MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Liberibacter americanus str. Sao Paulo

Total Repeats: 9132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022793	ATA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022793	ATTAT	2	10	1623	1632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022793	ATC	2	6	1638	1643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022793	ATT	2	6	1700	1705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022793	AAT	2	6	1736	1741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022793	TAAA	2	8	1769	1776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022793	ATATT	2	10	1778	1787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022793	TAA	2	6	1792	1797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022793	ATT	2	6	1801	1806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022793	AGA	2	6	1823	1828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022793	TAA	2	6	1839	1844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022793	TGA	2	6	1870	1875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022793	TCA	2	6	1895	1900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022793	TTA	2	6	1901	1906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022793	GTT	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022793	GAA	2	6	3135	3140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022793	CTTAT	2	10	3753	3762	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_022793	TAAT	2	8	4580	4587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022793	AATGA	2	10	4600	4609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022793	A	6	6	4665	4670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022793	AAAT	2	8	4697	4704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022793	A	6	6	4727	4732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022793	TGA	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022793	T	7	7	4786	4792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022793	A	8	8	5637	5644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022793	TA	3	6	5654	5659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022793	TAC	2	6	5661	5666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022793	ATG	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022793	ATT	2	6	5704	5709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022793	AT	3	6	5713	5718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022793	TAA	2	6	7050	7055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022793	AAT	2	6	7086	7091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022793	AT	3	6	7175	7180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022793	ATAAA	2	10	7189	7198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022793	AATA	2	8	7256	7263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022793	T	6	6	8552	8557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022793	TAAT	2	8	8570	8577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022793	TAA	2	6	8582	8587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022793	ATT	2	6	8627	8632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022793	TA	3	6	8651	8656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022793	TTAT	2	8	8756	8763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022793	TAAAA	2	10	8767	8776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022793	ATT	2	6	8796	8801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022793	ATT	2	6	8803	8808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022793	AT	3	6	8813	8818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022793	A	6	6	8843	8848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022793	A	6	6	8856	8861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022793	GCC	2	6	8886	8891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_022793	AAT	2	6	8928	8933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022793	ATT	2	6	8966	8971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022793	AT	3	6	8978	8983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022793	T	7	7	8994	9000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022793	TGTT	2	8	9009	9016	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022793	ATA	2	6	9024	9029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022793	GTA	2	6	9117	9122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022793	ATT	2	6	9125	9130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022793	ATA	2	6	9145	9150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022793	ATA	2	6	9176	9181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022793	AT	3	6	9186	9191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022793	TTGC	2	8	9193	9200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_022793	TAT	2	6	9219	9224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022793	ATA	2	6	9274	9279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022793	TAA	3	9	9288	9296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022793	AT	3	6	9309	9314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022793	TATC	2	8	9331	9338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_022793	CTT	2	6	9992	9997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022793	ATCA	2	8	10017	10024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_022793	TAG	2	6	10055	10060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022793	AT	3	6	10073	10078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022793	ATTAA	2	10	10128	10137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022793	ATC	2	6	10144	10149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022793	ATA	2	6	10171	10176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022793	GTTT	2	8	10194	10201	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022793	ATAG	2	8	10225	10232	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022793	A	6	6	10233	10238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022793	A	6	6	10240	10245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022793	ATT	2	6	10282	10287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022793	CAT	2	6	10288	10293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022793	ATT	2	6	10349	10354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022793	AAT	2	6	10358	10363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022793	A	7	7	10388	10394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022793	TTA	2	6	10417	10422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022793	CTT	2	6	10479	10484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022793	TAT	2	6	10512	10517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022793	TAT	2	6	10551	10556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022793	AAGG	2	8	10569	10576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022793	TAA	2	6	12566	12571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022793	AGA	2	6	12588	12593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022793	CAA	2	6	12609	12614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022793	ATT	2	6	12625	12630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022793	AGT	2	6	13845	13850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022793	AT	3	6	13878	13883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022793	ATT	2	6	13941	13946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022793	ATA	2	6	14030	14035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022793	ATA	2	6	14088	14093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022793	GGA	2	6	14105	14110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022793	GA	3	6	14109	14114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022793	ATTAAT	2	12	14211	14222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022793	AAG	2	6	14234	14239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022793	TAT	2	6	14240	14245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022793	CAT	2	6	14250	14255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022793	CTA	2	6	14289	14294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022793	ATA	2	6	14295	14300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022793	CTA	2	6	14312	14317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022793	ATAG	2	8	14323	14330	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022793	ATT	2	6	14338	14343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022793	TAATTT	2	12	14380	14391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022793	TTA	2	6	14424	14429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022793	AGA	2	6	14766	14771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022793	GAA	2	6	14795	14800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022793	TA	5	10	15097	15106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022793	AATTA	2	10	15145	15154	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022793	T	7	7	15245	15251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022793	ATA	2	6	15264	15269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022793	T	8	8	15294	15301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022793	A	8	8	15312	15319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022793	T	9	9	16361	16369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022793	CTTTTA	2	12	16379	16390	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_022793	A	6	6	16489	16494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022793	TAAT	2	8	16495	16502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022793	AT	3	6	16533	16538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022793	A	6	6	16550	16555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022793	AAT	2	6	16579	16584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022793	TA	3	6	16592	16597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022793	TA	4	8	16627	16634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022793	ATT	2	6	16640	16645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022793	T	6	6	16654	16659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022793	AT	3	6	16661	16666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022793	AGC	2	6	16671	16676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022793	A	6	6	16682	16687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022793	AT	3	6	16746	16751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022793	TA	3	6	16752	16757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022793	ATATT	2	10	16765	16774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022793	ATG	2	6	17478	17483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022793	TAA	2	6	17488	17493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022793	ATA	2	6	17526	17531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022793	ATTG	2	8	17532	17539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022793	ATA	2	6	17619	17624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022793	ATTA	2	8	17648	17655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022793	AAT	2	6	17662	17667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022793	A	7	7	17675	17681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022793	A	6	6	17694	17699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022793	AAT	2	6	17702	17707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022793	ATT	2	6	17743	17748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022793	AAC	2	6	17768	17773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_022793	CATATA	2	12	17776	17787	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_022793	TA	4	8	17798	17805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022793	TA	3	6	17827	17832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022793	ATA	2	6	17846	17851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022793	TAAA	2	8	17863	17870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022793	ACC	2	6	17886	17891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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154	NC_022793	TA	3	6	17981	17986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_022793	TAA	2	6	62550	62555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_022793	CTT	2	6	62571	62576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
448	NC_022793	CCT	2	6	62616	62621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
449	NC_022793	TACA	2	8	62624	62631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
450	NC_022793	AT	3	6	62638	62643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_022793	AT	3	6	62666	62671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_022793	ATAA	2	8	62683	62690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_022793	AT	3	6	62735	62740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_022793	A	8	8	62762	62769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_022793	AT	3	6	62781	62786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_022793	A	7	7	63010	63016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_022793	ATT	2	6	63051	63056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_022793	TA	3	6	63100	63105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_022793	AT	3	6	63557	63562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_022793	A	7	7	63575	63581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_022793	A	8	8	63648	63655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_022793	TA	4	8	63671	63678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_022793	TCAA	2	8	63684	63691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
468	NC_022793	GAA	2	6	63708	63713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
469	NC_022793	CTAAT	2	10	63739	63748	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
470	NC_022793	ATAA	2	8	65327	65334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_022793	ATA	2	6	65356	65361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_022793	CTT	2	6	66236	66241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_022793	AAAATA	2	12	66250	66261	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_022793	AT	3	6	66288	66293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_022793	ATT	2	6	66296	66301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_022793	A	6	6	66915	66920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_022793	ATA	2	6	66933	66938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_022793	AAT	2	6	66961	66966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_022793	AT	4	8	66970	66977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_022793	A	6	6	66978	66983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_022793	A	6	6	67013	67018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_022793	A	6	6	67028	67033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_022793	A	6	6	67056	67061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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