MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni 4031 genome sequence

Total Repeats: 2743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022529	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022529	A	7	7	1358	1364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022529	ATT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022529	GAA	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022529	CAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022529	TTA	3	9	1437	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022529	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022529	GAA	2	6	4899	4904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022529	T	7	7	6521	6527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022529	TAT	2	6	6532	6537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022529	AAT	2	6	6554	6559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022529	A	7	7	6583	6589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022529	ATT	2	6	6593	6598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022529	TAAAA	2	10	6616	6625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022529	TTA	2	6	6644	6649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022529	T	6	6	6663	6668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022529	ATT	2	6	6688	6693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022529	T	6	6	8030	8035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022529	ATTT	3	12	8037	8048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022529	A	7	7	8074	8080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022529	TTA	2	6	8125	8130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022529	AAG	2	6	14676	14681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022529	A	6	6	14954	14959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022529	T	6	6	15658	15663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022529	GTATT	2	10	15676	15685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022529	A	7	7	15688	15694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022529	TAA	2	6	15708	15713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022529	AAAT	2	8	15742	15749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022529	A	6	6	15784	15789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022529	TTA	2	6	15790	15795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022529	AAAAT	2	10	18044	18053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022529	TTTA	2	8	18070	18077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022529	AATTTA	2	12	19355	19366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022529	AAAT	2	8	21868	21875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022529	GTTAA	2	10	21893	21902	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022529	A	6	6	21912	21917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022529	T	6	6	25558	25563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022529	ATT	2	6	25593	25598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022529	T	7	7	25597	25603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022529	A	6	6	25619	25624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022529	TGAT	2	8	25626	25633	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022529	CAT	2	6	25649	25654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022529	T	6	6	26518	26523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022529	ATT	2	6	26526	26531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022529	TTTTAT	2	12	26538	26549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022529	TAA	2	6	26560	26565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022529	T	6	6	26596	26601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022529	AAGG	2	8	27970	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022529	T	6	6	32526	32531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022529	T	6	6	32542	32547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022529	T	6	6	32560	32565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022529	A	7	7	32614	32620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022529	TTA	2	6	32627	32632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022529	TAA	2	6	35849	35854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022529	A	6	6	35859	35864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022529	A	6	6	35882	35887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022529	TTAT	2	8	35888	35895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022529	TGT	2	6	35897	35902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022529	T	6	6	36919	36924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022529	TATAT	2	10	36987	36996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022529	T	6	6	37003	37008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022529	C	9	9	37025	37033	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_022529	CCA	2	6	37044	37049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_022529	TA	3	6	37056	37061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022529	TTTA	2	8	37095	37102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022529	T	6	6	37141	37146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022529	A	6	6	37148	37153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022529	TAG	2	6	37192	37197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022529	T	6	6	37244	37249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022529	T	6	6	37260	37265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022529	CTTTT	2	10	37276	37285	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_022529	T	6	6	37294	37299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022529	TTA	2	6	37336	37341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022529	TAA	2	6	37425	37430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022529	CTTTT	2	10	37447	37456	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022529	GAA	2	6	37479	37484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022529	CTAT	2	8	37495	37502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_022529	T	6	6	37505	37510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022529	GGC	2	6	37545	37550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022529	ACA	2	6	37655	37660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022529	TA	3	6	37740	37745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022529	GGTAA	2	10	37759	37768	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022529	GAT	2	6	37807	37812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022529	GCA	2	6	37856	37861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022529	GCA	2	6	37896	37901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022529	CGC	2	6	37903	37908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_022529	GGA	2	6	37911	37916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022529	GAA	2	6	37952	37957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022529	CAG	2	6	38000	38005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022529	TGG	2	6	38159	38164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022529	CTG	2	6	38217	38222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022529	GTT	2	6	38310	38315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022529	GAA	2	6	38454	38459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022529	TGC	2	6	38534	38539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022529	GTC	2	6	38546	38551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_022529	TCGTG	2	10	38555	38564	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022529	AGG	3	9	38654	38662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022529	GAC	2	6	38671	38676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022529	TCA	2	6	38683	38688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022529	AC	3	6	38709	38714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022529	CCT	2	6	39013	39018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_022529	TAA	2	6	39034	39039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022529	AT	3	6	39060	39065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022529	TGA	2	6	39100	39105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022529	AGG	2	6	39163	39168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022529	CCA	2	6	39193	39198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_022529	TTA	2	6	39200	39205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022529	A	6	6	39285	39290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022529	A	6	6	39300	39305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022529	TA	3	6	39326	39331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022529	ATTT	2	8	39369	39376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022529	TATTTA	2	12	39434	39445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022529	AT	4	8	39462	39469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022529	CAAG	2	8	39525	39532	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022529	TAA	2	6	39536	39541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022529	TCTTT	2	10	39583	39592	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022529	TAA	2	6	39629	39634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022529	AAG	2	6	39751	39756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022529	A	6	6	39805	39810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022529	A	6	6	39814	39819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022529	CTA	2	6	39826	39831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022529	TGG	2	6	39840	39845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022529	AAG	2	6	39909	39914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022529	TA	3	6	39971	39976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022529	GCG	2	6	40047	40052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022529	TAGC	2	8	40190	40197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_022529	TGC	2	6	40503	40508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_022529	GGA	2	6	40566	40571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022529	TC	3	6	40652	40657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022529	AT	3	6	40662	40667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022529	CAG	2	6	40776	40781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022529	GGC	2	6	40785	40790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022529	CGT	2	6	40804	40809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_022529	AAC	2	6	40819	40824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022529	CTTA	2	8	40852	40859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_022529	AGG	2	6	40893	40898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022529	AGC	2	6	40909	40914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022529	AAAG	2	8	40923	40930	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022529	AGTA	2	8	40983	40990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022529	TAAT	2	8	41106	41113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022529	AGG	2	6	41311	41316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022529	GGAT	2	8	41376	41383	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022529	AGA	2	6	41384	41389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022529	CCGTA	2	10	41441	41450	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_022529	GGTG	2	8	41461	41468	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022529	GAA	2	6	41492	41497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022529	CT	3	6	41498	41503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_022529	GAA	2	6	41582	41587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022529	ACA	2	6	41592	41597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_022529	TCCC	2	8	41603	41610	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
151	NC_022529	CGG	2	6	41741	41746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_022529	TCC	2	6	41874	41879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_022529	TAC	2	6	41915	41920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_022529	TCT	2	6	42622	42627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_022529	CT	3	6	42633	42638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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167	NC_022529	GT	3	6	42665	42670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_022529	TAA	2	6	43128	43133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_022529	AGGA	2	8	49655	49662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_022529	AGCTT	2	10	51777	51786	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_022529	TCC	2	6	56224	56229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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192	NC_022529	AAT	2	6	56291	56296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_022529	GTTT	2	8	236445	236452	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

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