MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia pecorum W73

Total Repeats: 2295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022440	T	6	6	253146	253151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_022440	T	7	7	253172	253178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_022440	TAAT	2	8	253276	253283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022440	TTA	2	6	253295	253300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022440	T	6	6	253315	253320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022440	TTGG	2	8	253336	253343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_022440	T	7	7	253348	253354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022440	TGG	2	6	253362	253367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_022440	CAT	2	6	254520	254525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_022440	T	7	7	254573	254579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022440	GATT	2	8	254587	254594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
512	NC_022440	GAA	2	6	254597	254602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_022440	T	6	6	254611	254616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_022440	TAA	2	6	254621	254626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022440	GAA	2	6	254634	254639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_022440	AGTTT	2	10	254690	254699	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022440	T	8	8	254712	254719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_022440	TC	3	6	258189	258194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_022440	AGG	2	6	258231	258236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022440	T	7	7	258240	258246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022440	T	6	6	258262	258267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022440	AGAGAA	2	12	258337	258348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_022440	GAA	2	6	261755	261760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022440	ATT	2	6	261820	261825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022440	AGG	2	6	263099	263104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022440	ATG	2	6	263131	263136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022440	CAAG	2	8	263196	263203	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
528	NC_022440	AG	3	6	264726	264731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022440	T	6	6	265048	265053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022440	GAC	2	6	265113	265118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_022440	TCCA	2	8	265186	265193	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_022440	TCT	2	6	265197	265202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_022440	T	6	6	265202	265207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022440	GAA	2	6	265255	265260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_022440	TTG	2	6	265266	265271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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538	NC_022440	ATT	2	6	270843	270848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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541	NC_022440	T	6	6	271764	271769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022440	GA	3	6	271772	271777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022440	AAG	2	6	272486	272491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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545	NC_022440	GGA	2	6	274691	274696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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549	NC_022440	TTCAA	2	10	279290	279299	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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551	NC_022440	TTTGT	2	10	281082	281091	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022440	T	8	8	281091	281098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022440	T	6	6	281127	281132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_022440	TGT	2	6	281152	281157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022440	ATT	2	6	281166	281171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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557	NC_022440	TAA	2	6	281190	281195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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560	NC_022440	T	7	7	282788	282794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_022440	T	6	6	282822	282827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_022440	AGG	2	6	282862	282867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_022440	AAC	2	6	282906	282911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_022440	CA	3	6	282938	282943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_022440	TTG	2	6	287872	287877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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568	NC_022440	A	6	6	297030	297035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022440	CAA	2	6	297037	297042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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571	NC_022440	AT	3	6	297075	297080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022440	T	7	7	297105	297111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_022440	A	8	8	297114	297121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_022440	T	6	6	298465	298470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_022440	T	7	7	298493	298499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022440	A	6	6	298511	298516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_022440	G	13	13	298663	298675	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022440	T	9	9	298742	298750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_022440	TTTC	2	8	298767	298774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_022440	ATA	2	6	298798	298803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_022440	AG	3	6	298811	298816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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587	NC_022440	TATC	2	8	298868	298875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
588	NC_022440	CTT	2	6	298902	298907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_022440	A	11	11	298943	298953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_022440	GAA	2	6	299009	299014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_022440	GTAT	2	8	299138	299145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022440	AGT	2	6	299172	299177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_022440	AAG	2	6	299224	299229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_022440	CT	3	6	299234	299239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_022440	TAT	2	6	299247	299252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_022440	AGAA	2	8	299275	299282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_022440	AGCT	2	8	302729	302736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_022440	A	7	7	305261	305267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022440	GAT	2	6	308549	308554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_022440	ACGA	2	8	308763	308770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_022440	TGA	2	6	308805	308810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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608	NC_022440	GAATAA	2	12	308925	308936	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022440	A	6	6	311645	311650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_022440	CA	3	6	311671	311676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_022440	A	14	14	311676	311689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022440	A	6	6	311695	311700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_022440	TCT	2	6	311706	311711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_022440	ATTT	2	8	314552	314559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022440	ACAAAA	2	12	314568	314579	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
616	NC_022440	A	8	8	314576	314583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022440	GAA	2	6	314593	314598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022440	G	6	6	314612	314617	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022440	AT	3	6	314624	314629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022440	TTG	2	6	317507	317512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022440	A	7	7	317546	317552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022440	AAG	2	6	317578	317583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022440	CAA	2	6	321895	321900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_022440	ATT	2	6	321908	321913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022440	TAA	2	6	321915	321920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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627	NC_022440	A	6	6	321931	321936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_022440	T	7	7	322012	322018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_022440	GAT	2	6	322043	322048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_022440	A	6	6	322407	322412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_022440	T	10	10	322414	322423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_022440	TCT	2	6	322526	322531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_022440	T	6	6	322531	322536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_022440	AATA	2	8	322537	322544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_022440	CTT	2	6	325923	325928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_022440	GCT	2	6	325965	325970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_022440	T	6	6	326027	326032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_022440	AAG	2	6	326062	326067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_022440	GAAT	2	8	327277	327284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
642	NC_022440	A	6	6	327290	327295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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