MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfovibrio alaskensis G20 chromosome

Total Repeats: 2658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007519	CATGC	2	10	141	150	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_007519	TGCCC	2	10	4005	4014	0 %	20 %	20 %	60 %	78355050
3	NC_007519	CCGCG	2	10	5134	5143	0 %	0 %	40 %	60 %	78355050
4	NC_007519	CGCGG	2	10	6722	6731	0 %	0 %	60 %	40 %	78355051
5	NC_007519	GGTGT	2	10	11095	11104	0 %	40 %	60 %	0 %	78355058
6	NC_007519	TCCGG	2	10	13886	13895	0 %	20 %	40 %	40 %	78355060
7	NC_007519	CGTGC	2	10	15287	15296	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_007519	CCGGA	2	10	15384	15393	20 %	0 %	40 %	40 %	78355062
9	NC_007519	GGTAT	2	10	16710	16719	20 %	40 %	40 %	0 %	78355064
10	NC_007519	ATGGA	2	10	17995	18004	40 %	20 %	40 %	0 %	347359724
11	NC_007519	CCGGG	2	10	19446	19455	0 %	0 %	60 %	40 %	78355068
12	NC_007519	CATTA	2	10	20199	20208	40 %	40 %	0 %	20 %	78355069
13	NC_007519	CCGCC	2	10	21556	21565	0 %	0 %	20 %	80 %	78355071
14	NC_007519	GTGCA	2	10	24934	24943	20 %	20 %	40 %	20 %	78355077
15	NC_007519	GATGG	2	10	26807	26816	20 %	20 %	60 %	0 %	347359725
16	NC_007519	GCATG	2	10	27739	27748	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007519	TGGCA	2	10	30218	30227	20 %	20 %	40 %	20 %	78355084
18	NC_007519	CTGAC	2	10	30449	30458	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_007519	GGCAT	2	10	30646	30655	20 %	20 %	40 %	20 %	78355085
20	NC_007519	CCTGC	2	10	31344	31353	0 %	20 %	20 %	60 %	78355085
21	NC_007519	CCTGC	2	10	32135	32144	0 %	20 %	20 %	60 %	78355086
22	NC_007519	CTTTT	2	10	34716	34725	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007519	TGCCC	2	10	38760	38769	0 %	20 %	20 %	60 %	78355095
24	NC_007519	CGTCT	2	10	39426	39435	0 %	40 %	20 %	40 %	78355095
25	NC_007519	AACCC	2	10	40032	40041	40 %	0 %	0 %	60 %	347359728
26	NC_007519	AGAAT	2	10	41197	41206	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007519	TTTTG	2	10	41525	41534	0 %	80 %	20 %	0 %	78355100
28	NC_007519	ATGCC	2	10	44092	44101	20 %	20 %	20 %	40 %	78355101
29	NC_007519	GGAAA	2	10	45578	45587	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007519	TGCCG	2	10	45614	45623	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_007519	CGCAG	2	10	45928	45937	20 %	0 %	40 %	40 %	78355103
32	NC_007519	AGAAC	2	10	47225	47234	60 %	0 %	20 %	20 %	78355104
33	NC_007519	TTTCA	2	10	51127	51136	20 %	60 %	0 %	20 %	78355107
34	NC_007519	ATAAA	2	10	51500	51509	80 %	20 %	0 %	0 %	78355107
35	NC_007519	TGCAG	2	10	51683	51692	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007519	CTGCC	2	10	53330	53339	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_007519	TTGCG	2	10	54405	54414	0 %	40 %	40 %	20 %	78355110
38	NC_007519	AGCGC	2	10	55434	55443	20 %	0 %	40 %	40 %	78355111
39	NC_007519	GGCCG	2	10	55663	55672	0 %	0 %	60 %	40 %	78355111
40	NC_007519	ATTTT	2	10	57486	57495	20 %	80 %	0 %	0 %	78355113
41	NC_007519	GCGGT	2	10	58670	58679	0 %	20 %	60 %	20 %	78355113
42	NC_007519	GAAGT	2	10	59611	59620	40 %	20 %	40 %	0 %	347359730
43	NC_007519	ATGTC	2	10	59873	59882	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007519	CGGCG	2	10	60952	60961	0 %	0 %	60 %	40 %	78355117
45	NC_007519	GACAG	2	10	61511	61520	40 %	0 %	40 %	20 %	78355117
46	NC_007519	GGTCT	2	10	61830	61839	0 %	40 %	40 %	20 %	78355117
47	NC_007519	GCCGT	2	10	65819	65828	0 %	20 %	40 %	40 %	78355123
48	NC_007519	GCGGG	2	10	66117	66126	0 %	0 %	80 %	20 %	78355123
49	NC_007519	CCTGC	2	10	67143	67152	0 %	20 %	20 %	60 %	78355124
50	NC_007519	CTGTC	2	10	67864	67873	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_007519	GTCAG	2	10	67907	67916	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007519	GCTAG	2	10	70493	70502	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007519	ACCGT	2	10	73462	73471	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_007519	AAGAT	2	10	74636	74645	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007519	ACTGC	2	10	77878	77887	20 %	20 %	20 %	40 %	78355131
56	NC_007519	TGAAA	2	10	79422	79431	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007519	CCAGA	2	10	80792	80801	40 %	0 %	20 %	40 %	78355134
58	NC_007519	CGTCC	2	10	83348	83357	0 %	20 %	20 %	60 %	78355137
59	NC_007519	TGACC	2	10	86158	86167	20 %	20 %	20 %	40 %	78355140
60	NC_007519	GCGCA	2	10	86888	86897	20 %	0 %	40 %	40 %	78355142
61	NC_007519	AAGAC	2	10	88357	88366	60 %	0 %	20 %	20 %	78355144
62	NC_007519	CCGTG	2	10	92646	92655	0 %	20 %	40 %	40 %	78355149
63	NC_007519	CCTTT	2	10	93436	93445	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_007519	GCGCA	2	10	94607	94616	20 %	0 %	40 %	40 %	78355151
65	NC_007519	GCAGA	2	10	95112	95121	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007519	TTTCT	2	10	95217	95226	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007519	GAATA	2	10	95543	95552	60 %	20 %	20 %	0 %	78355153
68	NC_007519	CCGTG	2	10	98025	98034	0 %	20 %	40 %	40 %	78355154
69	NC_007519	CGTTG	2	10	101743	101752	0 %	40 %	40 %	20 %	78355157
70	NC_007519	TTCCG	2	10	101780	101789	0 %	40 %	20 %	40 %	78355157
71	NC_007519	ACTGT	2	10	103604	103613	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_007519	TTGAT	2	10	104500	104509	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007519	TGGGC	2	10	105601	105610	0 %	20 %	60 %	20 %	78355160
74	NC_007519	GCGCT	2	10	106494	106503	0 %	20 %	40 %	40 %	78355160
75	NC_007519	CTGCC	2	10	106730	106739	0 %	20 %	20 %	60 %	78355160
76	NC_007519	CAAAG	2	10	107924	107933	60 %	0 %	20 %	20 %	78355162
77	NC_007519	GGCAG	2	10	109016	109025	20 %	0 %	60 %	20 %	78355163
78	NC_007519	TCTGT	2	10	112673	112682	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007519	GTTTT	2	10	115243	115252	0 %	80 %	20 %	0 %	78355169
80	NC_007519	CTGGT	2	10	116898	116907	0 %	40 %	40 %	20 %	347359732
81	NC_007519	CCGCA	2	10	117770	117779	20 %	0 %	20 %	60 %	347359733
82	NC_007519	GCGCC	2	10	118023	118032	0 %	0 %	40 %	60 %	347359733
83	NC_007519	GCCGT	2	10	118657	118666	0 %	20 %	40 %	40 %	78355174
84	NC_007519	GTATG	2	10	119577	119586	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007519	TGCAC	2	10	126237	126246	20 %	20 %	20 %	40 %	78355183
86	NC_007519	CACCG	2	10	126715	126724	20 %	0 %	20 %	60 %	78355183
87	NC_007519	GCGCC	2	10	127638	127647	0 %	0 %	40 %	60 %	78355183
88	NC_007519	CGCGG	2	10	127723	127732	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_007519	AAAAT	2	10	127897	127906	80 %	20 %	0 %	0 %	78355184
90	NC_007519	AAACC	2	10	129283	129292	60 %	0 %	0 %	40 %	78355185
91	NC_007519	GGCCG	2	10	133410	133419	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_007519	GCCAG	2	10	136338	136347	20 %	0 %	40 %	40 %	78355194
93	NC_007519	TGGAA	2	10	138932	138941	40 %	20 %	40 %	0 %	347359735
94	NC_007519	AACAG	2	10	140854	140863	60 %	0 %	20 %	20 %	78355200
95	NC_007519	GCAGC	2	10	141848	141857	20 %	0 %	40 %	40 %	78355201
96	NC_007519	CGGGG	2	10	143066	143075	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007519	TACGC	2	10	144217	144226	20 %	20 %	20 %	40 %	78355204
98	NC_007519	GCCGT	2	10	144916	144925	0 %	20 %	40 %	40 %	78355205
99	NC_007519	TGCCG	2	10	146636	146645	0 %	20 %	40 %	40 %	78355207
100	NC_007519	AAGAC	2	10	151805	151814	60 %	0 %	20 %	20 %	347359737
101	NC_007519	TTGAA	2	10	151889	151898	40 %	40 %	20 %	0 %	347359737
102	NC_007519	CCGGT	2	10	152825	152834	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_007519	AGAAA	2	10	153106	153115	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007519	GTGCG	2	10	154176	154185	0 %	20 %	60 %	20 %	78355218
105	NC_007519	CATCC	2	10	154937	154946	20 %	20 %	0 %	60 %	78355218
106	NC_007519	CCTGC	2	10	156295	156304	0 %	20 %	20 %	60 %	78355220
107	NC_007519	TCCCA	2	10	157140	157149	20 %	20 %	0 %	60 %	78355220
108	NC_007519	CCGGG	2	10	158095	158104	0 %	0 %	60 %	40 %	78355220
109	NC_007519	GCCCC	2	10	159634	159643	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
110	NC_007519	GGTAT	2	10	160788	160797	20 %	40 %	40 %	0 %	78355222
111	NC_007519	GCCGG	2	10	161105	161114	0 %	0 %	60 %	40 %	78355222
112	NC_007519	GCGAG	2	10	161526	161535	20 %	0 %	60 %	20 %	78355222
113	NC_007519	GGATG	2	10	162831	162840	20 %	20 %	60 %	0 %	78355223
114	NC_007519	CTGGC	2	10	163509	163518	0 %	20 %	40 %	40 %	78355224
115	NC_007519	GCCGT	2	10	165359	165368	0 %	20 %	40 %	40 %	78355226
116	NC_007519	GCACG	2	10	166775	166784	20 %	0 %	40 %	40 %	78355227
117	NC_007519	TGTCG	2	10	169200	169209	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_007519	GCACA	2	10	169627	169636	40 %	0 %	20 %	40 %	347359741
119	NC_007519	AGAAA	2	10	171144	171153	80 %	0 %	20 %	0 %	78355232
120	NC_007519	CTGAC	2	10	172072	172081	20 %	20 %	20 %	40 %	78355233
121	NC_007519	TCCAT	2	10	172208	172217	20 %	40 %	0 %	40 %	78355233
122	NC_007519	CCGGA	2	10	177803	177812	20 %	0 %	40 %	40 %	78355240
123	NC_007519	AAGAC	2	10	182428	182437	60 %	0 %	20 %	20 %	78355248
124	NC_007519	CGCTG	2	10	185770	185779	0 %	20 %	40 %	40 %	78355253
125	NC_007519	GTTCC	2	10	185911	185920	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_007519	TGCGC	2	10	185961	185970	0 %	20 %	40 %	40 %	78355254
127	NC_007519	CGTGC	2	10	187051	187060	0 %	20 %	40 %	40 %	78355255
128	NC_007519	GGCGG	2	10	188628	188637	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007519	CTGCG	2	10	188643	188652	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_007519	GGTTT	2	10	188760	188769	0 %	60 %	40 %	0 %	78355256
131	NC_007519	TCGGT	2	10	189937	189946	0 %	40 %	40 %	20 %	78355257
132	NC_007519	ACGCC	2	10	191462	191471	20 %	0 %	20 %	60 %	78355258
133	NC_007519	CTGCG	2	10	191485	191494	0 %	20 %	40 %	40 %	78355258
134	NC_007519	CGTCA	2	10	191607	191616	20 %	20 %	20 %	40 %	78355258
135	NC_007519	GATGT	2	10	191986	191995	20 %	40 %	40 %	0 %	78355258
136	NC_007519	GGCAT	2	10	192298	192307	20 %	20 %	40 %	20 %	78355258
137	NC_007519	CCTGA	2	10	194268	194277	20 %	20 %	20 %	40 %	78355260
138	NC_007519	CCATG	2	10	195357	195366	20 %	20 %	20 %	40 %	78355261
139	NC_007519	TGCCG	2	10	195455	195464	0 %	20 %	40 %	40 %	78355261
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181	NC_007519	GCCGC	2	10	238735	238744	0 %	0 %	40 %	60 %	304570576
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268	NC_007519	TCCCC	2	10	346614	346623	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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402	NC_007519	CTGTG	2	10	523382	523391	0 %	40 %	40 %	20 %	78355561
403	NC_007519	TCGTT	2	10	524726	524735	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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