MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 3152

< Previous1234567Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022786	TA	3	6	1576748	1576753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_022786	AG	3	6	1576777	1576782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_022786	AATA	2	8	1580416	1580423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_022786	GAC	2	6	1583349	1583354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_022786	TTA	2	6	1583365	1583370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_022786	TGA	2	6	1583385	1583390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_022786	GAA	2	6	1585330	1585335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_022786	T	6	6	1591700	1591705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_022786	TCTTT	2	10	1593026	1593035	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3010	NC_022786	T	6	6	1595603	1595608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_022786	TGA	2	6	1596025	1596030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_022786	TAA	2	6	1596044	1596049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_022786	AT	4	8	1596066	1596073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_022786	GCC	2	6	1596451	1596456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_022786	AAACC	2	10	1597588	1597597	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3016	NC_022786	AC	3	6	1597657	1597662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_022786	CCG	2	6	1597727	1597732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_022786	TGGGT	2	10	1597756	1597765	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_022786	AC	3	6	1597823	1597828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_022786	GCAAA	2	10	1598035	1598044	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3021	NC_022786	ACA	2	6	1601165	1601170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_022786	ACA	2	6	1601193	1601198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_022786	GTG	2	6	1601249	1601254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_022786	TTC	2	6	1603501	1603506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_022786	GAA	2	6	1603550	1603555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_022786	CT	3	6	1605255	1605260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_022786	CAC	2	6	1605334	1605339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_022786	CTC	2	6	1605410	1605415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_022786	AGG	2	6	1605445	1605450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_022786	GGT	2	6	1605464	1605469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_022786	CGT	2	6	1605491	1605496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_022786	GTT	2	6	1605580	1605585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_022786	ACC	2	6	1606412	1606417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_022786	AGG	2	6	1606558	1606563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_022786	AGG	2	6	1606567	1606572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_022786	CT	3	6	1606592	1606597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_022786	TAT	2	6	1606650	1606655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_022786	TATGT	2	10	1606688	1606697	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_022786	TAT	2	6	1606865	1606870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_022786	A	6	6	1606908	1606913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_022786	ATT	2	6	1606930	1606935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_022786	AGAAT	2	10	1606981	1606990	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_022786	TA	3	6	1607011	1607016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_022786	TGG	2	6	1611455	1611460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_022786	TGT	2	6	1611502	1611507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_022786	CT	3	6	1611528	1611533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_022786	ATT	2	6	1612539	1612544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_022786	CTC	2	6	1614915	1614920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_022786	TGT	2	6	1615505	1615510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_022786	CGG	3	9	1615527	1615535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_022786	TGA	2	6	1615592	1615597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_022786	GCA	2	6	1616947	1616952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_022786	GAC	2	6	1616953	1616958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_022786	CTG	2	6	1617662	1617667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_022786	GGCG	2	8	1617684	1617691	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_022786	AAT	2	6	1619468	1619473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_022786	GTT	2	6	1619481	1619486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_022786	CA	3	6	1619493	1619498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_022786	ACTA	2	8	1619514	1619521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_022786	TAA	2	6	1622799	1622804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_022786	T	6	6	1625099	1625104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_022786	A	7	7	1635239	1635245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_022786	TTG	2	6	1635246	1635251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_022786	TAT	2	6	1636619	1636624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_022786	TA	3	6	1636633	1636638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_022786	AT	3	6	1638449	1638454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_022786	ATT	2	6	1638495	1638500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_022786	A	6	6	1640792	1640797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_022786	GAG	2	6	1640836	1640841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_022786	CCT	2	6	1644547	1644552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_022786	GGC	2	6	1644711	1644716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_022786	GGA	2	6	1645060	1645065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_022786	GA	3	6	1645131	1645136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_022786	ATGA	2	8	1645146	1645153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_022786	T	6	6	1647193	1647198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_022786	GCC	2	6	1648886	1648891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3077	NC_022786	GTC	2	6	1648922	1648927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_022786	TGT	2	6	1650952	1650957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_022786	TGT	3	9	1652886	1652894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_022786	TTTA	2	8	1652896	1652903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_022786	CAC	2	6	1652911	1652916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3082	NC_022786	AGC	2	6	1654044	1654049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_022786	ACC	2	6	1657266	1657271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_022786	ATT	2	6	1657283	1657288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_022786	CA	3	6	1662124	1662129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_022786	CAGG	2	8	1662136	1662143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3087	NC_022786	AGG	2	6	1662154	1662159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_022786	GT	3	6	1662285	1662290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_022786	GGT	2	6	1662319	1662324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_022786	CCA	2	6	1662438	1662443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3091	NC_022786	TCCT	2	8	1662500	1662507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_022786	GCAC	2	8	1662613	1662620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3093	NC_022786	CCT	2	6	1662637	1662642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_022786	CAT	2	6	1662675	1662680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_022786	CTG	2	6	1662682	1662687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_022786	GGC	2	6	1662799	1662804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_022786	GCC	2	6	1662951	1662956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_022786	TGG	2	6	1662965	1662970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_022786	TCC	2	6	1662971	1662976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_022786	TACCCC	2	12	1662993	1663004	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_022786	CG	3	6	1663049	1663054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_022786	CAG	2	6	1663058	1663063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_022786	GCT	2	6	1663068	1663073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_022786	CAC	2	6	1663133	1663138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_022786	CGG	2	6	1663159	1663164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_022786	C	6	6	1663180	1663185	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3107	NC_022786	CCA	2	6	1663220	1663225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_022786	CTG	2	6	1663284	1663289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_022786	TGG	2	6	1663368	1663373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_022786	CCA	2	6	1663383	1663388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_022786	CCT	2	6	1663519	1663524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_022786	C	6	6	1663606	1663611	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3113	NC_022786	GGA	2	6	1663668	1663673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_022786	AGG	2	6	1663744	1663749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_022786	TC	3	6	1663774	1663779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_022786	CGGTC	2	10	1663787	1663796	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3117	NC_022786	GCC	2	6	1663800	1663805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_022786	ACT	2	6	1663830	1663835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_022786	GAA	2	6	1664401	1664406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_022786	TCT	2	6	1664442	1664447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_022786	TTG	2	6	1664474	1664479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_022786	CG	3	6	1664638	1664643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_022786	CGG	2	6	1664684	1664689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_022786	GTA	2	6	1665489	1665494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_022786	CAG	2	6	1665556	1665561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_022786	CCA	2	6	1666090	1666095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_022786	AGCC	2	8	1666166	1666173	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_022786	CCT	2	6	1666190	1666195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_022786	TGT	2	6	1666310	1666315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_022786	AT	3	6	1666316	1666321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_022786	TTG	2	6	1666330	1666335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_022786	ATT	2	6	1666341	1666346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_022786	TTC	2	6	1666403	1666408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_022786	GTT	2	6	1666412	1666417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_022786	AGT	2	6	1666455	1666460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_022786	GTT	2	6	1666478	1666483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_022786	C	6	6	1666595	1666600	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3138	NC_022786	GAGC	2	8	1666695	1666702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3139	NC_022786	GCT	2	6	1666723	1666728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3140	NC_022786	CTT	2	6	1666742	1666747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_022786	CAAGGC	2	12	1666789	1666800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3142	NC_022786	GAT	2	6	1666934	1666939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_022786	ACG	2	6	1670878	1670883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3144	NC_022786	GAT	2	6	1674152	1674157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_022786	GAA	3	9	1674198	1674206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3146	NC_022786	TG	3	6	1677134	1677139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_022786	TGC	2	6	1680811	1680816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3148	NC_022786	TGAA	2	8	1680848	1680855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_022786	GGT	2	6	1680862	1680867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3150	NC_022786	CGC	2	6	1680882	1680887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3151	NC_022786	CGG	2	6	1680895	1680900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3152	NC_022786	CGG	2	6	1680905	1680910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous1234567Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.