MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 3152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022786	CAG	2	6	24	29	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022786	AC	3	6	6728	6733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022786	C	6	6	10658	10663	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_022786	ATC	2	6	10666	10671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022786	ATCA	2	8	10683	10690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022786	ACG	2	6	10703	10708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022786	GCG	2	6	10733	10738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022786	CCT	2	6	10740	10745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_022786	CCG	2	6	10781	10786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_022786	GATT	2	8	10820	10827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022786	CGT	2	6	10859	10864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022786	CTG	2	6	10884	10889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022786	AAC	2	6	13476	13481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022786	TA	3	6	13495	13500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022786	AGC	2	6	13536	13541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022786	AATA	2	8	16925	16932	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022786	GAA	2	6	17666	17671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022786	GCA	2	6	17731	17736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022786	AG	3	6	18110	18115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022786	AT	3	6	18148	18153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022786	A	6	6	18165	18170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022786	ATTG	2	8	18181	18188	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022786	TAAACA	2	12	18214	18225	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022786	A	6	6	18231	18236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022786	GGCA	2	8	18254	18261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022786	ACC	2	6	18262	18267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_022786	AAC	2	6	18270	18275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022786	ACC	2	6	19224	19229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_022786	TC	3	6	19239	19244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022786	TCC	2	6	19382	19387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_022786	TGT	2	6	19391	19396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022786	AGG	2	6	19470	19475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022786	ATT	2	6	19483	19488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022786	GTC	2	6	19494	19499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022786	GTCT	2	8	19507	19514	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_022786	TGGG	2	8	20318	20325	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022786	CTCC	2	8	20372	20379	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_022786	CGCC	2	8	20516	20523	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_022786	CG	3	6	20560	20565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_022786	GT	3	6	20568	20573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022786	GGAT	2	8	20589	20596	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022786	G	6	6	20642	20647	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022786	GTC	2	6	20676	20681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022786	TTG	2	6	20685	20690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022786	AGG	2	6	20739	20744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022786	GCTA	2	8	20753	20760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022786	AAG	2	6	20814	20819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022786	A	6	6	20870	20875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022786	AAT	2	6	20881	20886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022786	TGA	2	6	20959	20964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022786	A	6	6	20997	21002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022786	AGA	2	6	21058	21063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022786	TGA	2	6	21082	21087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022786	TG	3	6	21119	21124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022786	ACCG	2	8	27387	27394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022786	AGG	2	6	27450	27455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022786	ATC	2	6	27467	27472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022786	GAA	2	6	27847	27852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022786	CTG	2	6	27875	27880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022786	GAA	2	6	27888	27893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022786	ATG	2	6	27957	27962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022786	TCA	2	6	27990	27995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022786	GGC	2	6	28034	28039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022786	CGG	2	6	28053	28058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022786	CGC	2	6	28529	28534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_022786	ATAA	2	8	28615	28622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022786	AGC	2	6	28634	28639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022786	TCA	2	6	28699	28704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022786	GAG	2	6	28738	28743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022786	AGC	2	6	28764	28769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022786	GCA	2	6	28810	28815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022786	TCA	2	6	29103	29108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022786	GCA	2	6	29149	29154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022786	CCT	2	6	29214	29219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_022786	ATT	2	6	29352	29357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022786	TCC	2	6	29383	29388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_022786	CCT	2	6	29406	29411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_022786	ATT	2	6	29414	29419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022786	TTG	2	6	29457	29462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022786	TTC	2	6	29529	29534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022786	CGA	2	6	29583	29588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022786	TTAT	2	8	30341	30348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022786	CT	4	8	30456	30463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022786	CT	3	6	30500	30505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022786	AAG	2	6	30533	30538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022786	AAG	2	6	30560	30565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022786	AGTGA	2	10	30569	30578	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022786	GTT	2	6	30585	30590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022786	CT	3	6	30650	30655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_022786	TTC	2	6	30666	30671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022786	CTT	2	6	30681	30686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022786	GTT	3	9	30701	30709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022786	CT	3	6	30715	30720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022786	TGT	2	6	30724	30729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022786	GATA	2	8	30740	30747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022786	GAG	2	6	30879	30884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022786	AT	3	6	30888	30893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022786	TTGT	2	8	30962	30969	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022786	CTT	3	9	30971	30979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022786	ATT	2	6	31037	31042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022786	CTC	2	6	31043	31048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_022786	TGT	2	6	31065	31070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022786	TCTA	2	8	31073	31080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_022786	CAT	2	6	31159	31164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022786	AGGT	2	8	31304	31311	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022786	TAG	2	6	31375	31380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022786	GGT	2	6	31393	31398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022786	TTGGA	2	10	31420	31429	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022786	AG	3	6	31466	31471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022786	AGGAC	2	10	31489	31498	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022786	ACA	2	6	31510	31515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022786	AGG	2	6	31604	31609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022786	AGG	2	6	31693	31698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022786	TA	3	6	31711	31716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022786	CTC	2	6	31774	31779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_022786	AGTT	2	8	31790	31797	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022786	AAC	2	6	33172	33177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022786	ATA	2	6	33196	33201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022786	ACA	3	9	33212	33220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_022786	GT	3	6	33252	33257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022786	GAC	2	6	33313	33318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022786	AC	3	6	33378	33383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022786	GTG	2	6	33388	33393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022786	CT	3	6	33423	33428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_022786	AGG	3	9	33465	33473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022786	TAT	2	6	33494	33499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022786	TCT	2	6	33537	33542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_022786	TCA	2	6	33598	33603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_022786	TCA	2	6	33634	33639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022786	TCG	2	6	33655	33660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022786	CTT	2	6	33707	33712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022786	T	6	6	33718	33723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022786	CAT	2	6	33817	33822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_022786	T	6	6	33859	33864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022786	GAAT	2	8	33875	33882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022786	AC	3	6	33900	33905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022786	TAA	2	6	33911	33916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022786	CAA	2	6	33917	33922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022786	CAT	2	6	33932	33937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022786	ACC	2	6	33993	33998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_022786	AGG	2	6	34008	34013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022786	GCT	2	6	34030	34035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_022786	CCGT	2	8	34044	34051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_022786	CT	3	6	34055	34060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_022786	TTA	2	6	34142	34147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022786	CTT	2	6	34148	34153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_022786	CT	4	8	34154	34161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_022786	TGG	2	6	34168	34173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_022786	TGA	2	6	34270	34275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022786	ATA	2	6	34276	34281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022786	CTA	2	6	34336	34341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_022786	GAC	2	6	34378	34383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_022786	TCT	2	6	34779	34784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_022786	TTCG	2	8	34787	34794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_022786	TGG	2	6	34850	34855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022786	GGC	2	6	34897	34902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_022786	GCG	2	6	39102	39107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_022786	CAA	2	6	77024	77029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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