MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Deinococcus radiodurans R1 plasmid MP1

Total Repeats: 4035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000958	CGG	2	6	44499	44504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957497
1002	NC_000958	GGT	2	6	44527	44532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957497
1003	NC_000958	CTC	2	6	44553	44558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957513
1004	NC_000958	GCT	2	6	44584	44589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957513
1005	NC_000958	GCC	2	6	44609	44614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957513
1006	NC_000958	GCCC	2	8	44617	44624	0 %	0 %	25 %	75 %	10957513
1007	NC_000958	CCT	2	6	44630	44635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957513
1008	NC_000958	GCC	2	6	44696	44701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957513
1009	NC_000958	CGG	2	6	44722	44727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957513
1010	NC_000958	CTG	2	6	44753	44758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957513
1011	NC_000958	CCG	2	6	44775	44780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957513
1012	NC_000958	GGT	2	6	44788	44793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957513
1013	NC_000958	GCA	2	6	44799	44804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957513
1014	NC_000958	TCCCC	2	10	44821	44830	0 %	20 %	0 %	80 %	10957513
1015	NC_000958	GACCC	2	10	44831	44840	20 %	0 %	20 %	60 %	10957513
1016	NC_000958	GGC	2	6	44932	44937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957513
1017	NC_000958	CGC	2	6	44939	44944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957513
1018	NC_000958	GTG	2	6	44971	44976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957513
1019	NC_000958	TGG	2	6	44995	45000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957498
1020	NC_000958	TGG	2	6	45124	45129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957498
1021	NC_000958	CTA	2	6	45242	45247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957498
1022	NC_000958	GCA	2	6	45367	45372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957498
1023	NC_000958	GTGCGG	2	12	45378	45389	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	10957498
1024	NC_000958	GCCT	2	8	45412	45419	0 %	25 %	25 %	50 %	10957498
1025	NC_000958	AGC	2	6	45424	45429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957498
1026	NC_000958	CGCC	2	8	45473	45480	0 %	0 %	25 %	75 %	10957498
1027	NC_000958	CTG	2	6	45573	45578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957498
1028	NC_000958	CAG	2	6	45585	45590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957498
1029	NC_000958	CGG	2	6	45620	45625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957498
1030	NC_000958	GCG	2	6	45654	45659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957498
1031	NC_000958	G	6	6	45668	45673	0 %	0 %	100 %	0 %	10957498
1032	NC_000958	CTA	2	6	45716	45721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957498
1033	NC_000958	CGG	2	6	45737	45742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957498
1034	NC_000958	CGG	2	6	45757	45762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957498
1035	NC_000958	CAG	3	9	45821	45829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957498
1036	NC_000958	GCC	2	6	45864	45869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957498
1037	NC_000958	AGG	2	6	45910	45915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957498
1038	NC_000958	GTG	2	6	45927	45932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957498
1039	NC_000958	GCT	2	6	46004	46009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957498
1040	NC_000958	TGC	2	6	46036	46041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957498
1041	NC_000958	GCT	2	6	46058	46063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957498
1042	NC_000958	GGT	2	6	46109	46114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957498
1043	NC_000958	GCC	2	6	46147	46152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957498
1044	NC_000958	CG	3	6	46162	46167	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
1045	NC_000958	CGA	2	6	46184	46189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957498
1046	NC_000958	TCGC	2	8	46206	46213	0 %	25 %	25 %	50 %	10957498
1047	NC_000958	GC	3	6	46310	46315	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
1048	NC_000958	CGC	2	6	46352	46357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957498
1049	NC_000958	TGGA	2	8	46366	46373	25 %	25 %	50 %	0 %	10957498
1050	NC_000958	CGGCG	2	10	46385	46394	0 %	0 %	60 %	40 %	10957498
1051	NC_000958	GCG	2	6	46403	46408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957498
1052	NC_000958	G	6	6	46410	46415	0 %	0 %	100 %	0 %	10957498
1053	NC_000958	GCT	2	6	46436	46441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957498
1054	NC_000958	CGG	2	6	46445	46450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957498
1055	NC_000958	AGGCCG	2	12	46456	46467	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	10957498
1056	NC_000958	GCA	2	6	46486	46491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957498
1057	NC_000958	GC	3	6	46565	46570	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
1058	NC_000958	GCC	2	6	46611	46616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957498
1059	NC_000958	GC	4	8	46634	46641	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
1060	NC_000958	CGG	3	9	46670	46678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957498
1061	NC_000958	CG	3	6	46710	46715	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
1062	NC_000958	GCG	2	6	46732	46737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957498
1063	NC_000958	GCC	2	6	46776	46781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957498
1064	NC_000958	CAGC	2	8	46829	46836	25 %	0 %	25 %	50 %	10957498
1065	NC_000958	GACC	2	8	46913	46920	25 %	0 %	25 %	50 %	10957498
1066	NC_000958	GCGG	2	8	47013	47020	0 %	0 %	75 %	25 %	10957498
1067	NC_000958	GC	3	6	47070	47075	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
1068	NC_000958	GC	3	6	47168	47173	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
1069	NC_000958	CCTGG	2	10	47195	47204	0 %	20 %	40 %	40 %	10957498
1070	NC_000958	GGT	2	6	47225	47230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957498
1071	NC_000958	GCG	2	6	47233	47238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957498
1072	NC_000958	GCG	2	6	47245	47250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957498
1073	NC_000958	CGG	2	6	47287	47292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957498
1074	NC_000958	CGG	2	6	47462	47467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957498
1075	NC_000958	CG	3	6	47478	47483	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
1076	NC_000958	GC	3	6	47531	47536	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
1077	NC_000958	GGGCGC	2	12	47569	47580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957498
1078	NC_000958	CAG	2	6	47594	47599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957498
1079	NC_000958	CCCG	2	8	47716	47723	0 %	0 %	25 %	75 %	10957498
1080	NC_000958	AAG	2	6	47769	47774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957498
1081	NC_000958	CCG	2	6	47789	47794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957498
1082	NC_000958	GCC	3	9	47800	47808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_000958	GCG	2	6	47813	47818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_000958	GCC	2	6	47842	47847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957454
1085	NC_000958	GCC	2	6	47856	47861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957454
1086	NC_000958	AGG	2	6	47903	47908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957454
1087	NC_000958	GCT	2	6	47922	47927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957454
1088	NC_000958	GGT	2	6	47934	47939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957454
1089	NC_000958	GTG	2	6	47953	47958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957454
1090	NC_000958	AGC	2	6	47966	47971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957454
1091	NC_000958	CTC	2	6	48031	48036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957454
1092	NC_000958	GCA	2	6	48072	48077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957454
1093	NC_000958	A	6	6	48085	48090	100 %	0 %	0 %	0 %	10957454
1094	NC_000958	GCT	2	6	48099	48104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957454
1095	NC_000958	TCG	2	6	48131	48136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957454
1096	NC_000958	CTCAC	2	10	48143	48152	20 %	20 %	0 %	60 %	10957454
1097	NC_000958	CAT	3	9	48154	48162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957454
1098	NC_000958	TCG	2	6	48191	48196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957454
1099	NC_000958	CGG	2	6	48237	48242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957454
1100	NC_000958	CGG	2	6	48321	48326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957454
1101	NC_000958	CAG	2	6	48331	48336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957454
1102	NC_000958	CG	3	6	48365	48370	0 %	0 %	50 %	50 %	10957454
1103	NC_000958	GC	3	6	48405	48410	0 %	0 %	50 %	50 %	10957454
1104	NC_000958	CAG	2	6	48412	48417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957454
1105	NC_000958	TCC	2	6	48437	48442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957454
1106	NC_000958	GCG	2	6	48448	48453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957454
1107	NC_000958	CGG	2	6	48474	48479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957454
1108	NC_000958	GCC	2	6	48500	48505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957454
1109	NC_000958	TCT	2	6	48545	48550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957454
1110	NC_000958	GCG	2	6	48570	48575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957454
1111	NC_000958	GGC	2	6	48749	48754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957454
1112	NC_000958	GC	3	6	48817	48822	0 %	0 %	50 %	50 %	10957454
1113	NC_000958	GGT	2	6	48846	48851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957454
1114	NC_000958	CAG	2	6	48865	48870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957454
1115	NC_000958	AGC	2	6	48878	48883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957454
1116	NC_000958	CGC	2	6	48886	48891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957454
1117	NC_000958	GC	3	6	48917	48922	0 %	0 %	50 %	50 %	10957454
1118	NC_000958	ATG	2	6	48949	48954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957454
1119	NC_000958	CGT	2	6	48996	49001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957454
1120	NC_000958	GTG	2	6	49015	49020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957454
1121	NC_000958	GCA	3	9	49083	49091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957454
1122	NC_000958	GAC	2	6	49150	49155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957454
1123	NC_000958	CCACC	2	10	49170	49179	20 %	0 %	0 %	80 %	10957454
1124	NC_000958	GCC	2	6	49274	49279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957454
1125	NC_000958	GCC	2	6	49281	49286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957454
1126	NC_000958	CT	3	6	49294	49299	0 %	50 %	0 %	50 %	10957454
1127	NC_000958	CCA	2	6	49444	49449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957454
1128	NC_000958	GCT	2	6	49480	49485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957454
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1164	NC_000958	TCG	3	9	50952	50960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1169	NC_000958	AGGC	2	8	51167	51174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1172	NC_000958	TGA	2	6	51303	51308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1237	NC_000958	ACA	2	6	54290	54295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1238	NC_000958	A	7	7	54404	54410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1239	NC_000958	TGG	2	6	54431	54436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1240	NC_000958	CCG	2	6	54572	54577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1241	NC_000958	CGG	2	6	54603	54608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1242	NC_000958	ACG	2	6	54611	54616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1245	NC_000958	GCC	2	6	54782	54787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1246	NC_000958	GCC	2	6	54835	54840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1247	NC_000958	TGA	2	6	54864	54869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_000958	GCA	2	6	54905	54910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1249	NC_000958	GGGC	2	8	54956	54963	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1250	NC_000958	GCG	2	6	54977	54982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1251	NC_000958	TTC	2	6	55003	55008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1252	NC_000958	CCA	2	6	55037	55042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1253	NC_000958	AACA	2	8	55058	55065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1254	NC_000958	GCG	2	6	55067	55072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1255	NC_000958	GCA	2	6	55188	55193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957519
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1388	NC_000958	GCG	2	6	61924	61929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1389	NC_000958	T	6	6	61940	61945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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