MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 25647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_007356	ATG	2	6	77829	77834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748031
1503	NC_007356	TCT	2	6	77994	77999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748031
1504	NC_007356	TTTATC	2	12	78033	78044	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73748031
1505	NC_007356	AAG	2	6	78111	78116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748031
1506	NC_007356	TGT	2	6	78214	78219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748031
1507	NC_007356	TGA	2	6	78352	78357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748031
1508	NC_007356	CTT	2	6	78487	78492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748031
1509	NC_007356	GGT	2	6	78509	78514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748031
1510	NC_007356	GCA	2	6	78556	78561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748031
1511	NC_007356	TTGGA	2	10	78576	78585	20 %	40 %	40 %	0 %	73748031
1512	NC_007356	CGG	2	6	78662	78667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748031
1513	NC_007356	CGG	2	6	78727	78732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748031
1514	NC_007356	TC	3	6	78827	78832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_007356	C	6	6	78962	78967	0 %	0 %	0 %	100 %	73748032
1516	NC_007356	TCT	2	6	79049	79054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748032
1517	NC_007356	AGG	2	6	79087	79092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748032
1518	NC_007356	T	6	6	79128	79133	0 %	100 %	0 %	0 %	73748032
1519	NC_007356	GAT	2	6	79212	79217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748032
1520	NC_007356	CA	3	6	79238	79243	50 %	0 %	0 %	50 %	73748032
1521	NC_007356	CCGC	2	8	79352	79359	0 %	0 %	25 %	75 %	73748032
1522	NC_007356	GTG	2	6	79536	79541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748032
1523	NC_007356	AG	3	6	79604	79609	50 %	0 %	50 %	0 %	73748033
1524	NC_007356	TCA	2	6	79701	79706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748033
1525	NC_007356	CAGC	2	8	79856	79863	25 %	0 %	25 %	50 %	73748033
1526	NC_007356	CGG	2	6	80100	80105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748033
1527	NC_007356	ATC	2	6	80120	80125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748033
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1529	NC_007356	TGA	2	6	80230	80235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748033
1530	NC_007356	TCA	2	6	80332	80337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748033
1531	NC_007356	TGTA	2	8	80348	80355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_007356	CCCCTT	2	12	80381	80392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_007356	CTT	2	6	80425	80430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748034
1534	NC_007356	CCAAT	2	10	80449	80458	40 %	20 %	0 %	40 %	73748034
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1542	NC_007356	AAG	2	6	80997	81002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748035
1543	NC_007356	ACC	2	6	81073	81078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748035
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1545	NC_007356	CATA	2	8	81126	81133	50 %	25 %	0 %	25 %	73748035
1546	NC_007356	ACTCC	2	10	81167	81176	20 %	20 %	0 %	60 %	73748035
1547	NC_007356	ACCAG	2	10	81235	81244	40 %	0 %	20 %	40 %	73748035
1548	NC_007356	AT	3	6	81257	81262	50 %	50 %	0 %	0 %	73748035
1549	NC_007356	CTTGG	2	10	81327	81336	0 %	40 %	40 %	20 %	73748035
1550	NC_007356	TTG	2	6	81340	81345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748035
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1555	NC_007356	C	6	6	81525	81530	0 %	0 %	0 %	100 %	73748035
1556	NC_007356	CAT	2	6	81573	81578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748035
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1559	NC_007356	ACC	2	6	81649	81654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748035
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1563	NC_007356	TCTG	2	8	81909	81916	0 %	50 %	25 %	25 %	73748035
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1572	NC_007356	TC	3	6	82269	82274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_007356	CCT	2	6	82299	82304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_007356	TGG	2	6	82317	82322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748036
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1594	NC_007356	GA	3	6	83138	83143	50 %	0 %	50 %	0 %	73748037
1595	NC_007356	TA	3	6	83223	83228	50 %	50 %	0 %	0 %	73748037
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1599	NC_007356	CTT	2	6	83451	83456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748037
1600	NC_007356	TTG	2	6	83464	83469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748037
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1609	NC_007356	TTG	2	6	83980	83985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748038
1610	NC_007356	GT	3	6	83989	83994	0 %	50 %	50 %	0 %	73748038
1611	NC_007356	TTG	2	6	84077	84082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748038
1612	NC_007356	ACT	2	6	84145	84150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748038
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1617	NC_007356	A	6	6	84331	84336	100 %	0 %	0 %	0 %	73748039
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1623	NC_007356	TAAA	2	8	84736	84743	75 %	25 %	0 %	0 %	73748039
1624	NC_007356	ACA	2	6	84794	84799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73748039
1625	NC_007356	A	6	6	84807	84812	100 %	0 %	0 %	0 %	73748039
1626	NC_007356	CAA	2	6	84820	84825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73748039
1627	NC_007356	TAAC	2	8	84960	84967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1628	NC_007356	CCA	2	6	85011	85016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1889	NC_007356	AGC	2	6	100120	100125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748049
1890	NC_007356	GA	3	6	100220	100225	50 %	0 %	50 %	0 %	73748049
1891	NC_007356	TAC	2	6	100234	100239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748049
1892	NC_007356	TAA	2	6	100263	100268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748049
1893	NC_007356	TCG	2	6	100325	100330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748050
1894	NC_007356	CGAGG	2	10	100332	100341	20 %	0 %	60 %	20 %	73748050
1895	NC_007356	TGA	2	6	100346	100351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748050
1896	NC_007356	CGCA	2	8	100389	100396	25 %	0 %	25 %	50 %	73748050
1897	NC_007356	TA	3	6	100400	100405	50 %	50 %	0 %	0 %	73748050
1898	NC_007356	T	7	7	100682	100688	0 %	100 %	0 %	0 %	73748050
1899	NC_007356	AT	3	6	100697	100702	50 %	50 %	0 %	0 %	73748050
1900	NC_007356	CGAT	2	8	100803	100810	25 %	25 %	25 %	25 %	73748050
1901	NC_007356	CTT	2	6	100845	100850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748050
1902	NC_007356	GCG	2	6	100922	100927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748050
1903	NC_007356	GGT	2	6	100952	100957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748050
1904	NC_007356	AAT	2	6	100965	100970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748050
1905	NC_007356	GGA	2	6	100976	100981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748050
1906	NC_007356	A	6	6	101092	101097	100 %	0 %	0 %	0 %	73748050
1907	NC_007356	GTA	2	6	101124	101129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748050
1908	NC_007356	T	6	6	101162	101167	0 %	100 %	0 %	0 %	73748050
1909	NC_007356	ACA	2	6	101203	101208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73748050
1910	NC_007356	GGAAT	2	10	101222	101231	40 %	20 %	40 %	0 %	73748050
1911	NC_007356	CTT	2	6	101235	101240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748050
1912	NC_007356	CTG	2	6	101443	101448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748050
1913	NC_007356	TAA	2	6	101488	101493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748050
1914	NC_007356	AT	3	6	101646	101651	50 %	50 %	0 %	0 %	73748050
1915	NC_007356	TATT	2	8	101703	101710	25 %	75 %	0 %	0 %	73748050
1916	NC_007356	GCT	2	6	101733	101738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748050
1917	NC_007356	AACA	2	8	101799	101806	75 %	0 %	0 %	25 %	73748050
1918	NC_007356	GGA	2	6	101859	101864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748050
1919	NC_007356	TTG	2	6	101973	101978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748050
1920	NC_007356	CTA	2	6	101984	101989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748050
1921	NC_007356	CT	3	6	102011	102016	0 %	50 %	0 %	50 %	73748050
1922	NC_007356	AGA	2	6	102017	102022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748050
1923	NC_007356	TTG	2	6	102046	102051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748050
1924	NC_007356	TCTT	2	8	102100	102107	0 %	75 %	0 %	25 %	73748050
1925	NC_007356	ATT	2	6	102124	102129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748050
1926	NC_007356	GGA	2	6	102233	102238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748050
1927	NC_007356	CGG	2	6	102251	102256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748050
1928	NC_007356	AAG	2	6	102311	102316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748050
1929	NC_007356	ATT	2	6	102355	102360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748050
1930	NC_007356	ATT	2	6	102423	102428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748050
1931	NC_007356	CAA	2	6	102522	102527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73748050
1932	NC_007356	TATAA	2	10	102528	102537	60 %	40 %	0 %	0 %	73748050
1933	NC_007356	AGTTT	2	10	102552	102561	20 %	60 %	20 %	0 %	73748050
1934	NC_007356	ATT	2	6	102562	102567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748050
1935	NC_007356	ACGA	2	8	102573	102580	50 %	0 %	25 %	25 %	73748050
1936	NC_007356	A	6	6	102618	102623	100 %	0 %	0 %	0 %	73748050
1937	NC_007356	AAT	2	6	102630	102635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748050
1938	NC_007356	ATG	2	6	102658	102663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748050
1939	NC_007356	ATGG	2	8	102670	102677	25 %	25 %	50 %	0 %	73748050
1940	NC_007356	CTG	2	6	102700	102705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748050
1941	NC_007356	AAC	2	6	102724	102729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73748050
1942	NC_007356	ATT	2	6	102786	102791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748050
1943	NC_007356	CAT	2	6	102836	102841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748050
1944	NC_007356	GTC	2	6	102874	102879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748050
1945	NC_007356	CGT	2	6	102897	102902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748050
1946	NC_007356	A	6	6	102907	102912	100 %	0 %	0 %	0 %	73748050
1947	NC_007356	A	6	6	103080	103085	100 %	0 %	0 %	0 %	73748050
1948	NC_007356	CT	3	6	103150	103155	0 %	50 %	0 %	50 %	73748050
1949	NC_007356	ATTG	2	8	103217	103224	25 %	50 %	25 %	0 %	73748050
1950	NC_007356	GTTT	2	8	103272	103279	0 %	75 %	25 %	0 %	73748050
1951	NC_007356	GAC	2	6	103292	103297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748050
1952	NC_007356	ATC	2	6	103338	103343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748050
1953	NC_007356	A	6	6	103344	103349	100 %	0 %	0 %	0 %	73748050
1954	NC_007356	GAG	2	6	103376	103381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1955	NC_007356	CTA	2	6	103515	103520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748051
1956	NC_007356	GCTG	2	8	103547	103554	0 %	25 %	50 %	25 %	73748051
1957	NC_007356	TTA	2	6	103698	103703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748051
1958	NC_007356	TTC	2	6	103717	103722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748051
1959	NC_007356	GAT	2	6	103744	103749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748051
1960	NC_007356	ATCC	2	8	103806	103813	25 %	25 %	0 %	50 %	73748051
1961	NC_007356	GTT	2	6	103873	103878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748051
1962	NC_007356	TTA	2	6	103887	103892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748051
1963	NC_007356	AGA	2	6	103906	103911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748051
1964	NC_007356	T	7	7	103920	103926	0 %	100 %	0 %	0 %	73748051
1965	NC_007356	AGC	2	6	103954	103959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748051
1966	NC_007356	GTT	2	6	104066	104071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748051
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1968	NC_007356	ATT	2	6	104137	104142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748051
1969	NC_007356	AAT	2	6	104287	104292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748051
1970	NC_007356	AC	3	6	104319	104324	50 %	0 %	0 %	50 %	73748051
1971	NC_007356	GAC	2	6	104339	104344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748051
1972	NC_007356	AAG	2	6	104418	104423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748051
1973	NC_007356	A	6	6	104449	104454	100 %	0 %	0 %	0 %	73748051
1974	NC_007356	AGC	2	6	104466	104471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748051
1975	NC_007356	ATT	2	6	104482	104487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748051
1976	NC_007356	TTGG	2	8	104494	104501	0 %	50 %	50 %	0 %	73748051
1977	NC_007356	TAA	2	6	104518	104523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748051
1978	NC_007356	T	6	6	104666	104671	0 %	100 %	0 %	0 %	73748051
1979	NC_007356	TCG	2	6	104824	104829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748051
1980	NC_007356	TGA	2	6	104860	104865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748051
1981	NC_007356	GTC	2	6	104877	104882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748051
1982	NC_007356	GGA	2	6	104911	104916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748051
1983	NC_007356	TTA	2	6	104939	104944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748051
1984	NC_007356	TTA	2	6	104954	104959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748051
1985	NC_007356	GCTTTA	2	12	104975	104986	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73748051
1986	NC_007356	A	6	6	105028	105033	100 %	0 %	0 %	0 %	73748051
1987	NC_007356	TGC	2	6	105096	105101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748051
1988	NC_007356	TTG	2	6	105135	105140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748051
1989	NC_007356	TAA	2	6	105168	105173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748051
1990	NC_007356	A	7	7	105255	105261	100 %	0 %	0 %	0 %	73748051
1991	NC_007356	ATTGGG	2	12	105436	105447	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	73748051
1992	NC_007356	TAC	2	6	105530	105535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748051
1993	NC_007356	TTG	2	6	105555	105560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748051
1994	NC_007356	ATTT	2	8	105628	105635	25 %	75 %	0 %	0 %	73748051
1995	NC_007356	C	6	6	105659	105664	0 %	0 %	0 %	100 %	73748051
1996	NC_007356	GATTC	2	10	105714	105723	20 %	40 %	20 %	20 %	73748051
1997	NC_007356	AATG	2	8	105800	105807	50 %	25 %	25 %	0 %	73748051
1998	NC_007356	TC	3	6	105883	105888	0 %	50 %	0 %	50 %	73748051
1999	NC_007356	AAC	2	6	105961	105966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73748051
2000	NC_007356	GGT	2	6	106028	106033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748051

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