MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Deinococcus radiodurans R1 chromosome 1

Total Repeats: 68158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_001263	GAA	2	6	178048	178053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15805213
4502	NC_001263	ACC	2	6	178083	178088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15805213
4503	NC_001263	CGA	2	6	178098	178103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805213
4504	NC_001263	CCT	2	6	178225	178230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15805213
4505	NC_001263	CGC	2	6	178242	178247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805213
4506	NC_001263	CGT	2	6	178295	178300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805213
4507	NC_001263	AGC	2	6	178326	178331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805213
4508	NC_001263	GGC	2	6	178340	178345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805213
4509	NC_001263	CAG	2	6	178406	178411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805213
4510	NC_001263	TGC	2	6	178429	178434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805213
4511	NC_001263	TCG	2	6	178447	178452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805214
4512	NC_001263	CGCC	2	8	178535	178542	0 %	0 %	25 %	75 %	15805214
4513	NC_001263	GAT	2	6	178574	178579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15805214
4514	NC_001263	CGC	2	6	178583	178588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805214
4515	NC_001263	GAA	2	6	178620	178625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15805214
4516	NC_001263	TGGC	2	8	178635	178642	0 %	25 %	50 %	25 %	15805214
4517	NC_001263	CAG	2	6	178665	178670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805214
4518	NC_001263	CTT	2	6	178703	178708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15805214
4519	NC_001263	GAA	2	6	178718	178723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15805214
4520	NC_001263	AAG	2	6	178731	178736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15805214
4521	NC_001263	AAG	3	9	178755	178763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15805214
4522	NC_001263	CAA	3	9	178796	178804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15805214
4523	NC_001263	GCTGG	2	10	178841	178850	0 %	20 %	60 %	20 %	15805214
4524	NC_001263	CTGC	2	8	178965	178972	0 %	25 %	25 %	50 %	15805214
4525	NC_001263	CGG	2	6	178987	178992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805214
4526	NC_001263	CAT	2	6	179052	179057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15805214
4527	NC_001263	TAC	2	6	179070	179075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15805214
4528	NC_001263	AAG	2	6	179127	179132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15805214
4529	NC_001263	CGCT	2	8	179164	179171	0 %	25 %	25 %	50 %	15805214
4530	NC_001263	CAA	2	6	179192	179197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15805214
4531	NC_001263	TTCA	2	8	179208	179215	25 %	50 %	0 %	25 %	15805214
4532	NC_001263	CAC	2	6	179222	179227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15805214
4533	NC_001263	ACA	2	6	179278	179283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15805214
4534	NC_001263	ACGG	2	8	179371	179378	25 %	0 %	50 %	25 %	15805214
4535	NC_001263	GAA	2	6	179453	179458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15805214
4536	NC_001263	GCG	2	6	179491	179496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805214
4537	NC_001263	CGA	2	6	179510	179515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805214
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4539	NC_001263	TGG	2	6	179548	179553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15805214
4540	NC_001263	CAG	2	6	179688	179693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805215
4541	NC_001263	GGCG	2	8	179697	179704	0 %	0 %	75 %	25 %	15805215
4542	NC_001263	GGC	2	6	179707	179712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805215
4543	NC_001263	CGA	2	6	179734	179739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805215
4544	NC_001263	CGC	2	6	179779	179784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805215
4545	NC_001263	GAG	2	6	179826	179831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15805215
4546	NC_001263	GCA	2	6	179836	179841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805215
4547	NC_001263	CGA	2	6	179909	179914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805215
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4549	NC_001263	TGC	3	9	180004	180012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805215
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4551	NC_001263	GGA	2	6	180092	180097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15805215
4552	NC_001263	GCT	2	6	180260	180265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805215
4553	NC_001263	GCC	2	6	180267	180272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805215
4554	NC_001263	CCCG	2	8	180336	180343	0 %	0 %	25 %	75 %	15805216
4555	NC_001263	CGG	2	6	180383	180388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805216
4556	NC_001263	GCCC	2	8	180393	180400	0 %	0 %	25 %	75 %	15805216
4557	NC_001263	CCG	2	6	180401	180406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805216
4558	NC_001263	CTG	2	6	180409	180414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805216
4559	NC_001263	GGA	2	6	180417	180422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15805216
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4562	NC_001263	CGA	2	6	180447	180452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805216
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4564	NC_001263	TGC	2	6	180608	180613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805216
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4570	NC_001263	GGT	2	6	180822	180827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15805216
4571	NC_001263	GACCT	2	10	180844	180853	20 %	20 %	20 %	40 %	15805216
4572	NC_001263	ACG	2	6	180854	180859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805216
4573	NC_001263	GCT	2	6	180936	180941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805216
4574	NC_001263	GAA	2	6	180981	180986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_001263	TGA	2	6	181017	181022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_001263	GCT	2	6	181073	181078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4578	NC_001263	AATG	2	8	181106	181113	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_001263	GCA	2	6	181160	181165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805217
4580	NC_001263	TCA	2	6	181204	181209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15805217
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4587	NC_001263	TGC	3	9	181354	181362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805217
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4589	NC_001263	AG	3	6	181484	181489	50 %	0 %	50 %	0 %	15805217
4590	NC_001263	CCGC	2	8	181565	181572	0 %	0 %	25 %	75 %	15805218
4591	NC_001263	ACG	2	6	181603	181608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805218
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4593	NC_001263	CGCC	2	8	181631	181638	0 %	0 %	25 %	75 %	15805218
4594	NC_001263	GCC	2	6	181668	181673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805218
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4597	NC_001263	CAG	2	6	181770	181775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805218
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4601	NC_001263	GCTGGT	2	12	181935	181946	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15805218
4602	NC_001263	CGCC	2	8	182030	182037	0 %	0 %	25 %	75 %	15805218
4603	NC_001263	CGC	3	9	182081	182089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805218
4604	NC_001263	GAC	2	6	182094	182099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805218
4605	NC_001263	TGC	2	6	182161	182166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805218
4606	NC_001263	GCC	2	6	182241	182246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805218
4607	NC_001263	ACC	2	6	182254	182259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15805218
4608	NC_001263	CGG	2	6	182282	182287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805218
4609	NC_001263	CCA	2	6	182342	182347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15805218
4610	NC_001263	GCG	2	6	182394	182399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805218
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4612	NC_001263	TTC	2	6	182467	182472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15805218
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4616	NC_001263	CCAGC	2	10	182522	182531	20 %	0 %	20 %	60 %	15805218
4617	NC_001263	CAC	2	6	182544	182549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15805218
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4620	NC_001263	CGGGG	2	10	182691	182700	0 %	0 %	80 %	20 %	15805218
4621	NC_001263	GTT	2	6	182727	182732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15805218
4622	NC_001263	GCA	2	6	182741	182746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805218
4623	NC_001263	GTC	2	6	182766	182771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805218
4624	NC_001263	GTT	2	6	182784	182789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15805218
4625	NC_001263	GAT	2	6	182799	182804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15805218
4626	NC_001263	GTT	2	6	182805	182810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15805218
4627	NC_001263	GTT	2	6	182823	182828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15805218
4628	NC_001263	GGCCGA	2	12	182874	182885	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15805218
4629	NC_001263	GCA	2	6	182894	182899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805218
4630	NC_001263	GTT	2	6	182960	182965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15805218
4631	NC_001263	G	6	6	183030	183035	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_001263	GTC	2	6	183041	183046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4633	NC_001263	GCC	2	6	183099	183104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805219
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4635	NC_001263	GTG	2	6	183139	183144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15805219
4636	NC_001263	CGG	2	6	183146	183151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805219
4637	NC_001263	TGCG	2	8	183175	183182	0 %	25 %	50 %	25 %	15805219
4638	NC_001263	CTT	2	6	183228	183233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15805219
4639	NC_001263	GTC	2	6	183249	183254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805219
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4642	NC_001263	TCG	2	6	183325	183330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805219
4643	NC_001263	TGA	2	6	183349	183354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15805219
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4645	NC_001263	CGT	2	6	183446	183451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805219
4646	NC_001263	CGC	3	9	183464	183472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805219
4647	NC_001263	CGC	2	6	183480	183485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805219
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4651	NC_001263	TCG	2	6	183638	183643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805219
4652	NC_001263	GAT	3	9	183666	183674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15805219
4653	NC_001263	GTT	2	6	183675	183680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15805219
4654	NC_001263	ACC	2	6	183715	183720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15805219
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4658	NC_001263	GGCGG	2	10	183966	183975	0 %	0 %	80 %	20 %	15805219
4659	NC_001263	CGG	2	6	184052	184057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805219
4660	NC_001263	GCCC	2	8	184119	184126	0 %	0 %	25 %	75 %	15805219
4661	NC_001263	GTC	2	6	184158	184163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805219
4662	NC_001263	CCT	2	6	184202	184207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15805219
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4700	NC_001263	ATGCCG	2	12	185485	185496	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15805219
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4702	NC_001263	AGGT	2	8	185587	185594	25 %	25 %	50 %	0 %	15805219
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4724	NC_001263	TCG	2	6	186541	186546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805219
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4732	NC_001263	TCG	2	6	186823	186828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805219
4733	NC_001263	AGC	2	6	186829	186834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805219
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4740	NC_001263	ACG	2	6	187135	187140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805219
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4744	NC_001263	GTA	2	6	187251	187256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15805219
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4746	NC_001263	CG	3	6	187299	187304	0 %	0 %	50 %	50 %	15805219
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4765	NC_001263	GCT	2	6	188033	188038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4982	NC_001263	TGGA	2	8	195573	195580	25 %	25 %	50 %	0 %	15805227
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4986	NC_001263	CCA	2	6	195728	195733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15805227
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4989	NC_001263	GCT	2	6	195794	195799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805227
4990	NC_001263	GCTC	2	8	195820	195827	0 %	25 %	25 %	50 %	15805227
4991	NC_001263	CGA	3	9	195869	195877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805227
4992	NC_001263	CTG	2	6	195906	195911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805227
4993	NC_001263	G	6	6	195917	195922	0 %	0 %	100 %	0 %	15805227
4994	NC_001263	CAGTC	2	10	195940	195949	20 %	20 %	20 %	40 %	15805227
4995	NC_001263	CGG	2	6	196009	196014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805227
4996	NC_001263	CGCTGG	2	12	196081	196092	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15805227
4997	NC_001263	GGT	2	6	196103	196108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15805227
4998	NC_001263	GCT	2	6	196151	196156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805227
4999	NC_001263	CGC	2	6	196183	196188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805227
5000	NC_001263	GGC	2	6	196215	196220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805227

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