MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 3152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022786	CCG	2	6	1135698	1135703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2502	NC_022786	CCT	2	6	1135720	1135725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_022786	GCCC	2	8	1135766	1135773	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2504	NC_022786	TCT	2	6	1135776	1135781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_022786	AGC	2	6	1135789	1135794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_022786	CAG	2	6	1135800	1135805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_022786	AT	3	6	1139219	1139224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_022786	CTGG	2	8	1141297	1141304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2509	NC_022786	T	7	7	1141982	1141988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_022786	GGGGA	2	10	1143681	1143690	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_022786	GCC	3	9	1143719	1143727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2512	NC_022786	GCT	2	6	1143730	1143735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_022786	GGT	2	6	1144009	1144014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_022786	TG	3	6	1144042	1144047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_022786	TGGT	2	8	1144516	1144523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_022786	GAA	2	6	1144527	1144532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_022786	GTC	2	6	1144558	1144563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_022786	GGC	2	6	1144629	1144634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_022786	GCC	3	9	1144711	1144719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2520	NC_022786	TAA	2	6	1146521	1146526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_022786	CAT	2	6	1148532	1148537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_022786	CA	3	6	1149994	1149999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2523	NC_022786	AAAC	2	8	1150010	1150017	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2524	NC_022786	AGAAA	2	10	1150059	1150068	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_022786	TACAT	2	10	1151128	1151137	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2526	NC_022786	ATA	2	6	1151268	1151273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_022786	GAT	2	6	1151314	1151319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2530	NC_022786	ACA	2	6	1151418	1151423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_022786	AAT	2	6	1151432	1151437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_022786	AGCC	2	8	1151438	1151445	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2533	NC_022786	AAG	2	6	1151474	1151479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_022786	TGA	2	6	1152308	1152313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_022786	GAA	2	6	1152334	1152339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_022786	AGA	2	6	1152357	1152362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_022786	GAT	2	6	1152371	1152376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2539	NC_022786	A	6	6	1153032	1153037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_022786	GCA	2	6	1153123	1153128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2542	NC_022786	ACAA	2	8	1156125	1156132	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2543	NC_022786	GGA	2	6	1156140	1156145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_022786	CTC	2	6	1156216	1156221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2545	NC_022786	TGT	2	6	1156245	1156250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2547	NC_022786	GTG	2	6	1156307	1156312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_022786	GGT	2	6	1157588	1157593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_022786	CAA	2	6	1160337	1160342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_022786	CTCAA	2	10	1162045	1162054	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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2552	NC_022786	T	6	6	1162159	1162164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_022786	CTC	2	6	1167743	1167748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2555	NC_022786	CTC	2	6	1167797	1167802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2556	NC_022786	CAA	2	6	1167819	1167824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_022786	TGCA	2	8	1167825	1167832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2558	NC_022786	TCT	3	9	1167835	1167843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2560	NC_022786	TGG	2	6	1169232	1169237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2562	NC_022786	CT	3	6	1169315	1169320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2563	NC_022786	A	6	6	1169434	1169439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_022786	CCG	2	6	1169519	1169524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_022786	TTG	2	6	1169536	1169541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2569	NC_022786	T	6	6	1174955	1174960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2584	NC_022786	AGCAA	2	10	1192597	1192606	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2585	NC_022786	TA	3	6	1192607	1192612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2593	NC_022786	GAC	2	6	1207936	1207941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2597	NC_022786	TTG	2	6	1209271	1209276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2599	NC_022786	CAA	2	6	1211761	1211766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_022786	GCG	2	6	1211788	1211793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_022786	AT	3	6	1215465	1215470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_022786	A	6	6	1216010	1216015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_022786	T	6	6	1216032	1216037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_022786	CTTT	2	8	1222652	1222659	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2605	NC_022786	GTT	2	6	1222669	1222674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2608	NC_022786	CAA	3	9	1222745	1222753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_022786	T	6	6	1223968	1223973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2612	NC_022786	CAT	2	6	1232207	1232212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_022786	GA	3	6	1232221	1232226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_022786	AATAT	2	10	1232233	1232242	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_022786	TGT	2	6	1232269	1232274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2622	NC_022786	ACC	2	6	1246596	1246601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2623	NC_022786	TTTA	2	8	1246632	1246639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_022786	TCG	2	6	1246661	1246666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2626	NC_022786	T	6	6	1249514	1249519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_022786	AAC	2	6	1252012	1252017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_022786	GTTG	2	8	1252032	1252039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_022786	GCG	2	6	1252040	1252045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2630	NC_022786	GAT	2	6	1252047	1252052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2632	NC_022786	GCA	2	6	1252132	1252137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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