MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia pecorum W73

Total Repeats: 231

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022440	TC	3	6	32	37	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022440	TA	3	6	89	94	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022440	TG	3	6	3056	3061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022440	GA	3	6	32913	32918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022440	TA	3	6	37135	37140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022440	AT	3	6	42450	42455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022440	AT	3	6	56443	56448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022440	AG	3	6	56676	56681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022440	GC	3	6	56785	56790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022440	AC	3	6	58127	58132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_022440	TG	3	6	58192	58197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022440	TG	3	6	58440	58445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022440	GA	3	6	61753	61758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022440	AT	3	6	62803	62808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022440	AG	3	6	68701	68706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022440	TG	4	8	75854	75861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022440	AG	3	6	78250	78255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022440	CA	3	6	80657	80662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022440	TA	3	6	90798	90803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022440	GT	3	6	90930	90935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022440	CT	3	6	95943	95948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022440	TA	3	6	96020	96025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022440	GC	3	6	98120	98125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022440	TA	4	8	103445	103452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022440	GT	3	6	108627	108632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022440	AG	3	6	124582	124587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022440	TA	3	6	126105	126110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022440	CT	3	6	126383	126388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_022440	AG	3	6	126499	126504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022440	GA	3	6	135828	135833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022440	TC	3	6	137231	137236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_022440	AG	3	6	148255	148260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022440	GA	3	6	151634	151639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022440	AG	3	6	156731	156736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022440	AC	3	6	158069	158074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_022440	AT	3	6	178876	178881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022440	AT	3	6	189603	189608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022440	TC	3	6	198377	198382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022440	GA	3	6	198464	198469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022440	AC	3	6	203874	203879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022440	AG	3	6	203899	203904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022440	AG	3	6	204248	204253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022440	GA	3	6	208116	208121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022440	GT	3	6	208156	208161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022440	CT	3	6	208193	208198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022440	AT	3	6	216345	216350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022440	TG	3	6	217148	217153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022440	TC	3	6	219567	219572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022440	AG	4	8	227200	227207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022440	CT	3	6	227541	227546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022440	TA	3	6	230827	230832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022440	CT	3	6	233800	233805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022440	TC	3	6	258189	258194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022440	AG	3	6	264726	264731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022440	GA	3	6	271772	271777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022440	GA	3	6	282769	282774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022440	CA	3	6	282938	282943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022440	AT	3	6	297075	297080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022440	GC	3	6	298647	298652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022440	AG	3	6	298811	298816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022440	CT	3	6	299234	299239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022440	AG	3	6	302711	302716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022440	CA	3	6	311671	311676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022440	AT	3	6	314624	314629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022440	TA	4	8	330083	330090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022440	AG	3	6	332094	332099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022440	CT	3	6	333077	333082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_022440	TG	3	6	344387	344392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022440	AG	3	6	344399	344404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022440	AG	3	6	353652	353657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022440	TA	3	6	357264	357269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022440	AG	3	6	358070	358075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022440	AG	3	6	363019	363024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022440	AG	3	6	368918	368923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022440	AG	3	6	369520	369525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022440	TG	3	6	376602	376607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022440	TA	3	6	382732	382737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022440	TA	3	6	389358	389363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022440	CA	3	6	396611	396616	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_022440	GT	3	6	399296	399301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022440	GA	3	6	399337	399342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022440	AG	3	6	403728	403733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022440	AT	3	6	403754	403759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022440	GC	3	6	403800	403805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022440	GT	3	6	406090	406095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022440	TC	4	8	406149	406156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_022440	TG	3	6	406175	406180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022440	GA	3	6	414142	414147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022440	AG	4	8	417985	417992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022440	AG	3	6	426236	426241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022440	CA	3	6	431562	431567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022440	AT	3	6	451859	451864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022440	AG	4	8	462502	462509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022440	TA	3	6	464858	464863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022440	AG	3	6	464972	464977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022440	TA	3	6	465177	465182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022440	CT	3	6	475701	475706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_022440	AG	3	6	479346	479351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022440	TC	3	6	479356	479361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022440	AT	3	6	485034	485039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022440	AC	3	6	498858	498863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022440	AG	4	8	498883	498890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022440	GA	3	6	503574	503579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022440	TA	3	6	507906	507911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022440	TA	3	6	523132	523137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022440	CT	3	6	527061	527066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_022440	AG	3	6	544457	544462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022440	AT	3	6	545134	545139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022440	TA	3	6	556399	556404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022440	GA	3	6	556484	556489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022440	GA	3	6	559093	559098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022440	TG	3	6	559200	559205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022440	TA	3	6	560192	560197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022440	CT	3	6	568427	568432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_022440	CT	3	6	570934	570939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022440	AC	3	6	571000	571005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022440	CT	3	6	571672	571677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022440	TG	3	6	580177	580182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022440	CT	3	6	582077	582082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022440	TA	3	6	588084	588089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022440	TC	3	6	589438	589443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022440	AG	3	6	590146	590151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022440	CT	3	6	591011	591016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022440	TA	3	6	591084	591089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022440	GT	3	6	595899	595904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022440	TA	4	8	599377	599384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022440	GA	3	6	599412	599417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022440	AC	3	6	599555	599560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022440	CT	3	6	600335	600340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022440	GC	3	6	600593	600598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022440	CT	5	10	600812	600821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_022440	AG	3	6	600827	600832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022440	AG	3	6	600916	600921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022440	AT	3	6	601000	601005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022440	TC	3	6	601155	601160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022440	CT	3	6	601363	601368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022440	TA	3	6	601417	601422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022440	CT	3	6	601593	601598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_022440	CT	3	6	601889	601894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_022440	AT	3	6	602173	602178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022440	AT	3	6	602378	602383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022440	AG	3	6	602433	602438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022440	TC	3	6	602483	602488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_022440	TA	3	6	614128	614133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022440	CA	3	6	626491	626496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_022440	AG	3	6	626620	626625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022440	TA	3	6	627164	627169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022440	CT	3	6	631828	631833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_022440	TC	3	6	635407	635412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_022440	CA	3	6	635442	635447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_022440	GA	3	6	636541	636546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022440	TC	3	6	636606	636611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_022440	CA	3	6	648096	648101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_022440	TC	4	8	648161	648168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.