MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR9

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022608	GCT	2	6	31	36	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022608	GAA	2	6	103	108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022608	TAA	2	6	159	164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022608	ACT	2	6	205	210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022608	GCA	2	6	214	219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022608	TCA	2	6	384	389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022608	AGG	2	6	575	580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022608	AAT	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022608	GTC	2	6	1430	1435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022608	AAT	2	6	1500	1505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022608	TAA	2	6	1615	1620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022608	TCA	2	6	1650	1655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022608	TTA	2	6	1761	1766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022608	CTT	2	6	1816	1821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022608	CGC	2	6	1912	1917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_022608	TGT	2	6	1966	1971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022608	GGT	2	6	2006	2011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022608	ACA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022608	ATT	2	6	2202	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022608	CAG	2	6	2262	2267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022608	TCA	2	6	3462	3467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022608	AGG	2	6	3577	3582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022608	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022608	TTA	2	6	3630	3635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022608	TAA	2	6	5148	5153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022608	CCT	2	6	5825	5830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_022608	CCT	2	6	5835	5840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_022608	ATA	2	6	5844	5849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022608	TAT	2	6	5850	5855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022608	AAT	2	6	5960	5965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022608	TTA	2	6	6008	6013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022608	TTG	2	6	6049	6054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022608	CTT	2	6	6076	6081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022608	ATG	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022608	TAA	2	6	6788	6793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022608	AGG	2	6	7444	7449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022608	TAT	2	6	7700	7705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022608	ATT	2	6	7788	7793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022608	TAT	2	6	7806	7811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022608	GGA	2	6	7877	7882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022608	TTA	2	6	8542	8547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022608	TAA	2	6	8566	8571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022608	ACT	2	6	8629	8634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022608	ATT	2	6	9338	9343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022608	GAT	2	6	9582	9587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.