MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough plasmid pDV

Total Repeats: 3539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005863	CCG	2	6	15	20	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_005863	CAT	2	6	126	131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005863	GGC	2	6	211	216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005863	GCA	2	6	221	226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_005863	CCG	2	6	249	254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_005863	TGT	2	6	255	260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005863	CCG	2	6	393	398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_005863	CCG	2	6	411	416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_005863	CGG	2	6	449	454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_005863	CCG	2	6	500	505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_005863	GAT	2	6	628	633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005863	TTC	2	6	689	694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_005863	ACG	2	6	733	738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562244
14	NC_005863	ATC	2	6	880	885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562243
15	NC_005863	CAA	3	9	894	902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562243
16	NC_005863	ACC	2	6	919	924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562243
17	NC_005863	CAC	2	6	927	932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562243
18	NC_005863	GAC	2	6	1072	1077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562243
19	NC_005863	CGC	2	6	1104	1109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562243
20	NC_005863	TGC	2	6	1133	1138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562243
21	NC_005863	TCA	2	6	1172	1177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562243
22	NC_005863	ATG	2	6	1291	1296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562243
23	NC_005863	TGG	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562243
24	NC_005863	GCA	2	6	1340	1345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562243
25	NC_005863	CGA	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562243
26	NC_005863	CTG	2	6	1426	1431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562243
27	NC_005863	CAA	2	6	1443	1448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562243
28	NC_005863	TCG	2	6	1466	1471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562243
29	NC_005863	GCA	2	6	1586	1591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562243
30	NC_005863	ACC	2	6	1660	1665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562243
31	NC_005863	CAC	2	6	1716	1721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_005863	GGA	2	6	1728	1733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005863	CAA	2	6	1779	1784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562242
34	NC_005863	TCT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562242
35	NC_005863	CGA	2	6	1966	1971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
36	NC_005863	GAC	2	6	2055	2060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
37	NC_005863	CGG	2	6	2077	2082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562242
38	NC_005863	CAC	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562242
39	NC_005863	TGA	2	6	2147	2152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562242
40	NC_005863	CAC	2	6	2195	2200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562242
41	NC_005863	ACA	2	6	2247	2252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562242
42	NC_005863	ACA	2	6	2286	2291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562242
43	NC_005863	GAC	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
44	NC_005863	CTT	2	6	2506	2511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562242
45	NC_005863	AGC	2	6	2541	2546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
46	NC_005863	GAC	2	6	2601	2606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
47	NC_005863	CTC	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562242
48	NC_005863	GAA	2	6	2739	2744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562242
49	NC_005863	ACG	2	6	2755	2760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
50	NC_005863	GCA	2	6	2872	2877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
51	NC_005863	CGA	2	6	2890	2895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
52	NC_005863	CAG	2	6	3277	3282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
53	NC_005863	GCC	2	6	3336	3341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562242
54	NC_005863	ACC	2	6	3432	3437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562242
55	NC_005863	TCT	2	6	3477	3482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562242
56	NC_005863	CAC	2	6	3527	3532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562242
57	NC_005863	GGT	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562242
58	NC_005863	GCG	2	6	4011	4016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562242
59	NC_005863	CAT	2	6	4130	4135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562242
60	NC_005863	CGG	2	6	4201	4206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562242
61	NC_005863	CGC	2	6	4349	4354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562242
62	NC_005863	CAG	2	6	4392	4397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
63	NC_005863	GCG	2	6	4404	4409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562242
64	NC_005863	CGC	2	6	4429	4434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562242
65	NC_005863	CGG	2	6	4463	4468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562242
66	NC_005863	CAC	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562242
67	NC_005863	CGG	2	6	4577	4582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562242
68	NC_005863	TTC	2	6	4602	4607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562242
69	NC_005863	CGA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
70	NC_005863	CCG	2	6	4789	4794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562242
71	NC_005863	GCT	2	6	4825	4830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562242
72	NC_005863	GGC	2	6	4834	4839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562242
73	NC_005863	CCG	2	6	4840	4845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562242
74	NC_005863	CGC	2	6	4895	4900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562242
75	NC_005863	AAC	2	6	4918	4923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562242
76	NC_005863	TGC	2	6	5050	5055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562242
77	NC_005863	CGC	2	6	5100	5105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562242
78	NC_005863	GTG	2	6	5247	5252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005863	TGG	2	6	5515	5520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562241
80	NC_005863	TGA	2	6	5563	5568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562241
81	NC_005863	TCT	2	6	5587	5592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562241
82	NC_005863	TGC	2	6	5626	5631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562241
83	NC_005863	GCC	2	6	5864	5869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_005863	CCT	2	6	5934	5939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_005863	GGT	2	6	6038	6043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005863	TGG	2	6	6067	6072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005863	ACG	2	6	6077	6082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_005863	TGA	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005863	CCG	2	6	6210	6215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_005863	GGC	2	6	6424	6429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_005863	GAC	2	6	6522	6527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562272
92	NC_005863	CGG	2	6	6563	6568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562272
93	NC_005863	CAG	2	6	6579	6584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562272
94	NC_005863	CGA	2	6	6614	6619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562272
95	NC_005863	ATG	2	6	6655	6660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562272
96	NC_005863	ACG	2	6	6670	6675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562272
97	NC_005863	ATG	2	6	6727	6732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562272
98	NC_005863	CCG	2	6	6766	6771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562272
99	NC_005863	GCG	2	6	6790	6795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562272
100	NC_005863	CCT	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562272
101	NC_005863	CGC	2	6	6821	6826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562272
102	NC_005863	CAC	2	6	6870	6875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562272
103	NC_005863	CGT	2	6	6965	6970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562272
104	NC_005863	GTG	2	6	7101	7106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562272
105	NC_005863	CGA	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562272
106	NC_005863	CGT	2	6	7187	7192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562272
107	NC_005863	CGT	2	6	7295	7300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562272
108	NC_005863	AGC	2	6	7409	7414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562272
109	NC_005863	TCC	2	6	7424	7429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562272
110	NC_005863	TGG	2	6	7500	7505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562240
111	NC_005863	GCA	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562240
112	NC_005863	AGA	2	6	7596	7601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562240
113	NC_005863	GCA	2	6	7606	7611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562240
114	NC_005863	CAG	2	6	7618	7623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562240
115	NC_005863	CCG	2	6	7641	7646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562240
116	NC_005863	GCG	2	6	7649	7654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562240
117	NC_005863	GAC	2	6	7672	7677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562240
118	NC_005863	TGC	2	6	7680	7685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562240
119	NC_005863	CGC	2	6	7702	7707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562240
120	NC_005863	CGG	2	6	7719	7724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562240
121	NC_005863	GAA	2	6	7852	7857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562240
122	NC_005863	TGG	2	6	7932	7937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562240
123	NC_005863	GAT	2	6	8011	8016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562240
124	NC_005863	CCA	2	6	8085	8090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562240
125	NC_005863	CCA	2	6	8115	8120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562240
126	NC_005863	ATG	2	6	8210	8215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562240
127	NC_005863	TCG	2	6	8216	8221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562240
128	NC_005863	GTC	2	6	8233	8238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562240
129	NC_005863	GTC	2	6	8281	8286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562240
130	NC_005863	CGA	2	6	8292	8297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562240
131	NC_005863	AGT	2	6	8304	8309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562240
132	NC_005863	TCA	3	9	8321	8329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562240
133	NC_005863	TCG	2	6	8364	8369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562240
134	NC_005863	CTT	2	6	8383	8388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562240
135	NC_005863	ATG	2	6	8411	8416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562240
136	NC_005863	GAA	2	6	8425	8430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562240
137	NC_005863	TTC	2	6	8435	8440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562240
138	NC_005863	TCC	2	6	8455	8460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_005863	AGC	2	6	8475	8480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_005863	CAA	2	6	8494	8499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_005863	ACC	2	6	8521	8526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_005863	AGC	2	6	8606	8611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_005863	GTC	2	6	8616	8621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_005863	CGT	2	6	8855	8860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_005863	CAG	2	6	8902	8907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562239
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161	NC_005863	GAT	2	6	9783	9788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562239
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165	NC_005863	GCC	2	6	9953	9958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562239
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169	NC_005863	TCC	2	6	10453	10458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562238
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240	NC_005863	CGG	2	6	14695	14700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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254	NC_005863	GCG	2	6	15348	15353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562235
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262	NC_005863	GTC	2	6	15845	15850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562235
263	NC_005863	GGT	2	6	15872	15877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562235
264	NC_005863	CCA	2	6	15886	15891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562235
265	NC_005863	GCC	3	9	15944	15952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562235
266	NC_005863	CAG	2	6	16041	16046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562235
267	NC_005863	GGC	2	6	16163	16168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562235
268	NC_005863	CCT	2	6	16193	16198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_005863	CGG	2	6	16237	16242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562234
270	NC_005863	AGT	2	6	16360	16365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562234
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278	NC_005863	TGG	2	6	16666	16671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562234
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291	NC_005863	TGG	2	6	17256	17261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562234
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293	NC_005863	GTC	2	6	17357	17362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562234
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301	NC_005863	TGA	2	6	17671	17676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562234
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318	NC_005863	TGG	2	6	18637	18642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
319	NC_005863	TGG	2	6	18647	18652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
320	NC_005863	CGT	2	6	18740	18745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
321	NC_005863	GAT	2	6	18814	18819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
322	NC_005863	GCC	2	6	18853	18858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
323	NC_005863	ACG	2	6	18879	18884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562231
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380	NC_005863	CGA	2	6	22113	22118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
381	NC_005863	CTT	2	6	22130	22135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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383	NC_005863	CTG	2	6	22234	22239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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385	NC_005863	AGA	2	6	22465	22470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562229
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390	NC_005863	TTG	2	6	22605	22610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562229
391	NC_005863	GCC	2	6	22693	22698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
392	NC_005863	CTG	2	6	22778	22783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
393	NC_005863	GAA	2	6	22843	22848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562228
394	NC_005863	TTG	2	6	22871	22876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562228
395	NC_005863	ATG	2	6	22883	22888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562228
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401	NC_005863	TGT	2	6	23196	23201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562228
402	NC_005863	TCC	2	6	23208	23213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562228
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427	NC_005863	TTA	2	6	25205	25210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_005863	CGA	2	6	25365	25370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570524
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431	NC_005863	CGC	2	6	25465	25470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570524
432	NC_005863	CGC	2	6	25569	25574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570524
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499	NC_005863	GCC	2	6	29252	29257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562224
500	NC_005863	CGA	2	6	29281	29286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562224

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