MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Comamonadaceae bacterium CR

Total Repeats: 257

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022576	ATGGG	2	10	6711	6720	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022576	TAAAT	2	10	15339	15348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022576	TAGCG	2	10	17468	17477	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022576	CTGCA	2	10	20040	20049	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_022576	CAGGC	2	10	23318	23327	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_022576	GGCAA	2	10	34709	34718	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022576	TGCTG	2	10	42888	42897	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022576	GGCTG	2	10	43465	43474	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_022576	ACTGC	2	10	47785	47794	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_022576	GCTAC	2	10	50943	50952	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_022576	CTGCG	2	10	60128	60137	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_022576	CCGGT	2	10	60178	60187	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_022576	CGCAC	2	10	64142	64151	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_022576	TGGGG	2	10	70563	70572	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022576	CCCAC	2	10	71549	71558	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
16	NC_022576	GAGGT	2	10	72667	72676	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022576	AGGGG	2	10	73330	73339	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022576	AGTGG	2	10	93726	93735	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022576	TGCCG	2	10	113130	113139	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_022576	CCTTT	2	10	145865	145874	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_022576	CCTGC	2	10	146359	146368	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_022576	CATTG	2	10	147600	147609	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022576	GCAGG	2	10	153284	153293	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_022576	AAGGA	2	10	159039	159048	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022576	ATGGG	2	10	163037	163046	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022576	ATGGA	2	10	165945	165954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022576	GCAGG	2	10	168866	168875	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022576	TTTGA	2	10	174510	174519	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022576	CGATG	2	10	183379	183388	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022576	CGATG	2	10	220968	220977	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022576	CAAGC	2	10	220978	220987	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_022576	AGCGC	2	10	225996	226005	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_022576	TTTTC	2	10	227176	227185	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_022576	TGCCG	2	10	243662	243671	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_022576	TTTTC	2	10	266685	266694	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022576	GCTTG	2	10	275998	276007	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022576	CAAGC	2	10	280747	280756	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_022576	CGGCT	2	10	308512	308521	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_022576	GCGGG	2	10	328652	328661	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022576	GCAAC	2	10	358665	358674	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_022576	CATCA	2	10	360811	360820	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_022576	AACAA	2	10	364054	364063	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_022576	GTTTG	2	10	414498	414507	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022576	TTGGC	2	10	421307	421316	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_022576	GCTAC	2	10	457635	457644	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_022576	GTTCC	2	10	468249	468258	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_022576	TCCCT	2	10	468374	468383	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
48	NC_022576	TGGGT	2	10	470254	470263	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022576	GTGGG	2	10	474325	474334	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022576	GAAGA	2	10	488636	488645	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022576	CGCAT	2	10	490057	490066	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_022576	AAACA	2	10	526911	526920	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022576	ATTGC	2	10	526937	526946	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_022576	GCCAG	2	10	535566	535575	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_022576	CGGTA	2	10	535637	535646	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_022576	CGCAA	2	10	536603	536612	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_022576	CGCAA	2	10	540574	540583	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_022576	CGGGG	2	10	568958	568967	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022576	GGGTA	2	10	585669	585678	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022576	GCAGG	2	10	585846	585855	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_022576	GGGCT	2	10	592237	592246	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_022576	TGCCT	2	10	610814	610823	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_022576	GCAGG	2	10	637267	637276	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_022576	CAGTT	2	10	643588	643597	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_022576	GCAGG	2	10	648174	648183	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022576	TTTGG	2	10	648920	648929	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022576	GCTTC	2	10	654131	654140	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_022576	TGCAT	2	10	684792	684801	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022576	CAGTG	2	10	698911	698920	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022576	TTCCT	2	10	707868	707877	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_022576	GCCCT	2	10	721583	721592	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_022576	CGCGT	2	10	739885	739894	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_022576	TGTAC	2	10	758556	758565	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022576	GTTGG	2	10	787049	787058	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022576	GCAGG	2	10	816558	816567	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022576	AAGGC	2	10	821428	821437	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022576	TCCCC	2	10	874980	874989	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
78	NC_022576	GGCAA	2	10	879243	879252	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_022576	CGCAA	2	10	882495	882504	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_022576	GTTGG	2	10	884167	884176	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022576	ACCAC	2	10	894665	894674	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_022576	GCAGG	2	10	920107	920116	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_022576	CCCTG	2	10	929226	929235	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_022576	GCCGC	2	10	941443	941452	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_022576	CAGGC	2	10	970829	970838	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_022576	GAAAT	2	10	977771	977780	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022576	CCGCT	2	10	987479	987488	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_022576	TCCGT	2	10	987492	987501	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_022576	TGCAC	2	10	998662	998671	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_022576	GTTTC	2	10	1008752	1008761	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_022576	TGGTC	2	10	1011632	1011641	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_022576	GAACA	2	10	1014961	1014970	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_022576	CCCTA	2	10	1033496	1033505	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_022576	GCGCA	2	10	1061718	1061727	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_022576	TGCCT	2	10	1087226	1087235	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_022576	ACTGC	2	10	1087801	1087810	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_022576	TGGGG	2	10	1136745	1136754	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022576	ATGCC	2	10	1137218	1137227	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_022576	GGGCT	2	10	1156347	1156356	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_022576	GCTCT	2	10	1170975	1170984	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_022576	GTGCC	2	10	1205585	1205594	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_022576	TTGCA	2	10	1221085	1221094	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022576	CCTGC	2	10	1256462	1256471	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_022576	CGAAG	2	10	1271856	1271865	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022576	CAGGG	2	10	1275035	1275044	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022576	CATCA	2	10	1288762	1288771	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_022576	CTCCC	2	10	1298420	1298429	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
108	NC_022576	TGGGC	2	10	1299563	1299572	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_022576	AAGCG	2	10	1335018	1335027	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_022576	CACCC	2	10	1342585	1342594	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
111	NC_022576	AGGAA	2	10	1356468	1356477	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022576	ATGCA	2	10	1368823	1368832	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_022576	GCAGG	2	10	1372737	1372746	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_022576	TGCGC	2	10	1429081	1429090	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_022576	GTCAG	2	10	1469369	1469378	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_022576	CGGCA	2	10	1470398	1470407	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_022576	CCTGC	2	10	1485439	1485448	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_022576	GACAA	2	10	1486922	1486931	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_022576	ATTTT	2	10	1500426	1500435	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022576	TGCAG	2	10	1502430	1502439	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_022576	CACGC	2	10	1533727	1533736	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_022576	TTTGT	2	10	1533806	1533815	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022576	CCGTG	2	10	1550940	1550949	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_022576	CATGG	2	10	1560549	1560558	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022576	CATCG	2	10	1572182	1572191	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_022576	CGGAA	2	10	1580150	1580159	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_022576	GCAGG	2	10	1593444	1593453	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_022576	CTCCG	2	10	1603019	1603028	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_022576	CGGCA	2	10	1625406	1625415	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_022576	TGCGC	2	10	1662769	1662778	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_022576	ATGGG	2	10	1704045	1704054	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022576	CCTGC	2	10	1707585	1707594	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_022576	TATAA	2	10	1714147	1714156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022576	ATCAA	2	10	1717430	1717439	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_022576	GGGAA	2	10	1717505	1717514	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022576	GTTGG	2	10	1731170	1731179	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022576	CGATT	2	10	1732442	1732451	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_022576	CGATT	2	10	1751370	1751379	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_022576	GCCCT	2	10	1752478	1752487	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_022576	CGGGG	2	10	1775326	1775335	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
141	NC_022576	CATTG	2	10	1806101	1806110	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_022576	AATCA	2	10	1810292	1810301	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_022576	CGAAG	2	10	1829165	1829174	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_022576	GACAT	2	10	1868369	1868378	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_022576	CGCAC	2	10	1883123	1883132	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
146	NC_022576	CGCAC	2	10	1885051	1885060	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
147	NC_022576	GGCGC	2	10	1887960	1887969	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
148	NC_022576	TGCGC	2	10	1945853	1945862	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_022576	CCATC	2	10	1945888	1945897	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
150	NC_022576	GTGCT	2	10	1953237	1953246	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_022576	AGCAA	2	10	1955848	1955857	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_022576	GCACG	2	10	1958968	1958977	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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154	NC_022576	CCCTT	2	10	1958997	1959006	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
155	NC_022576	GGGAA	2	10	1977441	1977450	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_022576	TTGGA	2	10	2140968	2140977	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022576	CCATT	2	10	2144743	2144752	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
164	NC_022576	GTGCG	2	10	2154882	2154891	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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169	NC_022576	GGAAT	2	10	2213205	2213214	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_022576	GAGTA	2	10	2244049	2244058	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
179	NC_022576	TCGTG	2	10	2245008	2245017	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
180	NC_022576	TGAAG	2	10	2245864	2245873	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
181	NC_022576	GGGAG	2	10	2246598	2246607	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
182	NC_022576	ACCAA	2	10	2247022	2247031	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
183	NC_022576	CTCAT	2	10	2248621	2248630	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
184	NC_022576	CCTTC	2	10	2249126	2249135	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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186	NC_022576	GCGAT	2	10	2258453	2258462	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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188	NC_022576	GACCA	2	10	2265690	2265699	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_022576	GTTGG	2	10	2278761	2278770	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
192	NC_022576	ATTTT	2	10	2287674	2287683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_022576	GCGCG	2	10	2343598	2343607	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
198	NC_022576	CAACC	2	10	2352849	2352858	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
199	NC_022576	CCCCT	2	10	2356002	2356011	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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234	NC_022576	TGGCG	2	10	2753101	2753110	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.