MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium tetani 12124569 main chromosome

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022777	AATATA	2	12	2719	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022777	TAACTT	2	12	26385	26396	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022777	AAAATA	2	12	27327	27338	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022777	TGATAG	2	12	53906	53917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022777	GTAGAA	2	12	67837	67848	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022777	TAAATA	2	12	79327	79338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022777	TTTTAT	2	12	96503	96514	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022777	ATTTAA	2	12	100418	100429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022777	TAAAAA	2	12	110838	110849	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022777	ATAATT	2	12	114375	114386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022777	TTTTAT	2	12	134986	134997	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022777	TAAATC	2	12	140159	140170	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022777	ATTTTT	2	12	171819	171830	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022777	GTATAA	2	12	197756	197767	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022777	ATTTTT	2	12	215409	215420	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022777	GAATAA	2	12	224587	224598	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022777	TGTTTG	2	12	228100	228111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022777	AACATA	2	12	232696	232707	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022777	AGATAA	2	12	247378	247389	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022777	TATATT	2	12	270199	270210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022777	TTAAAT	2	12	279008	279019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022777	ATTAAA	2	12	299148	299159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022777	TAAAAT	2	12	314706	314717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022777	TAAAAT	2	12	333116	333127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022777	TATAGA	2	12	346080	346091	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022777	AATTTA	2	12	350625	350636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022777	ATAAAA	2	12	378880	378891	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022777	AATTAA	2	12	383859	383870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022777	TTTTAC	2	12	391664	391675	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022777	CATTTA	2	12	409469	409480	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022777	ATCAAT	2	12	416964	416975	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022777	TAGTTT	2	12	425192	425203	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022777	TAAAAA	2	12	430501	430512	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022777	ATAGCA	2	12	460634	460645	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022777	ATATAA	2	12	463652	463663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022777	TTTTTA	2	12	463757	463768	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022777	TAGAGG	2	12	498248	498259	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022777	AAAAAC	2	12	546898	546909	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022777	TGGGGA	2	12	547510	547521	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022777	TAGAAT	2	12	547773	547784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022777	AGAGTT	2	12	548361	548372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022777	ATAAAT	2	12	559963	559974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022777	TAATCA	2	12	559984	559995	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022777	TATTTT	2	12	576877	576888	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022777	ATAATT	2	12	602414	602425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022777	ATTAAA	2	12	614264	614275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022777	TAAATT	2	12	638150	638161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022777	TAAACT	2	12	655275	655286	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022777	TTTCTA	2	12	658660	658671	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022777	TTTAAT	2	12	663268	663279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022777	ATTATA	2	12	713373	713384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022777	TGATGG	2	12	730096	730107	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022777	GGGAAG	2	12	733482	733493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022777	TAAAAA	2	12	733668	733679	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022777	TTTTAT	2	12	762754	762765	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022777	GTTTAA	2	12	780916	780927	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022777	CTCTTA	2	12	780965	780976	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022777	AAAAGG	2	12	784922	784933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022777	AACTTT	2	12	810462	810473	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022777	ATATGT	3	18	810942	810959	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022777	AATACA	2	12	850627	850638	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022777	ATAAAA	2	12	868641	868652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022777	TTAATG	2	12	880177	880188	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022777	AAAGAA	2	12	883239	883250	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022777	AATTAA	2	12	884554	884565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022777	AGTAAT	2	12	895213	895224	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022777	AAAGTA	2	12	910183	910194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022777	ATATTA	2	12	922238	922249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022777	GATAAT	2	12	950820	950831	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022777	ATTTTA	2	12	978936	978947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022777	TTTTAT	2	12	988451	988462	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022777	TATTTT	2	12	1013834	1013845	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022777	AATTTA	2	12	1025690	1025701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022777	ATTTTA	2	12	1059592	1059603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022777	TATTTA	2	12	1071117	1071128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022777	ATTATA	2	12	1071190	1071201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022777	AATAAA	2	12	1093096	1093107	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022777	TTTTTA	2	12	1111899	1111910	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022777	ATGGGT	2	12	1137917	1137928	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022777	AAAAAG	2	12	1168078	1168089	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022777	ATTTTA	2	12	1177785	1177796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022777	TAAAAA	2	12	1193608	1193619	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022777	ATAATG	2	12	1194192	1194203	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022777	ATTTAA	2	12	1197792	1197803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022777	TAAAAA	2	12	1205362	1205373	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022777	AATATT	2	12	1219562	1219573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022777	ATAAAT	2	12	1225332	1225343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022777	AAATCT	2	12	1233077	1233088	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022777	ATTTTA	2	12	1236085	1236096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022777	TGTAAT	2	12	1242887	1242898	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022777	TACTTT	2	12	1250389	1250400	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022777	GAATAG	2	12	1256777	1256788	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022777	AATGTA	2	12	1273964	1273975	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022777	ATTATA	2	12	1274635	1274646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022777	ATTTTA	2	12	1276969	1276980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022777	TATTAA	2	12	1277944	1277955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022777	TTTATT	2	12	1278921	1278932	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022777	TATAAA	2	12	1287313	1287324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022777	AATTGG	2	12	1294547	1294558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022777	TTTAGC	2	12	1306930	1306941	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_022777	TAAAAT	2	12	1315543	1315554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022777	AAGTAG	2	12	1363492	1363503	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022777	TAAAAA	2	12	1366508	1366519	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022777	GTGTTT	2	12	1381988	1381999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022777	ATTTTT	2	12	1400694	1400705	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022777	TAATGA	2	12	1407497	1407508	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022777	ATTTTT	2	12	1416050	1416061	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022777	CCTATT	2	12	1428256	1428267	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022777	ATTTTA	2	12	1436179	1436190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022777	TAAAAA	2	12	1483736	1483747	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022777	GGCATA	2	12	1485296	1485307	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_022777	TAAAAA	2	12	1512074	1512085	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022777	ATTTTT	2	12	1529025	1529036	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022777	CTTTTG	2	12	1532763	1532774	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_022777	TTAAAT	2	12	1534241	1534252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022777	TTTTAT	2	12	1537743	1537754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022777	TAAACT	2	12	1548664	1548675	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_022777	ACATTA	2	12	1589882	1589893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_022777	GCTATA	2	12	1590182	1590193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_022777	ATTGTT	2	12	1595862	1595873	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022777	TTAATG	2	12	1595894	1595905	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022777	CAGATC	2	12	1596708	1596719	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022777	TATCTT	2	12	1597391	1597402	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_022777	TGATAT	2	12	1597419	1597430	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022777	TTGATA	2	12	1608849	1608860	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022777	AATCAT	2	12	1609428	1609439	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_022777	TAAAAT	2	12	1618277	1618288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022777	ATTTTT	2	12	1642810	1642821	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022777	TTTAGC	2	12	1657742	1657753	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_022777	TATATT	2	12	1663968	1663979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022777	ATTTAC	2	12	1711315	1711326	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.