MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough plasmid pDV

Total Repeats: 4870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005863	CCCTG	2	10	144316	144325	0 %	20 %	20 %	60 %	46562152
3502	NC_005863	GTC	2	6	144464	144469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562152
3503	NC_005863	GGT	2	6	144470	144475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562152
3504	NC_005863	CGG	2	6	144478	144483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562152
3505	NC_005863	CGG	2	6	144499	144504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562152
3506	NC_005863	AGC	2	6	144513	144518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562152
3507	NC_005863	GCG	2	6	144523	144528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562152
3508	NC_005863	CAG	2	6	144554	144559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562152
3509	NC_005863	TCGA	2	8	144636	144643	25 %	25 %	25 %	25 %	46562152
3510	NC_005863	TCC	2	6	144653	144658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_005863	CTG	2	6	144666	144671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_005863	ATCT	2	8	144684	144691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_005863	CGCC	2	8	144731	144738	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3514	NC_005863	TG	3	6	144769	144774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_005863	AGC	2	6	144856	144861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_005863	AAC	2	6	144862	144867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_005863	AC	3	6	144877	144882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_005863	ATG	2	6	145027	145032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_005863	CTG	2	6	145044	145049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_005863	GCC	2	6	145053	145058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_005863	GAC	2	6	145087	145092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_005863	AC	3	6	145091	145096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_005863	CAA	2	6	145151	145156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_005863	GGC	2	6	145168	145173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_005863	AC	3	6	145265	145270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_005863	TGC	2	6	145302	145307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_005863	CGG	2	6	145310	145315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_005863	AGG	2	6	145339	145344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_005863	GCC	2	6	145455	145460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570523
3530	NC_005863	CGG	2	6	145483	145488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570523
3531	NC_005863	GCC	2	6	145505	145510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570523
3532	NC_005863	CGCAGG	2	12	145531	145542	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	304570523
3533	NC_005863	GCGAGG	2	12	145555	145566	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	304570523
3534	NC_005863	CAC	2	6	145583	145588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304570523
3535	NC_005863	GCCACG	2	12	145593	145604	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	304570523
3536	NC_005863	CGC	2	6	145632	145637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570523
3537	NC_005863	CCAG	2	8	145667	145674	25 %	0 %	25 %	50 %	304570519
3538	NC_005863	CAT	2	6	145687	145692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304570519
3539	NC_005863	AAC	2	6	145703	145708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304570519
3540	NC_005863	ACA	2	6	145824	145829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304570519
3541	NC_005863	AAG	2	6	145832	145837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304570519
3542	NC_005863	AGG	2	6	145851	145856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304570519
3543	NC_005863	GCC	2	6	145871	145876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570519
3544	NC_005863	GC	3	6	145889	145894	0 %	0 %	50 %	50 %	304570519
3545	NC_005863	AAC	2	6	145916	145921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304570519
3546	NC_005863	ACC	2	6	145928	145933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304570519
3547	NC_005863	CCG	2	6	145941	145946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570519
3548	NC_005863	CTT	2	6	145957	145962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304570519
3549	NC_005863	AAC	2	6	145970	145975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304570519
3550	NC_005863	ACG	2	6	145998	146003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570519
3551	NC_005863	CAA	2	6	146011	146016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304570519
3552	NC_005863	ACA	2	6	146031	146036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304570519
3553	NC_005863	CAG	2	6	146039	146044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570519
3554	NC_005863	GCA	2	6	146080	146085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570519
3555	NC_005863	CAG	2	6	146156	146161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570519
3556	NC_005863	GCA	2	6	146316	146321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562149
3557	NC_005863	CCG	2	6	146366	146371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562149
3558	NC_005863	CG	3	6	146401	146406	0 %	0 %	50 %	50 %	46562149
3559	NC_005863	ACG	2	6	146426	146431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562149
3560	NC_005863	GCAG	2	8	146459	146466	25 %	0 %	50 %	25 %	46562149
3561	NC_005863	GCC	2	6	146515	146520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562149
3562	NC_005863	CG	3	6	146592	146597	0 %	0 %	50 %	50 %	46562149
3563	NC_005863	GCC	2	6	146650	146655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562149
3564	NC_005863	CTG	2	6	146686	146691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562149
3565	NC_005863	CGG	2	6	146723	146728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562278
3566	NC_005863	CAC	2	6	146738	146743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562278
3567	NC_005863	CAC	2	6	146789	146794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562278
3568	NC_005863	CGG	2	6	146819	146824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562278
3569	NC_005863	GCAG	2	8	146923	146930	25 %	0 %	50 %	25 %	46562278
3570	NC_005863	GCC	2	6	146967	146972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562278
3571	NC_005863	ATC	2	6	147075	147080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562278
3572	NC_005863	TCG	2	6	147088	147093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562278
3573	NC_005863	CCA	2	6	147112	147117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562278
3574	NC_005863	CGT	2	6	147119	147124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562278
3575	NC_005863	GC	3	6	147127	147132	0 %	0 %	50 %	50 %	46562278
3576	NC_005863	CTG	2	6	147147	147152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562278
3577	NC_005863	ACGG	2	8	147210	147217	25 %	0 %	50 %	25 %	46562278
3578	NC_005863	GCC	2	6	147279	147284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562278
3579	NC_005863	TTCGGC	2	12	147291	147302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562278
3580	NC_005863	TCG	2	6	147322	147327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562278
3581	NC_005863	GCC	2	6	147375	147380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562278
3582	NC_005863	CAC	2	6	147389	147394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562278
3583	NC_005863	GGC	2	6	147395	147400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562278
3584	NC_005863	GCA	2	6	147431	147436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562278
3585	NC_005863	CGTGGC	2	12	147461	147472	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46562278
3586	NC_005863	GCG	2	6	147481	147486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562278
3587	NC_005863	GAA	2	6	147624	147629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562278
3588	NC_005863	TGG	2	6	147689	147694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562278
3589	NC_005863	GAC	2	6	147727	147732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562148
3590	NC_005863	TCG	2	6	147786	147791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562148
3591	NC_005863	CGG	2	6	147819	147824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562148
3592	NC_005863	GCAG	2	8	147857	147864	25 %	0 %	50 %	25 %	46562148
3593	NC_005863	CGG	2	6	147873	147878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562148
3594	NC_005863	CAA	2	6	147925	147930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562148
3595	NC_005863	TCA	2	6	147993	147998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562148
3596	NC_005863	TCG	2	6	148062	148067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562148
3597	NC_005863	AGA	2	6	148068	148073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562148
3598	NC_005863	CGA	2	6	148087	148092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562148
3599	NC_005863	AGCATG	2	12	148169	148180	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46562148
3600	NC_005863	AGC	2	6	148197	148202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562148
3601	NC_005863	GCA	2	6	148309	148314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562148
3602	NC_005863	CCG	2	6	148338	148343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562148
3603	NC_005863	ATCA	2	8	148364	148371	50 %	25 %	0 %	25 %	46562148
3604	NC_005863	CTT	2	6	148384	148389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562148
3605	NC_005863	CGC	2	6	148393	148398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562148
3606	NC_005863	CGA	2	6	148462	148467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562148
3607	NC_005863	AGA	2	6	148488	148493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562148
3608	NC_005863	CAG	2	6	148517	148522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562148
3609	NC_005863	GACC	2	8	148557	148564	25 %	0 %	25 %	50 %	46562148
3610	NC_005863	GAC	2	6	148623	148628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570521
3611	NC_005863	GC	3	6	148632	148637	0 %	0 %	50 %	50 %	304570521
3612	NC_005863	GGC	2	6	148649	148654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570521
3613	NC_005863	CGG	2	6	148676	148681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570521
3614	NC_005863	GACG	2	8	148740	148747	25 %	0 %	50 %	25 %	304570521
3615	NC_005863	CGA	2	6	148784	148789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570521
3616	NC_005863	GCCGC	2	10	148792	148801	0 %	0 %	40 %	60 %	304570521
3617	NC_005863	CTG	2	6	148809	148814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304570521
3618	NC_005863	GGC	2	6	148934	148939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570521
3619	NC_005863	GCC	2	6	148941	148946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570521
3620	NC_005863	TGG	2	6	148974	148979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304570521
3621	NC_005863	G	6	6	149021	149026	0 %	0 %	100 %	0 %	304570521
3622	NC_005863	CCG	2	6	149035	149040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570521
3623	NC_005863	GGT	2	6	149070	149075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_005863	ACGCC	2	10	149118	149127	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3625	NC_005863	CGC	2	6	149140	149145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_005863	GGC	2	6	149159	149164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3733	NC_005863	CGA	2	6	153076	153081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562145
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3735	NC_005863	CGA	2	6	153172	153177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562145
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3738	NC_005863	AGG	2	6	153265	153270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3739	NC_005863	GCA	2	6	153386	153391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562144
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3742	NC_005863	GT	3	6	153540	153545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3743	NC_005863	G	6	6	153546	153551	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3744	NC_005863	CCCG	2	8	153559	153566	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3745	NC_005863	GA	3	6	153713	153718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3747	NC_005863	GCA	2	6	153801	153806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562143
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3872	NC_005863	CGA	2	6	158898	158903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562141
3873	NC_005863	CGA	2	6	158916	158921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562141
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3876	NC_005863	GCT	2	6	158988	158993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3878	NC_005863	GAC	2	6	159070	159075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3879	NC_005863	CGA	2	6	159090	159095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3880	NC_005863	GGC	2	6	159099	159104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3883	NC_005863	AG	3	6	159132	159137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3884	NC_005863	ACG	2	6	159143	159148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3887	NC_005863	CTG	2	6	159226	159231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3891	NC_005863	GC	3	6	159295	159300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3892	NC_005863	GCG	2	6	159307	159312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3893	NC_005863	GGC	2	6	159366	159371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3952	NC_005863	GTC	2	6	161710	161715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562139
3953	NC_005863	GCA	2	6	161745	161750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562139
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3968	NC_005863	GTCA	2	8	162229	162236	25 %	25 %	25 %	25 %	46562139
3969	NC_005863	GCT	2	6	162240	162245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562139
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3971	NC_005863	CAC	2	6	162303	162308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562138
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3975	NC_005863	TCG	3	9	162419	162427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562138
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3978	NC_005863	GCT	2	6	162480	162485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562138
3979	NC_005863	GGC	2	6	162498	162503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562138
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3981	NC_005863	CGA	2	6	162600	162605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562138
3982	NC_005863	CT	3	6	162615	162620	0 %	50 %	0 %	50 %	46562138
3983	NC_005863	GGA	2	6	162630	162635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3984	NC_005863	CT	3	6	162652	162657	0 %	50 %	0 %	50 %	46562137
3985	NC_005863	AGC	2	6	162719	162724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562137
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3988	NC_005863	CTG	2	6	162766	162771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562137
3989	NC_005863	CGA	2	6	162843	162848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562137
3990	NC_005863	CTT	2	6	162855	162860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562137
3991	NC_005863	GGA	2	6	162939	162944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562137
3992	NC_005863	TCA	2	6	162974	162979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562137
3993	NC_005863	TGG	2	6	162986	162991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562137
3994	NC_005863	TACAGC	2	12	162997	163008	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	46562137
3995	NC_005863	CAC	2	6	163009	163014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562137
3996	NC_005863	CAC	2	6	163073	163078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562136
3997	NC_005863	TGC	2	6	163145	163150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562136
3998	NC_005863	GC	3	6	163149	163154	0 %	0 %	50 %	50 %	46562136
3999	NC_005863	GGTGCT	2	12	163159	163170	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	46562136
4000	NC_005863	CGG	2	6	163191	163196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562136

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