MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter sp. 03-427

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022759	TGTTT	2	10	24335	24344	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022759	TTTTG	2	10	43021	43030	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022759	ATACT	2	10	43575	43584	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022759	AGAAT	2	10	51380	51389	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022759	AAATT	2	10	58921	58930	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022759	CTAAA	2	10	58973	58982	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022759	AAAAT	2	10	62587	62596	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022759	CAATA	2	10	73517	73526	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_022759	CAAAA	2	10	77105	77114	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022759	ATATT	2	10	82848	82857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022759	TATCT	2	10	128564	128573	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_022759	ATTAT	2	10	138941	138950	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022759	TAAGT	2	10	139229	139238	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022759	GGTAA	2	10	139287	139296	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022759	TCGTG	2	10	140083	140092	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022759	TAAAA	2	10	141140	141149	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022759	CCGTA	2	10	142912	142921	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_022759	CAAAG	2	10	143047	143056	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022759	AGCTA	2	10	144030	144039	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_022759	TATTT	2	10	144633	144642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022759	ATTTT	2	10	150327	150336	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022759	TTTGA	2	10	150566	150575	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022759	TTGTT	2	10	173080	173089	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022759	TAAAA	2	10	178341	178350	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022759	ATTTA	2	10	186227	186236	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022759	ATTTT	2	10	197299	197308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022759	ATATA	2	10	217647	217656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022759	GATAA	2	10	218565	218574	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022759	TAATA	2	10	258686	258695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022759	GTAAA	2	10	267004	267013	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022759	TTTAA	2	10	274916	274925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022759	AAAGC	2	10	299991	300000	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_022759	TATTT	2	10	315713	315722	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022759	AAATT	2	10	322684	322693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022759	AAATA	2	10	329575	329584	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022759	TTATT	2	10	342592	342601	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022759	TTTTA	2	10	347015	347024	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022759	GGCGG	2	10	347165	347174	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022759	TATTT	2	10	358895	358904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022759	TAAAT	2	10	383089	383098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022759	TTTAT	2	10	399402	399411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022759	TAATA	2	10	403118	403127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022759	TAAAA	2	10	403220	403229	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022759	ATTAA	2	10	408777	408786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022759	AATAT	2	10	408938	408947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022759	AATTA	2	10	415268	415277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022759	TAATT	2	10	415284	415293	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022759	CTTTT	2	10	422245	422254	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022759	TAAAT	2	10	426168	426177	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022759	TAAAT	2	10	444875	444884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022759	TTTTA	2	10	444885	444894	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022759	TAAAA	2	10	444972	444981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022759	AATAA	3	15	449013	449027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022759	GTAAG	2	10	455236	455245	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022759	ATTTT	3	15	455295	455309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022759	AATAA	3	15	463964	463978	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022759	TAAAA	2	10	465685	465694	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022759	AATAA	3	15	468926	468940	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022759	TCTAA	2	10	469480	469489	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_022759	ATTTT	2	10	469604	469613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022759	ATTTA	2	10	469711	469720	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022759	AATAA	3	15	480873	480887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022759	AATAA	3	15	484863	484877	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022759	ATTAA	2	10	486473	486482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022759	AATAA	3	15	490174	490188	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022759	AATAA	3	15	495519	495533	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022759	ATTAT	2	10	506910	506919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022759	ATTAT	2	10	511769	511778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022759	TAAGT	2	10	512057	512066	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022759	GGTAA	2	10	512115	512124	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022759	TCGTG	2	10	512911	512920	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_022759	ATTTA	2	10	513576	513585	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022759	TAAAA	2	10	513965	513974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022759	CCGTA	2	10	515737	515746	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_022759	CAAAG	2	10	515872	515881	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022759	AGCTA	2	10	516855	516864	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022759	TATTT	2	10	517458	517467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022759	ATATT	2	10	517528	517537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022759	ATTTT	2	10	521500	521509	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022759	AAATT	2	10	560078	560087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022759	TTAAA	2	10	560123	560132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022759	ATATA	2	10	574110	574119	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022759	AATTT	2	10	578535	578544	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022759	TAAAT	3	15	601413	601427	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022759	CCTCA	2	10	605745	605754	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_022759	TTTCA	2	10	605856	605865	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_022759	ATTAT	2	10	606215	606224	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022759	TAAGT	2	10	606503	606512	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022759	GGTAA	2	10	606561	606570	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022759	TCGTG	2	10	607357	607366	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_022759	TAAAA	2	10	608414	608423	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022759	CCGTA	2	10	610186	610195	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_022759	CAAAG	2	10	610321	610330	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022759	AGCTA	2	10	611304	611313	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022759	TATTT	2	10	611907	611916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022759	ATATT	2	10	611977	611986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022759	TGGTA	2	10	622582	622591	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022759	TTATT	2	10	647121	647130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022759	ATTTC	2	10	648712	648721	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_022759	TATAT	2	10	657838	657847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022759	ATAAA	2	10	659746	659755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022759	AAATG	2	10	663626	663635	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022759	ATATT	2	10	665436	665445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022759	TTATT	2	10	667481	667490	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022759	ATTTA	2	10	667525	667534	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022759	TATAT	2	10	676210	676219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022759	AAATT	2	10	678959	678968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022759	GATAT	2	10	700119	700128	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022759	ATTTT	2	10	700318	700327	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022759	TAATT	2	10	721465	721474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022759	TTTGT	2	10	721533	721542	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022759	TTTGA	2	10	726040	726049	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022759	AAATT	2	10	726087	726096	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022759	ATAAA	2	10	765832	765841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022759	TAAAA	2	10	765876	765885	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022759	TGTAA	2	10	777702	777711	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022759	AAAAT	2	10	809877	809886	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022759	TATAA	2	10	817814	817823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022759	AATTT	2	10	825016	825025	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022759	TGCTT	2	10	834732	834741	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_022759	CTAAA	2	10	835472	835481	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022759	AAATT	2	10	846875	846884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022759	ATATT	2	10	852855	852864	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022759	ATTTT	2	10	860432	860441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022759	TATTT	2	10	865958	865967	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022759	ATTTT	2	10	870193	870202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022759	AAGCA	2	10	895082	895091	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_022759	TAAAA	2	10	917454	917463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022759	TATAA	2	10	928037	928046	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022759	CAAAA	2	10	930295	930304	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_022759	TCTAG	2	10	930380	930389	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_022759	AACTC	2	10	930406	930415	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_022759	AACAA	2	10	931887	931896	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022759	ATTAT	2	10	969221	969230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022759	AATTT	2	10	975319	975328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022759	ACAAA	2	10	980556	980565	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_022759	ACAAA	2	10	981258	981267	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_022759	AATAA	2	10	985499	985508	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022759	TAAAA	2	10	989580	989589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022759	TTTTA	2	10	1000778	1000787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022759	ATATG	2	10	1001561	1001570	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022759	TAAAA	2	10	1001695	1001704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022759	AAATA	2	10	1001789	1001798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022759	GGTAT	2	10	1002385	1002394	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022759	ATGAG	2	10	1003550	1003559	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022759	AATTT	2	10	1006943	1006952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022759	CATAT	2	10	1011564	1011573	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_022759	TATCC	2	10	1012457	1012466	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.