	173965	0 %	0 %	60 %	40 %	120586936
162	NC_008741	GGCGT	2	10	176074	176083	0 %	20 %	60 %	20 %	120586939
163	NC_008741	CGCGC	2	10	176683	176692	0 %	0 %	40 %	60 %	120586939
164	NC_008741	CTGCC	2	10	180633	180642	0 %	20 %	20 %	60 %	120586943
165	NC_008741	GTCGA	2	10	180751	180760	20 %	20 %	40 %	20 %	120586943
166	NC_008741	CCCCG	2	10	180833	180842	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
167	NC_008741	CCCGC	2	10	181016	181025	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
168	NC_008741	TCTCG	2	10	185899	185908	0 %	40 %	20 %	40 %	120586948
169	NC_008741	CCCCG	2	10	186893	186902	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
170	NC_008741	CACGC	2	10	186914	186923	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
171	NC_008741	GACAG	2	10	187141	187150	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
172	NC_008741	GACAG	2	10	187155	187164	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
173	NC_008741	GTGCA	2	10	188182	188191	20 %	20 %	40 %	20 %	120586950
174	NC_008741	GCCGG	2	10	190853	190862	0 %	0 %	60 %	40 %	120586952
175	NC_008741	GTTTT	2	10	193468	193477	0 %	80 %	20 %	0 %	120586953
176	NC_008741	AGATA	2	10	193577	193586	60 %	20 %	20 %	0 %	120586953
177	NC_008741	TCCCT	2	10	196186	196195	0 %	40 %	0 %	60 %	120586956
178	NC_008741	GCATC	2	10	196222	196231	20 %	20 %	20 %	40 %	120586956
179	NC_008741	ACCTG	2	10	196308	196317	20 %	20 %	20 %	40 %	120586956
180	NC_008741	GCACA	2	10	197229	197238	40 %	0 %	20 %	40 %	120586957
181	NC_008741	TCGCG	2	10	198014	198023	0 %	20 %	40 %	40 %	120586958
182	NC_008741	TGCGC	2	10	198038	198047	0 %	20 %	40 %	40 %	120586958
183	NC_008741	ACCCA	2	10	198412	198421	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.