MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough plasmid pDV

Total Repeats: 4870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005863	GCT	2	6	20739	20744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562270
502	NC_005863	CCG	2	6	20748	20753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562270
503	NC_005863	GCG	2	6	20782	20787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562270
504	NC_005863	CGT	2	6	20805	20810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562270
505	NC_005863	CGA	2	6	20848	20853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562270
506	NC_005863	GCG	2	6	20888	20893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562270
507	NC_005863	GGA	2	6	20926	20931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562270
508	NC_005863	GCAC	2	8	20969	20976	25 %	0 %	25 %	50 %	46562270
509	NC_005863	GGC	2	6	20977	20982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562270
510	NC_005863	GC	3	6	20981	20986	0 %	0 %	50 %	50 %	46562270
511	NC_005863	TGC	2	6	21057	21062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562270
512	NC_005863	GC	3	6	21065	21070	0 %	0 %	50 %	50 %	46562270
513	NC_005863	GCTG	2	8	21136	21143	0 %	25 %	50 %	25 %	46562270
514	NC_005863	GCT	2	6	21178	21183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562270
515	NC_005863	GGA	2	6	21217	21222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562270
516	NC_005863	GCC	2	6	21230	21235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562270
517	NC_005863	GTG	2	6	21239	21244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562270
518	NC_005863	TGC	2	6	21273	21278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562270
519	NC_005863	GCG	2	6	21279	21284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562270
520	NC_005863	GCC	2	6	21299	21304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562270
521	NC_005863	TGG	2	6	21432	21437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562270
522	NC_005863	GA	3	6	21443	21448	50 %	0 %	50 %	0 %	46562270
523	NC_005863	G	6	6	21460	21465	0 %	0 %	100 %	0 %	46562270
524	NC_005863	CGTGC	2	10	21548	21557	0 %	20 %	40 %	40 %	46562270
525	NC_005863	G	6	6	21771	21776	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
526	NC_005863	CGT	2	6	21801	21806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_005863	GCAG	2	8	21867	21874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
528	NC_005863	TCA	2	6	21908	21913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_005863	GTC	2	6	21926	21931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_005863	CGGG	2	8	21938	21945	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
531	NC_005863	TCGT	2	8	21979	21986	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
532	NC_005863	AGG	2	6	22040	22045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_005863	CG	3	6	22063	22068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_005863	CAG	2	6	22079	22084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_005863	CGA	2	6	22113	22118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_005863	CTT	2	6	22130	22135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_005863	CT	3	6	22163	22168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_005863	GAC	2	6	22208	22213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_005863	CTG	2	6	22234	22239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_005863	TTC	2	6	22243	22248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_005863	GGCG	2	8	22339	22346	0 %	0 %	75 %	25 %	46562230
542	NC_005863	AGA	2	6	22465	22470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562229
543	NC_005863	GA	3	6	22476	22481	50 %	0 %	50 %	0 %	46562229
544	NC_005863	TCC	2	6	22493	22498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562229
545	NC_005863	TTG	2	6	22499	22504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562229
546	NC_005863	GGT	2	6	22566	22571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562229
547	NC_005863	CTG	2	6	22587	22592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562229
548	NC_005863	TTG	2	6	22605	22610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562229
549	NC_005863	GCC	2	6	22693	22698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_005863	TTTG	2	8	22746	22753	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
551	NC_005863	CTG	2	6	22778	22783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_005863	GAA	2	6	22843	22848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562228
553	NC_005863	TTG	2	6	22871	22876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562228
554	NC_005863	ATG	2	6	22883	22888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562228
555	NC_005863	GTA	2	6	22982	22987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562228
556	NC_005863	GTA	2	6	23005	23010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562228
557	NC_005863	TTC	2	6	23109	23114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562228
558	NC_005863	GAC	2	6	23155	23160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562228
559	NC_005863	TCT	2	6	23163	23168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562228
560	NC_005863	TGT	2	6	23196	23201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562228
561	NC_005863	TCC	2	6	23208	23213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562228
562	NC_005863	TAC	2	6	23243	23248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562228
563	NC_005863	TATG	2	8	23277	23284	25 %	50 %	25 %	0 %	46562228
564	NC_005863	GGAAG	2	10	23339	23348	40 %	0 %	60 %	0 %	46562228
565	NC_005863	GAA	2	6	23379	23384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562228
566	NC_005863	TGGT	2	8	23450	23457	0 %	50 %	50 %	0 %	46562228
567	NC_005863	GTT	2	6	23479	23484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562228
568	NC_005863	ACGT	2	8	23627	23634	25 %	25 %	25 %	25 %	46562228
569	NC_005863	CA	3	6	23642	23647	50 %	0 %	0 %	50 %	46562228
570	NC_005863	CGT	2	6	23704	23709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562228
571	NC_005863	CGA	2	6	23802	23807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562228
572	NC_005863	TCG	2	6	23988	23993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562228
573	NC_005863	A	7	7	24005	24011	100 %	0 %	0 %	0 %	46562228
574	NC_005863	TCA	2	6	24135	24140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562228
575	NC_005863	TGT	3	9	24194	24202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562228
576	NC_005863	TTG	2	6	24221	24226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562228
577	NC_005863	CAA	2	6	24236	24241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562228
578	NC_005863	GAG	2	6	24248	24253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46562228
579	NC_005863	GAA	2	6	24331	24336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562228
580	NC_005863	TAG	2	6	24341	24346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562228
581	NC_005863	GCA	2	6	24379	24384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562228
582	NC_005863	GCA	2	6	24421	24426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562228
583	NC_005863	GT	3	6	24477	24482	0 %	50 %	50 %	0 %	46562227
584	NC_005863	AAT	2	6	24504	24509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46562227
585	NC_005863	GC	3	6	24563	24568	0 %	0 %	50 %	50 %	46562227
586	NC_005863	ATGG	2	8	24591	24598	25 %	25 %	50 %	0 %	46562227
587	NC_005863	TCA	2	6	24656	24661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562227
588	NC_005863	T	6	6	24689	24694	0 %	100 %	0 %	0 %	46562227
589	NC_005863	GCT	2	6	24747	24752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562227
590	NC_005863	TAA	2	6	24788	24793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46562227
591	NC_005863	CAA	2	6	24797	24802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562227
592	NC_005863	AGA	2	6	24809	24814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562227
593	NC_005863	GTTG	2	8	24902	24909	0 %	50 %	50 %	0 %	46562227
594	NC_005863	CAT	2	6	24985	24990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562227
595	NC_005863	AAT	2	6	25074	25079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46562227
596	NC_005863	GCC	2	6	25158	25163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562227
597	NC_005863	TTA	2	6	25205	25210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_005863	TGAT	2	8	25258	25265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_005863	CGA	2	6	25365	25370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570524
600	NC_005863	GCA	2	6	25414	25419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570524
601	NC_005863	CGC	2	6	25456	25461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570524
602	NC_005863	CGC	2	6	25465	25470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570524
603	NC_005863	CGC	2	6	25569	25574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570524
604	NC_005863	GCA	2	6	25587	25592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570524
605	NC_005863	AGA	2	6	25605	25610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304570524
606	NC_005863	TTC	2	6	25612	25617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304570524
607	NC_005863	CAG	2	6	25630	25635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570524
608	NC_005863	GCCA	2	8	25745	25752	25 %	0 %	25 %	50 %	304570524
609	NC_005863	CAC	2	6	25774	25779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304570524
610	NC_005863	GGCA	2	8	25838	25845	25 %	0 %	50 %	25 %	304570524
611	NC_005863	CA	4	8	25864	25871	50 %	0 %	0 %	50 %	304570524
612	NC_005863	GTG	2	6	25922	25927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304570524
613	NC_005863	GAG	2	6	25928	25933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304570524
614	NC_005863	CGC	2	6	25981	25986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304570524
615	NC_005863	GGC	2	6	26011	26016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570524
616	NC_005863	GTG	3	9	26048	26056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304570524
617	NC_005863	CCGG	2	8	26081	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	304570524
618	NC_005863	CTT	2	6	26151	26156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304570524
619	NC_005863	CG	3	6	26183	26188	0 %	0 %	50 %	50 %	304570524
620	NC_005863	GCG	2	6	26198	26203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570524
621	NC_005863	GCA	2	6	26249	26254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304570524
622	NC_005863	GT	3	6	26280	26285	0 %	50 %	50 %	0 %	304570524
623	NC_005863	GGTGC	2	10	26348	26357	0 %	20 %	60 %	20 %	304570524
624	NC_005863	TGGCG	2	10	26437	26446	0 %	20 %	60 %	20 %	304570524
625	NC_005863	AG	3	6	26489	26494	50 %	0 %	50 %	0 %	304570524
626	NC_005863	G	7	7	26570	26576	0 %	0 %	100 %	0 %	304570524
627	NC_005863	G	6	6	26584	26589	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
628	NC_005863	GGGT	2	8	26605	26612	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
629	NC_005863	G	6	6	26641	26646	0 %	0 %	100 %	0 %	46562226
630	NC_005863	CAC	2	6	26794	26799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562226
631	NC_005863	GC	3	6	26843	26848	0 %	0 %	50 %	50 %	46562226
632	NC_005863	TGA	2	6	26937	26942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562226
633	NC_005863	GCA	2	6	26994	26999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562226
634	NC_005863	GC	3	6	27017	27022	0 %	0 %	50 %	50 %	46562226
635	NC_005863	GCGCG	2	10	27039	27048	0 %	0 %	60 %	40 %	46562226
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641	NC_005863	CG	3	6	27207	27212	0 %	0 %	50 %	50 %	46562226
642	NC_005863	CTG	2	6	27223	27228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562226
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645	NC_005863	GCGG	2	8	27358	27365	0 %	0 %	75 %	25 %	46562226
646	NC_005863	CGC	2	6	27483	27488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562226
647	NC_005863	CGA	2	6	27528	27533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562226
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649	NC_005863	CGC	2	6	27577	27582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562226
650	NC_005863	G	6	6	27612	27617	0 %	0 %	100 %	0 %	46562226
651	NC_005863	ACGCC	2	10	27648	27657	20 %	0 %	20 %	60 %	46562226
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675	NC_005863	TC	3	6	28328	28333	0 %	50 %	0 %	50 %	46562225
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722	NC_005863	GTCG	2	8	30040	30047	0 %	25 %	50 %	25 %	46562223
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761	NC_005863	ATAGT	2	10	31313	31322	40 %	40 %	20 %	0 %	46562221
762	NC_005863	GCA	2	6	31333	31338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562221
763	NC_005863	ATT	2	6	31439	31444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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802	NC_005863	GC	3	6	33149	33154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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826	NC_005863	TCC	2	6	34319	34324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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881	NC_005863	AG	3	6	36551	36556	50 %	0 %	50 %	0 %	46562215
882	NC_005863	AT	4	8	36655	36662	50 %	50 %	0 %	0 %	46562214
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887	NC_005863	TGA	2	6	36795	36800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562214
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889	NC_005863	AGG	2	6	36854	36859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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891	NC_005863	GAA	2	6	36913	36918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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