MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Deinococcus radiodurans R1 chromosome 2

Total Repeats: 10587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_001264	ATC	2	6	259347	259352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15807911
6502	NC_001264	CGA	2	6	259378	259383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807911
6503	NC_001264	AGG	2	6	259531	259536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15807911
6504	NC_001264	ATG	2	6	259584	259589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15807911
6505	NC_001264	CGA	2	6	259609	259614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807911
6506	NC_001264	TGA	2	6	259657	259662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15807911
6507	NC_001264	TGG	2	6	259663	259668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807911
6508	NC_001264	GGT	2	6	259685	259690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807911
6509	NC_001264	GCC	2	6	259691	259696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807911
6510	NC_001264	TGG	2	6	259723	259728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807911
6511	NC_001264	GCGCC	2	10	259741	259750	0 %	0 %	40 %	60 %	15807911
6512	NC_001264	AGT	2	6	259753	259758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15807911
6513	NC_001264	GAT	2	6	259802	259807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15807911
6514	NC_001264	CAGC	2	8	259877	259884	25 %	0 %	25 %	50 %	15807911
6515	NC_001264	GCC	2	6	259937	259942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807911
6516	NC_001264	GGT	2	6	259994	259999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807911
6517	NC_001264	GCGCC	2	10	260005	260014	0 %	0 %	40 %	60 %	15807911
6518	NC_001264	GCC	3	9	260057	260065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807911
6519	NC_001264	CGCC	2	8	260089	260096	0 %	0 %	25 %	75 %	15807911
6520	NC_001264	GCCGA	2	10	260109	260118	20 %	0 %	40 %	40 %	15807911
6521	NC_001264	GGT	2	6	260222	260227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807911
6522	NC_001264	GAT	2	6	260264	260269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15807911
6523	NC_001264	GCG	2	6	260307	260312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807911
6524	NC_001264	CAG	2	6	260327	260332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807911
6525	NC_001264	TGGG	2	8	260456	260463	0 %	25 %	75 %	0 %	15807912
6526	NC_001264	AGC	2	6	260540	260545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807912
6527	NC_001264	CAG	2	6	260548	260553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807912
6528	NC_001264	TGT	2	6	260613	260618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15807912
6529	NC_001264	CGTC	2	8	260637	260644	0 %	25 %	25 %	50 %	15807912
6530	NC_001264	GCG	2	6	260659	260664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807912
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6534	NC_001264	GTG	2	6	260788	260793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807912
6535	NC_001264	GCG	2	6	260815	260820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807912
6536	NC_001264	TGCCG	2	10	260829	260838	0 %	20 %	40 %	40 %	15807912
6537	NC_001264	AGC	2	6	260846	260851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807912
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6540	NC_001264	TCG	2	6	260918	260923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807912
6541	NC_001264	GCA	2	6	260937	260942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807912
6542	NC_001264	GCG	2	6	260943	260948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807912
6543	NC_001264	CGG	2	6	260988	260993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_001264	GCG	2	6	261019	261024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_001264	AAAGG	2	10	261039	261048	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_001264	AC	3	6	261133	261138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6547	NC_001264	ATGAG	2	10	261140	261149	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_001264	TCG	2	6	261209	261214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_001264	TGA	2	6	261237	261242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_001264	CA	3	6	261258	261263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6551	NC_001264	CA	3	6	261269	261274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6552	NC_001264	CCG	2	6	261277	261282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6553	NC_001264	GCA	2	6	261312	261317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_001264	CGC	2	6	261342	261347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6555	NC_001264	TTG	2	6	261450	261455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15807913
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6558	NC_001264	CTG	2	6	261523	261528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807913
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6560	NC_001264	GCA	2	6	261548	261553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807913
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6563	NC_001264	CCG	2	6	261575	261580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807913
6564	NC_001264	GCCC	2	8	261586	261593	0 %	0 %	25 %	75 %	15807913
6565	NC_001264	GACC	2	8	261618	261625	25 %	0 %	25 %	50 %	15807913
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6577	NC_001264	GCGG	2	8	262144	262151	0 %	0 %	75 %	25 %	15807913
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6583	NC_001264	CGC	3	9	262329	262337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807913
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6588	NC_001264	T	6	6	262497	262502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_001264	GA	3	6	262532	262537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_001264	TG	3	6	262539	262544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_001264	T	6	6	262621	262626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_001264	TGAC	2	8	262650	262657	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6593	NC_001264	GCA	2	6	262666	262671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_001264	GTCA	2	8	262682	262689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6595	NC_001264	CAAA	2	8	262693	262700	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6596	NC_001264	CCCCT	2	10	262726	262735	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6597	NC_001264	CGT	2	6	262777	262782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807914
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6601	NC_001264	GCGG	2	8	262912	262919	0 %	0 %	75 %	25 %	15807914
6602	NC_001264	ACC	2	6	262952	262957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15807914
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6605	NC_001264	TTGGCG	2	12	262985	262996	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15807914
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6608	NC_001264	GCG	3	9	263048	263056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807914
6609	NC_001264	CTT	2	6	263070	263075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15807914
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6615	NC_001264	CAG	2	6	263371	263376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807914
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6623	NC_001264	CCCGG	2	10	263694	263703	0 %	0 %	40 %	60 %	15807914
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6625	NC_001264	AGC	2	6	263750	263755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807914
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6873	NC_001264	CCG	3	9	273665	273673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807922
6874	NC_001264	CGC	2	6	273674	273679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807922
6875	NC_001264	CGT	2	6	273695	273700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807922
6876	NC_001264	GTCGCC	2	12	273727	273738	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15807922
6877	NC_001264	CTT	2	6	273798	273803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15807922
6878	NC_001264	CGA	2	6	273851	273856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807922
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6881	NC_001264	GGT	2	6	273942	273947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807922
6882	NC_001264	AGC	2	6	273967	273972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807922
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6887	NC_001264	GC	3	6	274234	274239	0 %	0 %	50 %	50 %	15807922
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6893	NC_001264	AGC	2	6	274492	274497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807922
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6904	NC_001264	TGT	2	6	275108	275113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15807922
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6906	NC_001264	CCG	2	6	275186	275191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807922
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6910	NC_001264	CGCC	2	8	275420	275427	0 %	0 %	25 %	75 %	15807922
6911	NC_001264	GTC	2	6	275442	275447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807922
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6917	NC_001264	CGT	2	6	275549	275554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807922
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6919	NC_001264	CCA	2	6	275633	275638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15807922
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6921	NC_001264	TTA	2	6	275824	275829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6922	NC_001264	GGCA	2	8	275845	275852	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6924	NC_001264	CTG	2	6	275894	275899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6995	NC_001264	GCC	2	6	277994	277999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807924
6996	NC_001264	TCG	2	6	278050	278055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807924
6997	NC_001264	TGA	2	6	278089	278094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15807924
6998	NC_001264	CGG	3	9	278113	278121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807924
6999	NC_001264	AGC	2	6	278124	278129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807924
7000	NC_001264	CCG	2	6	278134	278139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807924

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