MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Deinococcus radiodurans R1 chromosome 2

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001264	A	7	7	124	130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001264	T	6	6	539	544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001264	T	6	6	579	584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001264	A	7	7	4667	4673	100 %	0 %	0 %	0 %	15807676
5	NC_001264	G	8	8	5918	5925	0 %	0 %	100 %	0 %	15807678
6	NC_001264	G	6	6	6074	6079	0 %	0 %	100 %	0 %	15807678
7	NC_001264	G	6	6	6634	6639	0 %	0 %	100 %	0 %	15807678
8	NC_001264	C	6	6	8489	8494	0 %	0 %	0 %	100 %	15807680
9	NC_001264	C	6	6	11681	11686	0 %	0 %	0 %	100 %	15807683
10	NC_001264	C	6	6	13110	13115	0 %	0 %	0 %	100 %	161579495
11	NC_001264	A	6	6	13567	13572	100 %	0 %	0 %	0 %	15807685
12	NC_001264	C	6	6	16060	16065	0 %	0 %	0 %	100 %	15807687
13	NC_001264	A	7	7	18419	18425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001264	T	6	6	18458	18463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001264	T	6	6	20037	20042	0 %	100 %	0 %	0 %	15808028
16	NC_001264	A	6	6	21832	21837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001264	G	6	6	24948	24953	0 %	0 %	100 %	0 %	15807694
18	NC_001264	C	6	6	24981	24986	0 %	0 %	0 %	100 %	15807694
19	NC_001264	C	6	6	26997	27002	0 %	0 %	0 %	100 %	15808029
20	NC_001264	C	6	6	27570	27575	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_001264	T	6	6	30268	30273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001264	C	6	6	34050	34055	0 %	0 %	0 %	100 %	15807701
23	NC_001264	G	6	6	37147	37152	0 %	0 %	100 %	0 %	15807703
24	NC_001264	C	8	8	37339	37346	0 %	0 %	0 %	100 %	15807703
25	NC_001264	A	6	6	39453	39458	100 %	0 %	0 %	0 %	15807705
26	NC_001264	G	6	6	40171	40176	0 %	0 %	100 %	0 %	15807705
27	NC_001264	T	8	8	40943	40950	0 %	100 %	0 %	0 %	15807706
28	NC_001264	T	6	6	41475	41480	0 %	100 %	0 %	0 %	15807706
29	NC_001264	T	6	6	43042	43047	0 %	100 %	0 %	0 %	15807708
30	NC_001264	G	6	6	46776	46781	0 %	0 %	100 %	0 %	15807712
31	NC_001264	G	6	6	49655	49660	0 %	0 %	100 %	0 %	15807715
32	NC_001264	G	6	6	52047	52052	0 %	0 %	100 %	0 %	15807717
33	NC_001264	G	6	6	55903	55908	0 %	0 %	100 %	0 %	15807720
34	NC_001264	A	6	6	56149	56154	100 %	0 %	0 %	0 %	15807720
35	NC_001264	A	6	6	57628	57633	100 %	0 %	0 %	0 %	15807721
36	NC_001264	C	6	6	60019	60024	0 %	0 %	0 %	100 %	15807723
37	NC_001264	T	6	6	61123	61128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001264	T	6	6	61440	61445	0 %	100 %	0 %	0 %	15807725
39	NC_001264	T	6	6	63491	63496	0 %	100 %	0 %	0 %	15807726
40	NC_001264	C	6	6	65589	65594	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_001264	G	6	6	68245	68250	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001264	G	6	6	69551	69556	0 %	0 %	100 %	0 %	15807732
43	NC_001264	G	6	6	70868	70873	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001264	A	7	7	70911	70917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001264	C	6	6	71042	71047	0 %	0 %	0 %	100 %	15807733
46	NC_001264	G	6	6	71486	71491	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001264	T	7	7	71494	71500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001264	C	6	6	71768	71773	0 %	0 %	0 %	100 %	15807734
49	NC_001264	A	7	7	73035	73041	100 %	0 %	0 %	0 %	15807735
50	NC_001264	G	6	6	73679	73684	0 %	0 %	100 %	0 %	15807736
51	NC_001264	C	6	6	73903	73908	0 %	0 %	0 %	100 %	15807736
52	NC_001264	T	6	6	74041	74046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001264	T	7	7	78944	78950	0 %	100 %	0 %	0 %	15807741
54	NC_001264	G	6	6	80402	80407	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001264	T	7	7	80463	80469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001264	A	6	6	80496	80501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001264	G	6	6	80702	80707	0 %	0 %	100 %	0 %	15807743
58	NC_001264	C	6	6	86835	86840	0 %	0 %	0 %	100 %	15807753
59	NC_001264	A	6	6	88552	88557	100 %	0 %	0 %	0 %	15807756
60	NC_001264	G	8	8	88983	88990	0 %	0 %	100 %	0 %	15807758
61	NC_001264	G	6	6	89284	89289	0 %	0 %	100 %	0 %	15807758
62	NC_001264	C	6	6	89302	89307	0 %	0 %	0 %	100 %	15807758
63	NC_001264	T	6	6	89308	89313	0 %	100 %	0 %	0 %	15807758
64	NC_001264	C	6	6	89982	89987	0 %	0 %	0 %	100 %	15807760
65	NC_001264	G	6	6	90916	90921	0 %	0 %	100 %	0 %	15807762
66	NC_001264	G	7	7	92680	92686	0 %	0 %	100 %	0 %	15807764
67	NC_001264	T	6	6	94261	94266	0 %	100 %	0 %	0 %	15807766
68	NC_001264	G	6	6	94568	94573	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001264	C	6	6	94670	94675	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_001264	G	6	6	96147	96152	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001264	T	6	6	96154	96159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001264	C	6	6	97587	97592	0 %	0 %	0 %	100 %	15807771
73	NC_001264	G	6	6	105579	105584	0 %	0 %	100 %	0 %	15807778
74	NC_001264	C	7	7	107001	107007	0 %	0 %	0 %	100 %	15807779
75	NC_001264	C	6	6	108244	108249	0 %	0 %	0 %	100 %	15807780
76	NC_001264	G	7	7	108623	108629	0 %	0 %	100 %	0 %	15807780
77	NC_001264	G	6	6	108992	108997	0 %	0 %	100 %	0 %	15807780
78	NC_001264	C	6	6	109006	109011	0 %	0 %	0 %	100 %	15807780
79	NC_001264	A	7	7	110034	110040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001264	C	6	6	110244	110249	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_001264	C	6	6	110356	110361	0 %	0 %	0 %	100 %	15807781
82	NC_001264	T	6	6	113294	113299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001264	A	6	6	117114	117119	100 %	0 %	0 %	0 %	15807789
84	NC_001264	G	6	6	126012	126017	0 %	0 %	100 %	0 %	15807796
85	NC_001264	C	7	7	127387	127393	0 %	0 %	0 %	100 %	15807798
86	NC_001264	G	6	6	128870	128875	0 %	0 %	100 %	0 %	15807799
87	NC_001264	C	6	6	132865	132870	0 %	0 %	0 %	100 %	15807802
88	NC_001264	A	6	6	134604	134609	100 %	0 %	0 %	0 %	15807803
89	NC_001264	C	6	6	134639	134644	0 %	0 %	0 %	100 %	15807803
90	NC_001264	A	6	6	134933	134938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001264	C	6	6	137174	137179	0 %	0 %	0 %	100 %	15807805
92	NC_001264	T	6	6	137348	137353	0 %	100 %	0 %	0 %	15807805
93	NC_001264	T	6	6	137532	137537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001264	T	6	6	139388	139393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001264	A	6	6	140873	140878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_001264	T	6	6	141468	141473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001264	A	7	7	141599	141605	100 %	0 %	0 %	0 %	15807811
98	NC_001264	T	6	6	146736	146741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001264	G	6	6	150229	150234	0 %	0 %	100 %	0 %	15807818
100	NC_001264	C	6	6	151030	151035	0 %	0 %	0 %	100 %	15807819
101	NC_001264	T	6	6	151919	151924	0 %	100 %	0 %	0 %	15807820
102	NC_001264	G	7	7	153479	153485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001264	G	6	6	154195	154200	0 %	0 %	100 %	0 %	15807821
104	NC_001264	G	7	7	157574	157580	0 %	0 %	100 %	0 %	15807825
105	NC_001264	G	6	6	159021	159026	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001264	C	8	8	160243	160250	0 %	0 %	0 %	100 %	15807828
107	NC_001264	A	6	6	161760	161765	100 %	0 %	0 %	0 %	15807829
108	NC_001264	G	6	6	164870	164875	0 %	0 %	100 %	0 %	15807834
109	NC_001264	C	6	6	166592	166597	0 %	0 %	0 %	100 %	15807835
110	NC_001264	A	6	6	168703	168708	100 %	0 %	0 %	0 %	15807835
111	NC_001264	C	6	6	168813	168818	0 %	0 %	0 %	100 %	15807835
112	NC_001264	A	6	6	169098	169103	100 %	0 %	0 %	0 %	15807835
113	NC_001264	G	6	6	169597	169602	0 %	0 %	100 %	0 %	15807835
114	NC_001264	T	6	6	170486	170491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001264	C	8	8	171402	171409	0 %	0 %	0 %	100 %	15807837
116	NC_001264	C	6	6	172342	172347	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
117	NC_001264	G	7	7	176160	176166	0 %	0 %	100 %	0 %	15807843
118	NC_001264	C	6	6	177334	177339	0 %	0 %	0 %	100 %	15807844
119	NC_001264	C	8	8	177686	177693	0 %	0 %	0 %	100 %	15807844
120	NC_001264	A	6	6	178227	178232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_001264	T	6	6	178459	178464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001264	C	7	7	178506	178512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
123	NC_001264	G	6	6	179461	179466	0 %	0 %	100 %	0 %	15807845
124	NC_001264	T	6	6	180106	180111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001264	C	7	7	180193	180199	0 %	0 %	0 %	100 %	15808031
126	NC_001264	C	6	6	180524	180529	0 %	0 %	0 %	100 %	15808031
127	NC_001264	G	6	6	181044	181049	0 %	0 %	100 %	0 %	15808031
128	NC_001264	G	6	6	181323	181328	0 %	0 %	100 %	0 %	15808031
129	NC_001264	T	7	7	181540	181546	0 %	100 %	0 %	0 %	15808031
130	NC_001264	T	6	6	185281	185286	0 %	100 %	0 %	0 %	15807848
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132	NC_001264	T	6	6	186561	186566	0 %	100 %	0 %	0 %	15807849
133	NC_001264	G	6	6	187322	187327	0 %	0 %	100 %	0 %	15807849
134	NC_001264	T	6	6	187502	187507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001264	G	7	7	188136	188142	0 %	0 %	100 %	0 %	15807850
136	NC_001264	T	7	7	188496	188502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_001264	T	6	6	188547	188552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_001264	G	6	6	189986	189991	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001264	G	6	6	190355	190360	0 %	0 %	100 %	0 %	15807852
141	NC_001264	G	6	6	191191	191196	0 %	0 %	100 %	0 %	15807853
142	NC_001264	C	6	6	193439	193444	0 %	0 %	0 %	100 %	15808032
143	NC_001264	C	9	9	197071	197079	0 %	0 %	0 %	100 %	15807855
144	NC_001264	C	6	6	199399	199404	0 %	0 %	0 %	100 %	15807856
145	NC_001264	C	6	6	200580	200585	0 %	0 %	0 %	100 %	15807857
146	NC_001264	C	6	6	201011	201016	0 %	0 %	0 %	100 %	15807857
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.