MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 25647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007356	CT	3	6	156668	156673	0 %	50 %	0 %	50 %	73748097
3002	NC_007356	TGG	2	6	156759	156764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748097
3003	NC_007356	GGT	2	6	156874	156879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748097
3004	NC_007356	ATT	2	6	156957	156962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748098
3005	NC_007356	CGG	2	6	157016	157021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748098
3006	NC_007356	GGA	2	6	157058	157063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748098
3007	NC_007356	TGG	2	6	157093	157098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748098
3008	NC_007356	GGC	2	6	157109	157114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748098
3009	NC_007356	AT	3	6	157169	157174	50 %	50 %	0 %	0 %	73748098
3010	NC_007356	TAT	2	6	157262	157267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748098
3011	NC_007356	GGTA	2	8	157280	157287	25 %	25 %	50 %	0 %	73748098
3012	NC_007356	CAC	2	6	157553	157558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748098
3013	NC_007356	CAA	2	6	157562	157567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73748098
3014	NC_007356	CTTG	2	8	157730	157737	0 %	50 %	25 %	25 %	73748098
3015	NC_007356	G	8	8	157743	157750	0 %	0 %	100 %	0 %	73748098
3016	NC_007356	CTT	2	6	157931	157936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748098
3017	NC_007356	TGA	2	6	157937	157942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748098
3018	NC_007356	CCG	2	6	157982	157987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748098
3019	NC_007356	GGC	2	6	157988	157993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748098
3020	NC_007356	AGG	2	6	158170	158175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748098
3021	NC_007356	GCC	2	6	158246	158251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748099
3022	NC_007356	CAATAT	2	12	158260	158271	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73748099
3023	NC_007356	CCG	2	6	158419	158424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748099
3024	NC_007356	CTG	2	6	158450	158455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748099
3025	NC_007356	TTG	2	6	158507	158512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748099
3026	NC_007356	GAA	2	6	158552	158557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748099
3027	NC_007356	ATA	2	6	158583	158588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748099
3028	NC_007356	TAAA	2	8	158688	158695	75 %	25 %	0 %	0 %	73748099
3029	NC_007356	TGG	2	6	158709	158714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748099
3030	NC_007356	GGTG	2	8	158785	158792	0 %	25 %	75 %	0 %	73748099
3031	NC_007356	CGG	2	6	158808	158813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748099
3032	NC_007356	GGC	2	6	158827	158832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748099
3033	NC_007356	GTT	2	6	158858	158863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748099
3034	NC_007356	GCTTG	2	10	158902	158911	0 %	40 %	40 %	20 %	73748099
3035	NC_007356	CTGAC	2	10	158997	159006	20 %	20 %	20 %	40 %	73748099
3036	NC_007356	TGG	2	6	159030	159035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748099
3037	NC_007356	AGG	2	6	159045	159050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748099
3038	NC_007356	G	6	6	159049	159054	0 %	0 %	100 %	0 %	73748099
3039	NC_007356	CCT	2	6	159072	159077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73748099
3040	NC_007356	TAT	2	6	159110	159115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748099
3041	NC_007356	TCC	2	6	159137	159142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73748099
3042	NC_007356	C	6	6	159150	159155	0 %	0 %	0 %	100 %	73748099
3043	NC_007356	TAT	2	6	159185	159190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748099
3044	NC_007356	AGGC	2	8	159198	159205	25 %	0 %	50 %	25 %	73748099
3045	NC_007356	AAG	2	6	159254	159259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748099
3046	NC_007356	ATGA	2	8	159281	159288	50 %	25 %	25 %	0 %	73748099
3047	NC_007356	GAA	2	6	159380	159385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748099
3048	NC_007356	GGTAGC	2	12	159583	159594	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	73748099
3049	NC_007356	CGG	2	6	159682	159687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748099
3050	NC_007356	CGG	2	6	159694	159699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748099
3051	NC_007356	GGC	2	6	159701	159706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748099
3052	NC_007356	GAA	2	6	159733	159738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748099
3053	NC_007356	A	6	6	159737	159742	100 %	0 %	0 %	0 %	73748099
3054	NC_007356	GAA	2	6	159761	159766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748099
3055	NC_007356	CCA	2	6	159793	159798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748099
3056	NC_007356	AT	3	6	159818	159823	50 %	50 %	0 %	0 %	73748099
3057	NC_007356	ATA	2	6	159911	159916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_007356	GGA	2	6	159929	159934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_007356	AAAT	2	8	159938	159945	75 %	25 %	0 %	0 %	73748100
3060	NC_007356	GCC	2	6	160019	160024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748100
3061	NC_007356	C	6	6	160023	160028	0 %	0 %	0 %	100 %	73748100
3062	NC_007356	TCA	2	6	160191	160196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748100
3063	NC_007356	CTG	2	6	160211	160216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748100
3064	NC_007356	CTGG	2	8	160252	160259	0 %	25 %	50 %	25 %	73748100
3065	NC_007356	ATG	2	6	160364	160369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748100
3066	NC_007356	AAG	2	6	160436	160441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748100
3067	NC_007356	GTAA	2	8	160463	160470	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_007356	GTA	2	6	160550	160555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748101
3069	NC_007356	CAG	2	6	160588	160593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748101
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3071	NC_007356	A	6	6	160619	160624	100 %	0 %	0 %	0 %	73748101
3072	NC_007356	AT	4	8	160636	160643	50 %	50 %	0 %	0 %	73748101
3073	NC_007356	GGCA	2	8	160651	160658	25 %	0 %	50 %	25 %	73748101
3074	NC_007356	GTTC	2	8	160730	160737	0 %	50 %	25 %	25 %	73748102
3075	NC_007356	AAT	2	6	160851	160856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748102
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3079	NC_007356	TAA	2	6	161060	161065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748102
3080	NC_007356	TAA	2	6	161072	161077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748102
3081	NC_007356	CGG	2	6	161129	161134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748102
3082	NC_007356	CAT	2	6	161135	161140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748102
3083	NC_007356	GCC	2	6	161175	161180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748102
3084	NC_007356	AT	3	6	161260	161265	50 %	50 %	0 %	0 %	73748102
3085	NC_007356	TCTG	2	8	161346	161353	0 %	50 %	25 %	25 %	73748102
3086	NC_007356	TCT	2	6	161518	161523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748103
3087	NC_007356	CTGCTT	2	12	161528	161539	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	73748103
3088	NC_007356	TCT	2	6	161566	161571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748103
3089	NC_007356	TTCA	2	8	161574	161581	25 %	50 %	0 %	25 %	73748103
3090	NC_007356	TCA	2	6	161617	161622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748103
3091	NC_007356	CCATGC	2	12	161672	161683	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	73748103
3092	NC_007356	CTT	2	6	161744	161749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748103
3093	NC_007356	TCC	2	6	161784	161789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_007356	ATA	2	6	161795	161800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_007356	AAT	2	6	161878	161883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_007356	GAA	2	6	161894	161899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_007356	TATG	2	8	161941	161948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_007356	GCC	2	6	161972	161977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_007356	TA	3	6	161981	161986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_007356	AGG	2	6	161989	161994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_007356	GGT	2	6	162137	162142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748104
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3103	NC_007356	GTCC	2	8	162453	162460	0 %	25 %	25 %	50 %	73748104
3104	NC_007356	TGG	2	6	162557	162562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748104
3105	NC_007356	T	7	7	162672	162678	0 %	100 %	0 %	0 %	73748104
3106	NC_007356	T	7	7	162740	162746	0 %	100 %	0 %	0 %	73748105
3107	NC_007356	TAACA	2	10	162762	162771	60 %	20 %	0 %	20 %	73748105
3108	NC_007356	AAT	2	6	162852	162857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748105
3109	NC_007356	GAA	2	6	162931	162936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748105
3110	NC_007356	ACT	2	6	162955	162960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748105
3111	NC_007356	CAG	2	6	162963	162968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748105
3112	NC_007356	ATC	2	6	162973	162978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748105
3113	NC_007356	AGT	2	6	162984	162989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748105
3114	NC_007356	AAAG	2	8	163041	163048	75 %	0 %	25 %	0 %	73748105
3115	NC_007356	GGC	2	6	163106	163111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748105
3116	NC_007356	AAT	2	6	163113	163118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748105
3117	NC_007356	GGT	2	6	163128	163133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748105
3118	NC_007356	TGG	2	6	163139	163144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748105
3119	NC_007356	CACC	2	8	163181	163188	25 %	0 %	0 %	75 %	73748105
3120	NC_007356	GTG	2	6	163192	163197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748105
3121	NC_007356	GCC	2	6	163228	163233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748105
3122	NC_007356	TA	3	6	163278	163283	50 %	50 %	0 %	0 %	73748105
3123	NC_007356	CTA	2	6	163295	163300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748105
3124	NC_007356	CCA	2	6	163385	163390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748105
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3126	NC_007356	GCA	2	6	163558	163563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748105
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3247	NC_007356	TA	3	6	169952	169957	50 %	50 %	0 %	0 %	73748112
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