MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough chromosome

Total Repeats: 2867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002937	ACGGA	2	10	644	653	40 %	0 %	40 %	20 %	46578418
2	NC_002937	GAAAA	2	10	1589	1598	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002937	GGGCA	2	10	5619	5628	20 %	0 %	60 %	20 %	46578421
4	NC_002937	GTCGC	2	10	6833	6842	0 %	20 %	40 %	40 %	46578421
5	NC_002937	CGGAA	2	10	7808	7817	40 %	0 %	40 %	20 %	46578421
6	NC_002937	GGGAA	2	10	9580	9589	40 %	0 %	60 %	0 %	46578424
7	NC_002937	CCGGG	2	10	10971	10980	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_002937	TGCCA	2	10	13181	13190	20 %	20 %	20 %	40 %	46578427
9	NC_002937	CGTGA	2	10	13234	13243	20 %	20 %	40 %	20 %	46578427
10	NC_002937	GGGGT	2	10	14010	14019	0 %	20 %	80 %	0 %	46578428
11	NC_002937	GAAGT	2	10	14150	14159	40 %	20 %	40 %	0 %	46578428
12	NC_002937	GCAGG	2	10	15683	15692	20 %	0 %	60 %	20 %	46578429
13	NC_002937	TTCGG	2	10	16651	16660	0 %	40 %	40 %	20 %	46578430
14	NC_002937	GGAAG	2	10	20585	20594	40 %	0 %	60 %	0 %	46578435
15	NC_002937	GCCCC	2	10	20693	20702	0 %	0 %	20 %	80 %	46578435
16	NC_002937	CTGGG	2	10	20754	20763	0 %	20 %	60 %	20 %	46578435
17	NC_002937	TTTGT	2	10	23124	23133	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002937	TGCCC	2	10	23780	23789	0 %	20 %	20 %	60 %	46578438
19	NC_002937	CGGCA	2	10	24781	24790	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_002937	GGCGC	2	10	24798	24807	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_002937	CACGC	2	10	26423	26432	20 %	0 %	20 %	60 %	46578439
22	NC_002937	AGGGT	2	10	27334	27343	20 %	20 %	60 %	0 %	46578440
23	NC_002937	AGTGA	2	10	29541	29550	40 %	20 %	40 %	0 %	46578442
24	NC_002937	CGGTG	2	10	29662	29671	0 %	20 %	60 %	20 %	46578442
25	NC_002937	CCATG	2	10	31335	31344	20 %	20 %	20 %	40 %	46578444
26	NC_002937	AGGGC	2	10	32680	32689	20 %	0 %	60 %	20 %	46578444
27	NC_002937	CCGTG	2	10	33728	33737	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_002937	TTGCC	2	10	33860	33869	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_002937	CGCGG	2	10	35572	35581	0 %	0 %	60 %	40 %	46578446
30	NC_002937	CGGCG	2	10	36200	36209	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31	NC_002937	GACGG	2	10	38264	38273	20 %	0 %	60 %	20 %	304569673
32	NC_002937	GGGCA	2	10	38286	38295	20 %	0 %	60 %	20 %	304569673
33	NC_002937	ACCGT	2	10	39774	39783	20 %	20 %	20 %	40 %	46578450
34	NC_002937	GGGGA	2	10	40386	40395	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002937	GGGTG	2	10	40398	40407	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002937	GGAAG	2	10	41484	41493	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002937	TATCG	2	10	42172	42181	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_002937	CGGGA	2	10	42238	42247	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_002937	GGAAG	2	10	42361	42370	40 %	0 %	60 %	0 %	46578453
40	NC_002937	TGCCT	2	10	44419	44428	0 %	40 %	20 %	40 %	46578455
41	NC_002937	CACGG	2	10	44440	44449	20 %	0 %	40 %	40 %	46578455
42	NC_002937	CGGTG	2	10	44907	44916	0 %	20 %	60 %	20 %	46578455
43	NC_002937	GGTCG	2	10	45162	45171	0 %	20 %	60 %	20 %	46578455
44	NC_002937	GCAGG	2	10	45747	45756	20 %	0 %	60 %	20 %	46578456
45	NC_002937	GCGCC	2	10	45961	45970	0 %	0 %	40 %	60 %	46578456
46	NC_002937	GCATC	2	10	46069	46078	20 %	20 %	20 %	40 %	46578456
47	NC_002937	GACGG	2	10	46255	46264	20 %	0 %	60 %	20 %	46578456
48	NC_002937	TTCCC	2	10	46827	46836	0 %	40 %	0 %	60 %	46578457
49	NC_002937	CTGCG	2	10	47433	47442	0 %	20 %	40 %	40 %	46578458
50	NC_002937	TGCCA	2	10	47638	47647	20 %	20 %	20 %	40 %	46578458
51	NC_002937	GCAGG	2	10	49495	49504	20 %	0 %	60 %	20 %	304569674
52	NC_002937	ACCGT	2	10	50497	50506	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_002937	CGTTG	2	10	52005	52014	0 %	40 %	40 %	20 %	46578462
54	NC_002937	CGGGG	2	10	52359	52368	0 %	0 %	80 %	20 %	46578463
55	NC_002937	CCTGT	2	10	53476	53485	0 %	40 %	20 %	40 %	46578465
56	NC_002937	CGGGG	2	10	54186	54195	0 %	0 %	80 %	20 %	46578466
57	NC_002937	GCCGT	2	10	54974	54983	0 %	20 %	40 %	40 %	46578466
58	NC_002937	GGCGT	2	10	55013	55022	0 %	20 %	60 %	20 %	46578467
59	NC_002937	CGCAG	2	10	55378	55387	20 %	0 %	40 %	40 %	46578467
60	NC_002937	CGGCG	2	10	56685	56694	0 %	0 %	60 %	40 %	304569675
61	NC_002937	GGGCC	2	10	57221	57230	0 %	0 %	60 %	40 %	46578469
62	NC_002937	CGCAC	3	15	58056	58070	20 %	0 %	20 %	60 %	304569676
63	NC_002937	ACGGG	2	10	58105	58114	20 %	0 %	60 %	20 %	304569676
64	NC_002937	GCGGG	2	10	60906	60915	0 %	0 %	80 %	20 %	46578471
65	NC_002937	GCCGG	2	10	62118	62127	0 %	0 %	60 %	40 %	46578472
66	NC_002937	TTCGG	2	10	62210	62219	0 %	40 %	40 %	20 %	46578472
67	NC_002937	GACGC	2	10	62603	62612	20 %	0 %	40 %	40 %	46578472
68	NC_002937	TCTCG	2	10	63404	63413	0 %	40 %	20 %	40 %	46578473
69	NC_002937	TTCTC	2	10	63496	63505	0 %	60 %	0 %	40 %	46578473
70	NC_002937	GCGTG	2	10	63783	63792	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_002937	GAGGC	2	10	64517	64526	20 %	0 %	60 %	20 %	46578474
72	NC_002937	CATGC	2	10	65804	65813	20 %	20 %	20 %	40 %	46578476
73	NC_002937	GTGCG	2	10	66198	66207	0 %	20 %	60 %	20 %	46578476
74	NC_002937	GCGAC	2	10	66486	66495	20 %	0 %	40 %	40 %	46578476
75	NC_002937	CGCGC	2	10	66496	66505	0 %	0 %	40 %	60 %	46578476
76	NC_002937	TCGGT	2	10	67740	67749	0 %	40 %	40 %	20 %	46578476
77	NC_002937	TGGGC	2	10	67801	67810	0 %	20 %	60 %	20 %	46578476
78	NC_002937	CGGGC	2	10	68064	68073	0 %	0 %	60 %	40 %	46578476
79	NC_002937	GACCA	2	10	70347	70356	40 %	0 %	20 %	40 %	46578477
80	NC_002937	GCCGC	2	10	70926	70935	0 %	0 %	40 %	60 %	46578478
81	NC_002937	CTCGC	2	10	73128	73137	0 %	20 %	20 %	60 %	46578478
82	NC_002937	TCGGC	2	10	73309	73318	0 %	20 %	40 %	40 %	46578478
83	NC_002937	TCCTG	2	10	76977	76986	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_002937	CGGCG	2	10	78220	78229	0 %	0 %	60 %	40 %	46578483
85	NC_002937	GCCGT	2	10	78869	78878	0 %	20 %	40 %	40 %	46578484
86	NC_002937	GTGCC	2	10	81740	81749	0 %	20 %	40 %	40 %	46578486
87	NC_002937	GCGGT	2	10	82626	82635	0 %	20 %	60 %	20 %	46578486
88	NC_002937	CAGTC	2	10	84562	84571	20 %	20 %	20 %	40 %	46578486
89	NC_002937	CCTCG	2	10	85956	85965	0 %	20 %	20 %	60 %	46578487
90	NC_002937	TGCCG	2	10	86503	86512	0 %	20 %	40 %	40 %	46578487
91	NC_002937	GTGCA	2	10	86516	86525	20 %	20 %	40 %	20 %	46578487
92	NC_002937	AGCGA	2	10	86702	86711	40 %	0 %	40 %	20 %	46578487
93	NC_002937	TGTCC	2	10	87215	87224	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_002937	GTCTC	2	10	87241	87250	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_002937	ACGCC	2	10	88727	88736	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_002937	GCTGT	2	10	90799	90808	0 %	40 %	40 %	20 %	46578490
97	NC_002937	AGTGA	2	10	91864	91873	40 %	20 %	40 %	0 %	46578492
98	NC_002937	TGGCG	2	10	94939	94948	0 %	20 %	60 %	20 %	46578494
99	NC_002937	CACAC	2	10	95808	95817	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_002937	ACGGA	2	10	97114	97123	40 %	0 %	40 %	20 %	46578497
101	NC_002937	CATCG	2	10	98619	98628	20 %	20 %	20 %	40 %	46578498
102	NC_002937	GCGTG	2	10	99538	99547	0 %	20 %	60 %	20 %	46578498
103	NC_002937	ACGGC	2	10	99748	99757	20 %	0 %	40 %	40 %	46578498
104	NC_002937	ATGGA	2	10	101719	101728	40 %	20 %	40 %	0 %	46578499
105	NC_002937	GTGCC	2	10	103135	103144	0 %	20 %	40 %	40 %	46578501
106	NC_002937	CCATG	2	10	105262	105271	20 %	20 %	20 %	40 %	46578502
107	NC_002937	CTGTC	2	10	105420	105429	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_002937	CTTTT	2	10	110985	110994	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_002937	GTGCA	2	10	117401	117410	20 %	20 %	40 %	20 %	46578509
110	NC_002937	CATGG	2	10	122750	122759	20 %	20 %	40 %	20 %	46578510
111	NC_002937	TGCGG	2	10	123030	123039	0 %	20 %	60 %	20 %	46578510
112	NC_002937	CGGTG	2	10	123207	123216	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_002937	CACCC	2	10	123728	123737	20 %	0 %	0 %	80 %	46578511
114	NC_002937	CGCAG	2	10	124657	124666	20 %	0 %	40 %	40 %	46578511
115	NC_002937	CCACG	2	10	127567	127576	20 %	0 %	20 %	60 %	46578514
116	NC_002937	GCGCC	2	10	128095	128104	0 %	0 %	40 %	60 %	46578514
117	NC_002937	TTGCC	2	10	130227	130236	0 %	40 %	20 %	40 %	46578516
118	NC_002937	GGTGA	2	10	130395	130404	20 %	20 %	60 %	0 %	46578516
119	NC_002937	TGTCG	2	10	130528	130537	0 %	40 %	40 %	20 %	46578516
120	NC_002937	TGCCC	2	10	130696	130705	0 %	20 %	20 %	60 %	46578516
121	NC_002937	TGAAC	2	10	131229	131238	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_002937	GGGCA	2	10	132251	132260	20 %	0 %	60 %	20 %	46578517
123	NC_002937	GGTGA	2	10	132343	132352	20 %	20 %	60 %	0 %	46578517
124	NC_002937	GGCGC	2	10	136925	136934	0 %	0 %	60 %	40 %	46578520
125	NC_002937	GTTCT	2	10	137076	137085	0 %	60 %	20 %	20 %	46578520
126	NC_002937	CTCTT	2	10	137846	137855	0 %	60 %	0 %	40 %	46578521
127	NC_002937	TGATT	2	10	140846	140855	20 %	60 %	20 %	0 %	46578525
128	NC_002937	TGCGT	2	10	144169	144178	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_002937	AGTGC	2	10	144688	144697	20 %	20 %	40 %	20 %	46578528
130	NC_002937	TACGC	2	10	145527	145536	20 %	20 %	20 %	40 %	46578529
131	NC_002937	TGCGG	2	10	146135	146144	0 %	20 %	60 %	20 %	46578529
132	NC_002937	GGGCG	2	10	148403	148412	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
133	NC_002937	CGCTG	2	10	151794	151803	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_002937	CCGTG	2	10	152566	152575	0 %	20 %	40 %	40 %	46578535
135	NC_002937	GCGTG	2	10	153287	153296	0 %	20 %	60 %	20 %	46578535
136	NC_002937	GGCAT	2	10	153874	153883	20 %	20 %	40 %	20 %	46578536
137	NC_002937	GCGGG	2	10	154064	154073	0 %	0 %	80 %	20 %	46578536
138	NC_002937	GTCCC	2	10	155613	155622	0 %	20 %	20 %	60 %	46578537
139	NC_002937	CGTGC	2	10	156452	156461	0 %	20 %	40 %	40 %	46578538
140	NC_002937	GGGAA	2	10	157893	157902	40 %	0 %	60 %	0 %	46578541
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142	NC_002937	AGGGG	2	10	160359	160368	20 %	0 %	80 %	0 %	46578543
143	NC_002937	GGGTG	2	10	160437	160446	0 %	20 %	80 %	0 %	46578543
144	NC_002937	AGGGC	2	10	160462	160471	20 %	0 %	60 %	20 %	46578543
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163	NC_002937	CGCGT	2	10	183860	183869	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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261	NC_002937	GACGT	2	10	324096	324105	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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269	NC_002937	CATGC	2	10	331388	331397	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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272	NC_002937	CGGGC	2	10	331995	332004	0 %	0 %	60 %	40 %	46578701
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403	NC_002937	GGCAT	2	10	495935	495944	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
404	NC_002937	CACGT	2	10	498111	498120	20 %	20 %	20 %	40 %	46578857
405	NC_002937	AGGGC	2	10	498932	498941	20 %	0 %	60 %	20 %	46578857
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