MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough chromosome

Total Repeats: 79621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002937	GAA	2	6	2	7	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002937	TCA	2	6	69	74	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002937	CCGG	2	8	84	91	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002937	CCG	2	6	98	103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_002937	TGC	2	6	152	157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578418
6	NC_002937	CGA	2	6	240	245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578418
7	NC_002937	GCA	2	6	249	254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578418
8	NC_002937	GGT	2	6	293	298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46578418
9	NC_002937	CCG	2	6	326	331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46578418
10	NC_002937	CGT	2	6	342	347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578418
11	NC_002937	C	6	6	412	417	0 %	0 %	0 %	100 %	46578418
12	NC_002937	C	7	7	424	430	0 %	0 %	0 %	100 %	46578418
13	NC_002937	TCA	2	6	485	490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46578418
14	NC_002937	GCC	2	6	517	522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46578418
15	NC_002937	GC	3	6	523	528	0 %	0 %	50 %	50 %	46578418
16	NC_002937	GC	3	6	535	540	0 %	0 %	50 %	50 %	46578418
17	NC_002937	CGGCAA	2	12	588	599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578418
18	NC_002937	AC	3	6	601	606	50 %	0 %	0 %	50 %	46578418
19	NC_002937	CTG	2	6	607	612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578418
20	NC_002937	GGC	2	6	633	638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46578418
21	NC_002937	ACGGA	2	10	644	653	40 %	0 %	40 %	20 %	46578418
22	NC_002937	TCT	2	6	659	664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46578418
23	NC_002937	ACA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46578418
24	NC_002937	GGA	2	6	702	707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46578418
25	NC_002937	GCG	2	6	720	725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46578418
26	NC_002937	CT	3	6	728	733	0 %	50 %	0 %	50 %	46578418
27	NC_002937	GC	3	6	734	739	0 %	0 %	50 %	50 %	46578418
28	NC_002937	GAC	2	6	757	762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578418
29	NC_002937	GGA	2	6	795	800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46578418
30	NC_002937	TCG	2	6	926	931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578418
31	NC_002937	GCC	2	6	985	990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46578418
32	NC_002937	TC	3	6	1056	1061	0 %	50 %	0 %	50 %	46578418
33	NC_002937	TGG	2	6	1097	1102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46578418
34	NC_002937	CAT	2	6	1185	1190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46578418
35	NC_002937	C	6	6	1220	1225	0 %	0 %	0 %	100 %	46578418
36	NC_002937	A	7	7	1375	1381	100 %	0 %	0 %	0 %	46578418
37	NC_002937	A	6	6	1384	1389	100 %	0 %	0 %	0 %	46578418
38	NC_002937	ATG	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46578418
39	NC_002937	GCA	2	6	1520	1525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_002937	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_002937	GAAAA	2	10	1589	1598	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002937	GTAT	2	8	1608	1615	25 %	50 %	25 %	0 %	46578419
43	NC_002937	GGC	2	6	1657	1662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46578419
44	NC_002937	CAT	2	6	1666	1671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46578419
45	NC_002937	CCG	2	6	1782	1787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46578419
46	NC_002937	GC	3	6	1822	1827	0 %	0 %	50 %	50 %	46578419
47	NC_002937	TCG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578419
48	NC_002937	CTG	2	6	1838	1843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578419
49	NC_002937	GCC	2	6	1914	1919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46578419
50	NC_002937	CTTC	2	8	2008	2015	0 %	50 %	0 %	50 %	46578419
51	NC_002937	ATCG	2	8	2024	2031	25 %	25 %	25 %	25 %	46578419
52	NC_002937	GCCT	2	8	2075	2082	0 %	25 %	25 %	50 %	46578419
53	NC_002937	GAC	2	6	2165	2170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578419
54	NC_002937	AGA	2	6	2208	2213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46578419
55	NC_002937	AAG	2	6	2231	2236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46578419
56	NC_002937	CGA	2	6	2248	2253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578419
57	NC_002937	GACG	2	8	2300	2307	25 %	0 %	50 %	25 %	46578419
58	NC_002937	CT	3	6	2325	2330	0 %	50 %	0 %	50 %	46578419
59	NC_002937	CGT	2	6	2331	2336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578419
60	NC_002937	AAGG	2	8	2411	2418	50 %	0 %	50 %	0 %	46578419
61	NC_002937	ACA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46578419
62	NC_002937	GGT	2	6	2497	2502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46578419
63	NC_002937	ACG	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578419
64	NC_002937	CCG	2	6	2572	2577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46578419
65	NC_002937	CAT	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46578419
66	NC_002937	GTC	2	6	2631	2636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578419
67	NC_002937	GAA	2	6	2684	2689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46578419
68	NC_002937	CTA	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46578419
69	NC_002937	GAA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46578419
70	NC_002937	ACC	2	6	2769	2774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46578420
71	NC_002937	CAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46578420
72	NC_002937	CAC	2	6	2883	2888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46578420
73	NC_002937	CGA	2	6	2918	2923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578420
74	NC_002937	GGT	3	9	2948	2956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46578420
75	NC_002937	ACA	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46578420
76	NC_002937	AGG	2	6	3028	3033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46578420
77	NC_002937	GTC	2	6	3051	3056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578420
78	NC_002937	G	6	6	3074	3079	0 %	0 %	100 %	0 %	46578420
79	NC_002937	ACA	2	6	3088	3093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46578420
80	NC_002937	CGG	2	6	3110	3115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46578420
81	NC_002937	TGGCGT	2	12	3122	3133	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	46578420
82	NC_002937	AGG	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46578420
83	NC_002937	CAC	2	6	3266	3271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46578420
84	NC_002937	GAG	2	6	3291	3296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46578420
85	NC_002937	ACCA	2	8	3306	3313	50 %	0 %	0 %	50 %	46578420
86	NC_002937	GAA	2	6	3345	3350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46578420
87	NC_002937	CGA	2	6	3389	3394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578420
88	NC_002937	GCG	2	6	3400	3405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46578420
89	NC_002937	CTT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46578420
90	NC_002937	GGC	2	6	3429	3434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46578420
91	NC_002937	CATC	2	8	3476	3483	25 %	25 %	0 %	50 %	46578420
92	NC_002937	GTG	2	6	3516	3521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46578420
93	NC_002937	CAA	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46578420
94	NC_002937	AAGG	2	8	3594	3601	50 %	0 %	50 %	0 %	46578420
95	NC_002937	GCAC	2	8	3604	3611	25 %	0 %	25 %	50 %	46578420
96	NC_002937	AAG	2	6	3681	3686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46578420
97	NC_002937	CGA	2	6	3710	3715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578420
98	NC_002937	AGACCA	2	12	3778	3789	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	46578420
99	NC_002937	GAG	2	6	3858	3863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46578420
100	NC_002937	TCA	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46578420
101	NC_002937	GCC	2	6	3906	3911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46578420
102	NC_002937	CGC	2	6	3930	3935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46578420
103	NC_002937	GC	3	6	3961	3966	0 %	0 %	50 %	50 %	46578420
104	NC_002937	TCG	2	6	4039	4044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578420
105	NC_002937	ACGC	2	8	4136	4143	25 %	0 %	25 %	50 %	46578420
106	NC_002937	CAA	2	6	4163	4168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46578420
107	NC_002937	TCA	2	6	4183	4188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46578420
108	NC_002937	GAC	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578420
109	NC_002937	TCA	2	6	4255	4260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46578420
110	NC_002937	CCGACG	2	12	4264	4275	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46578420
111	NC_002937	GCT	3	9	4298	4306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578420
112	NC_002937	TTC	3	9	4311	4319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46578420
113	NC_002937	GCC	2	6	4367	4372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46578420
114	NC_002937	TCA	2	6	4408	4413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46578420
115	NC_002937	GAC	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578420
116	NC_002937	CAA	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46578420
117	NC_002937	CTG	2	6	4440	4445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578420
118	NC_002937	CGG	2	6	4481	4486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46578420
119	NC_002937	GC	3	6	4545	4550	0 %	0 %	50 %	50 %	46578420
120	NC_002937	CGG	2	6	4567	4572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46578420
121	NC_002937	AGC	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578420
122	NC_002937	CTGG	2	8	4667	4674	0 %	25 %	50 %	25 %	46578420
123	NC_002937	CGA	2	6	4715	4720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578420
124	NC_002937	GTG	2	6	4737	4742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46578420
125	NC_002937	TTC	2	6	4785	4790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46578420
126	NC_002937	GCG	2	6	4846	4851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46578420
127	NC_002937	GA	3	6	4879	4884	50 %	0 %	50 %	0 %	46578420
128	NC_002937	GGGTGA	2	12	4889	4900	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	46578420
129	NC_002937	CGC	2	6	4938	4943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46578420
130	NC_002937	AGC	2	6	4990	4995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578420
131	NC_002937	ACC	2	6	5004	5009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46578420
132	NC_002937	GCGA	2	8	5064	5071	25 %	0 %	50 %	25 %	46578420
133	NC_002937	GGT	2	6	5184	5189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002937	CCCG	2	8	5232	5239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_002937	AGGC	2	8	5310	5317	25 %	0 %	50 %	25 %	46578421
136	NC_002937	TCA	2	6	5389	5394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46578421
137	NC_002937	CAT	2	6	5447	5452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46578421
138	NC_002937	GCA	2	6	5459	5464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578421
139	NC_002937	ACA	2	6	5482	5487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46578421
140	NC_002937	AAG	2	6	5496	5501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46578421
141	NC_002937	GC	3	6	5505	5510	0 %	0 %	50 %	50 %	46578421
142	NC_002937	TCG	2	6	5512	5517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578421
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145	NC_002937	TGG	2	6	5611	5616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46578421
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151	NC_002937	GTG	2	6	5775	5780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46578421
152	NC_002937	CG	3	6	5788	5793	0 %	0 %	50 %	50 %	46578421
153	NC_002937	CTG	2	6	5802	5807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578421
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156	NC_002937	CTG	2	6	5886	5891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578421
157	NC_002937	CGA	3	9	5900	5908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578421
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160	NC_002937	ACC	2	6	6006	6011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46578421
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163	NC_002937	TCG	2	6	6121	6126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578421
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172	NC_002937	GGT	2	6	6479	6484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46578421
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232	NC_002937	TCA	2	6	8896	8901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
233	NC_002937	ACG	2	6	8950	8955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578423
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241	NC_002937	GA	3	6	9439	9444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_002937	GCTG	2	8	9767	9774	0 %	25 %	50 %	25 %	46578424
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255	NC_002937	GCG	2	6	10105	10110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46578424
256	NC_002937	GCG	2	6	10125	10130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46578424
257	NC_002937	CAC	2	6	10131	10136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46578424
258	NC_002937	ATC	2	6	10204	10209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46578424
259	NC_002937	CGG	2	6	10217	10222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46578424
260	NC_002937	GCG	2	6	10229	10234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46578424
261	NC_002937	CCAGCG	2	12	10289	10300	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46578424
262	NC_002937	GAA	2	6	10347	10352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46578424
263	NC_002937	GGT	2	6	10407	10412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46578424
264	NC_002937	AGA	2	6	10475	10480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46578424
265	NC_002937	ATGG	2	8	10503	10510	25 %	25 %	50 %	0 %	46578424
266	NC_002937	GGC	2	6	10515	10520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46578424
267	NC_002937	GC	3	6	10564	10569	0 %	0 %	50 %	50 %	46578424
268	NC_002937	TGC	2	6	10580	10585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578424
269	NC_002937	TCG	2	6	10594	10599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578424
270	NC_002937	CTT	2	6	10608	10613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46578424
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272	NC_002937	CGT	2	6	10814	10819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578424
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274	NC_002937	CGA	2	6	10916	10921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46578424
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276	NC_002937	CCGGG	2	10	10971	10980	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
277	NC_002937	TCCGTG	2	12	11009	11020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_002937	TAA	2	6	11385	11390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_002937	GA	3	6	11530	11535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_002937	TCG	2	6	16724	16729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46578430
401	NC_002937	CCG	2	6	16760	16765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46578430
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