MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359

Total Repeats: 492

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022606	TTATT	2	10	3018	3027	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022606	TAAAA	2	10	13094	13103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022606	CTATT	2	10	16565	16574	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022606	CTTTT	2	10	19647	19656	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022606	TTATT	2	10	32896	32905	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022606	AATAT	2	10	38123	38132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022606	AATGG	2	10	38214	38223	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022606	TTATA	2	10	41687	41696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022606	GTATC	2	10	45497	45506	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022606	CTTTG	2	10	45557	45566	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022606	GATTA	2	10	55613	55622	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022606	TGAAG	2	10	70634	70643	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022606	ATAGT	2	10	73079	73088	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022606	ATAAG	2	10	74667	74676	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022606	ATTGT	2	10	75260	75269	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022606	AAAAG	2	10	80597	80606	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022606	AATAA	2	10	81781	81790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022606	TATTG	2	10	83545	83554	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022606	TAACA	2	10	89691	89700	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_022606	AAAAG	2	10	92852	92861	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022606	TTTAG	2	10	93736	93745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022606	GAAAA	2	10	104563	104572	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022606	TTGTA	2	10	105523	105532	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022606	AAATA	2	10	105775	105784	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022606	ATATG	2	10	107240	107249	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022606	TATAC	2	10	109028	109037	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022606	TAGTT	2	10	119319	119328	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022606	TAAAA	2	10	128849	128858	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022606	GTAAA	2	10	130102	130111	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022606	ATCTA	2	10	130156	130165	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022606	TTTAT	2	10	130688	130697	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022606	TCGTG	2	10	131782	131791	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_022606	GTTAA	2	10	132473	132482	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022606	TTTTA	2	10	142158	142167	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022606	TAAAA	2	10	143268	143277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022606	AACAA	2	10	143326	143335	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022606	TCGTG	2	10	144560	144569	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_022606	GTTAA	2	10	145480	145489	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022606	ATTAT	2	10	149469	149478	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022606	TTTAT	2	10	149643	149652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022606	GAAAA	2	10	149696	149705	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022606	AAAGT	2	10	152790	152799	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022606	GAAAG	2	10	152889	152898	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022606	AAAGA	2	10	154311	154320	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022606	TGAGG	2	10	159173	159182	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022606	CTACA	2	10	162724	162733	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_022606	ATTTG	2	10	166756	166765	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022606	GAAAA	2	10	184284	184293	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022606	ATGTT	2	10	184804	184813	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022606	ATTCT	2	10	191782	191791	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_022606	TAAAA	2	10	195026	195035	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022606	TAAAA	2	10	195255	195264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022606	AATTA	2	10	195421	195430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022606	TTTTC	2	10	203469	203478	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_022606	CTTTT	2	10	203871	203880	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_022606	AACTT	2	10	203910	203919	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_022606	ATGTA	2	10	203956	203965	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022606	GGGAT	2	10	204086	204095	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022606	CTTTT	2	10	211038	211047	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_022606	ATGAA	2	10	222055	222064	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022606	TAGGT	2	10	223972	223981	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022606	TTGGT	2	10	226714	226723	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022606	TCGTG	2	10	229171	229180	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_022606	GTTAA	2	10	229972	229981	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022606	TAATT	2	10	235214	235223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022606	AGTAT	2	10	239350	239359	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022606	GGAAA	2	10	239440	239449	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022606	AAAGA	2	10	245231	245240	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022606	AGTAA	2	10	246753	246762	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022606	TTATG	2	10	257107	257116	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022606	TGAAA	2	10	265293	265302	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022606	ATGAA	2	10	276583	276592	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022606	TAAAA	2	10	284772	284781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022606	TTTTA	2	10	288306	288315	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022606	TAAAC	2	10	294458	294467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022606	GAATA	2	10	310906	310915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022606	CTTAT	2	10	314159	314168	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_022606	CTTTT	2	10	316571	316580	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_022606	AAACT	2	10	320149	320158	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_022606	GCAAC	2	10	321694	321703	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_022606	TTTCA	2	10	330827	330836	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022606	TCACT	2	10	332466	332475	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_022606	GATTT	2	10	332497	332506	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022606	AACGG	2	10	332536	332545	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_022606	AAAAG	2	10	333068	333077	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022606	AAGGC	2	10	334293	334302	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_022606	AAGAA	2	10	336459	336468	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022606	ATAAA	2	10	338247	338256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022606	AATTA	2	10	367875	367884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022606	AGGTT	2	10	371710	371719	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022606	AATAA	2	10	388477	388486	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022606	ATCAA	2	10	388760	388769	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_022606	TCATT	2	10	393932	393941	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022606	TTTCA	2	10	397769	397778	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022606	CAATG	2	10	401572	401581	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_022606	AGTTC	2	10	401669	401678	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022606	CTCAC	2	10	403525	403534	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_022606	AAATC	2	10	410442	410451	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022606	TTAGA	2	10	422591	422600	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022606	GAAAA	2	10	426860	426869	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022606	AATTA	2	10	427928	427937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022606	AAATG	2	10	429823	429832	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022606	AATTG	2	10	430321	430330	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022606	TTTTA	2	10	432745	432754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022606	AACAA	2	10	443092	443101	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022606	TAAAA	2	10	445811	445820	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022606	AATTA	2	10	449277	449286	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022606	AAAGT	2	10	449553	449562	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022606	TAATT	2	10	449732	449741	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022606	TATAA	2	10	449791	449800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022606	GAAGA	2	10	451404	451413	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022606	TTATT	2	10	460600	460609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022606	AAACA	2	10	461947	461956	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_022606	TCGTG	2	10	463182	463191	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_022606	GTTAA	2	10	463873	463882	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022606	TAAAT	2	10	468596	468605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022606	TTTAA	2	10	468824	468833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022606	ACTTA	2	10	473931	473940	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_022606	CCTTG	2	10	483810	483819	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_022606	TGATA	2	10	486842	486851	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022606	TAACA	2	10	493347	493356	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022606	CCAAT	2	10	500683	500692	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_022606	AATGT	2	10	501699	501708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022606	TTTTC	2	10	502321	502330	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022606	TACTT	2	10	506494	506503	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_022606	TTAAT	3	15	508216	508230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022606	AAATA	2	10	510113	510122	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022606	TAAAT	2	10	510640	510649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022606	AGATT	2	10	511776	511785	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022606	CTAGA	2	10	514294	514303	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_022606	TTAAA	2	10	516481	516490	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022606	TCGTG	2	10	523021	523030	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022606	GTTAA	2	10	523720	523729	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022606	AGAAA	2	10	528496	528505	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022606	ATGAA	2	10	535568	535577	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022606	ATAGA	2	10	539505	539514	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022606	ATTTG	2	10	564624	564633	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022606	ATAAA	2	10	564699	564708	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022606	TCTTT	2	10	567682	567691	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_022606	TAATT	2	10	572712	572721	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022606	AGTAA	2	10	573805	573814	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022606	TAAAA	2	10	594113	594122	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022606	TAGTT	2	10	594228	594237	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022606	ATTAA	2	10	599319	599328	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022606	GTTTA	2	10	599771	599780	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022606	TTTTA	2	10	609683	609692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022606	TAAAA	2	10	624880	624889	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022606	AGTAT	2	10	630568	630577	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_022606	TAAGA	2	10	1328326	1328335	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
269	NC_022606	ACTCG	2	10	1332612	1332621	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
270	NC_022606	TTGTT	2	10	1346976	1346985	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
271	NC_022606	ATTTT	2	10	1351740	1351749	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_022606	ATTAA	2	10	1363891	1363900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_022606	TAAAA	2	10	1370394	1370403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_022606	TTACA	2	10	1370499	1370508	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
275	NC_022606	ATTTT	2	10	1376997	1377006	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_022606	CAGTC	2	10	1377167	1377176	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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281	NC_022606	ATTAA	2	10	1390421	1390430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_022606	TACTT	2	10	1397494	1397503	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_022606	ATAGA	2	10	1408116	1408125	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_022606	ATTTT	2	10	1418044	1418053	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_022606	TCATG	2	10	1425928	1425937	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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290	NC_022606	TTTAA	2	10	1429196	1429205	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.