MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter sp. 03-427

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022759	TAAAAA	2	12	1409	1420	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022759	AAATTT	2	12	22012	22023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022759	TTTAAA	2	12	32274	32285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022759	ATTTAG	2	12	43150	43161	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022759	TTTAAA	2	12	48416	48427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022759	TAAATT	2	12	70102	70113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022759	TATAGT	2	12	82832	82843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022759	AATTTA	2	12	120472	120483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022759	TTAAAT	2	12	130558	130569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022759	TTTAAA	2	12	136625	136636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022759	TAAAAA	2	12	174176	174187	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022759	TTTAAA	2	12	178135	178146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022759	TGTTTT	2	12	197047	197058	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022759	TTATAT	2	12	217627	217638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022759	TAAATT	2	12	233558	233569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022759	AAAAAT	2	12	233675	233686	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022759	AATTTA	2	12	266990	267001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022759	TTTTGC	2	12	279574	279585	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022759	AATTAA	2	12	291004	291015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022759	ATTTAA	2	12	321453	321464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022759	AATTAA	2	12	322886	322897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022759	TTTAAA	2	12	322979	322990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022759	TTTAAA	2	12	323011	323022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022759	TTTAAA	2	12	327602	327613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022759	TTTAAA	2	12	379443	379454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022759	TTTAAA	2	12	380948	380959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022759	AAAATT	2	12	415318	415329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022759	TTTAAA	2	12	430071	430082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022759	AAAGAG	2	12	449141	449152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022759	TTTAGG	2	12	449362	449373	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022759	TCTATA	2	12	454911	454922	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022759	TTTAAA	2	12	459488	459499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022759	AAAGAG	2	12	464092	464103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022759	TGAATT	2	12	464143	464154	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022759	AAAGAG	2	12	469054	469065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022759	AAAGAG	2	12	481001	481012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022759	AAAGAG	2	12	484991	485002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022759	AAAGAG	2	12	490302	490313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022759	AAAGAG	2	12	495647	495658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022759	TTTAAA	2	12	519416	519427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022759	TTTAAA	2	12	532575	532586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022759	TTTAAA	2	12	535281	535292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022759	TTTATC	2	12	569482	569493	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022759	ACATAA	2	12	603077	603088	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022759	AGTATA	2	12	647134	647145	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022759	TTTGAG	2	12	649939	649950	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022759	ATTTAA	2	12	657592	657603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022759	ATTTAA	2	12	663705	663716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022759	AATTTA	2	12	663719	663730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022759	TAGAAA	2	12	665226	665237	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022759	ATTTAA	2	12	675908	675919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022759	AAAATT	2	12	675940	675951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022759	AATTTA	2	12	675963	675974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022759	ATTTTA	2	12	676967	676978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022759	TAAAAA	2	12	678732	678743	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022759	TTTAAA	2	12	717579	717590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022759	TAAATT	2	12	763207	763218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022759	AAATTT	2	12	765963	765974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022759	AAAAAT	2	12	809833	809844	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022759	GAAGTG	2	12	810309	810320	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022759	ATATTT	2	12	833924	833935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022759	ATTTTA	2	12	865803	865814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022759	AGATTA	2	12	905814	905825	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022759	CTTTAA	2	12	924825	924836	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022759	TAAATT	2	12	928147	928158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022759	AAATAA	2	12	956280	956291	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022759	ATTTAA	2	12	975301	975312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022759	AATACA	2	12	981234	981245	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022759	AGATGG	2	12	981324	981335	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022759	TTTAAA	2	12	1008174	1008185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022759	TTAAAT	2	12	1032100	1032111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022759	ATTTAA	2	12	1043514	1043525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022759	TTAAAT	2	12	1049980	1049991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022759	TTAAAA	2	12	1054920	1054931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022759	TAACTA	2	12	1057592	1057603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_022759	TTTAAA	2	12	1057611	1057622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022759	AAATAT	2	12	1060022	1060033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022759	ATTTAA	2	12	1064846	1064857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022759	AATAAA	2	12	1064975	1064986	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022759	TTTAAA	2	12	1074737	1074748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022759	ATTTAA	2	12	1093004	1093015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022759	TAATTT	2	12	1106921	1106932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022759	ATTTAA	2	12	1125176	1125187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022759	AAAATT	2	12	1125221	1125232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022759	GAATTT	2	12	1138475	1138486	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022759	TTTAAA	2	12	1159281	1159292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022759	TTTAAA	2	12	1190054	1190065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022759	TAGTAT	2	12	1210482	1210493	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022759	TTTAAA	2	12	1210585	1210596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022759	TTTCAT	2	12	1218421	1218432	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022759	AAGATT	2	12	1226632	1226643	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022759	TAGCAG	2	12	1241007	1241018	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022759	AGTTGA	2	12	1242093	1242104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022759	CCAAGA	2	12	1242136	1242147	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022759	TTTAAA	2	12	1270233	1270244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022759	TTTAAA	2	12	1278139	1278150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022759	TTTAAA	2	12	1284551	1284562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022759	AAATTT	2	12	1285512	1285523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022759	ATTCAA	2	12	1300397	1300408	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_022759	AAATTT	2	12	1307804	1307815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022759	TGAATT	2	12	1308309	1308320	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022759	CAAATA	2	12	1365344	1365355	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_022759	TTTTAA	2	12	1435072	1435083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022759	AAATTT	2	12	1438935	1438946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022759	TGGGGT	2	12	1439249	1439260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022759	TTAAAT	2	12	1446751	1446762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022759	ATTTAA	2	12	1500134	1500145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022759	TTTAAA	2	12	1512949	1512960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022759	ATCAAA	2	12	1520252	1520263	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_022759	AAATTT	2	12	1536357	1536368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022759	TAAACT	2	12	1607335	1607346	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_022759	TTTAAA	2	12	1627477	1627488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022759	TTAAAT	2	12	1639064	1639075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022759	TTTATA	2	12	1646962	1646973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022759	ATTTTA	2	12	1649156	1649167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022759	ATTTAA	2	12	1677510	1677521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022759	TTAAAT	2	12	1753349	1753360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022759	AAAATA	2	12	1753404	1753415	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022759	AAATTT	2	12	1757496	1757507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.