MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2425

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022362	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022362	AATTTA	2	12	21111	21122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022362	TTTTAT	2	12	28294	28305	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022362	TATTTA	2	12	41196	41207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022362	GTTTTT	2	12	66317	66328	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022362	TAAAAT	2	12	96749	96760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022362	ATTAAA	2	12	141008	141019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022362	AAATAA	2	12	146765	146776	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022362	ATTTTT	2	12	161645	161656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022362	TATAAA	2	12	163057	163068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022362	AATTAA	2	12	163628	163639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022362	AAATTT	2	12	178775	178786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022362	CATAAA	2	12	181149	181160	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022362	AATATT	2	12	214861	214872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022362	TAATAT	2	12	215003	215014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022362	AAAATT	2	12	269334	269345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022362	CTTAAA	2	12	273682	273693	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022362	ATTTAT	2	12	354069	354080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022362	TATTTT	2	12	403102	403113	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022362	TGTGTT	2	12	410533	410544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022362	TATTTA	2	12	434962	434973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022362	TTTATT	2	12	438676	438687	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022362	TAAGGA	2	12	452216	452227	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022362	TTTTAT	2	12	487376	487387	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022362	AATTTA	2	12	516596	516607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022362	GTTTTT	2	12	525096	525107	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022362	AAAATA	2	12	532954	532965	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022362	TTTTAA	2	12	561540	561551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022362	CTTATA	2	12	601392	601403	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022362	ATATTT	2	12	617174	617185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022362	ATATAA	2	12	626748	626759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022362	ACTATT	2	12	627062	627073	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022362	CAAATA	2	12	627186	627197	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022362	TGGTAG	2	12	628896	628907	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022362	CTTATG	2	12	629744	629755	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022362	TAATAG	2	12	657228	657239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022362	ATTTAA	2	12	666171	666182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022362	TACAAA	2	12	668378	668389	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022362	TTTATT	2	12	676314	676325	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022362	TAAATT	2	12	676383	676394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022362	ATTTTT	2	12	682562	682573	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022362	TTTTCT	2	12	687496	687507	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022362	TTGCCT	2	12	688110	688121	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022362	ATAATT	2	12	710038	710049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022362	TTTACT	2	12	727474	727485	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022362	ATCTTT	2	12	727674	727685	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022362	TTAAAT	2	12	729618	729629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022362	TAACTT	2	12	735675	735686	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022362	AATTTA	2	12	736220	736231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022362	TATTTA	2	12	739093	739104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022362	TCTTAT	2	12	742781	742792	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022362	GGGTTG	2	12	743138	743149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022362	GTTTGG	2	12	743320	743331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022362	AATTAA	2	12	744625	744636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022362	TCAAAA	2	12	744657	744668	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022362	TTAGCT	2	12	745106	745117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022362	CTTCTA	2	12	745124	745135	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022362	AAATTT	2	12	809557	809568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022362	AATTTT	2	12	822855	822866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022362	ATATTT	2	12	846840	846851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022362	AAATTA	2	12	850633	850644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022362	ACAAAG	2	12	863463	863474	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022362	TTTTTA	2	12	865940	865951	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022362	AATAAA	2	12	912336	912347	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022362	ATTTTT	2	12	930513	930524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022362	TTCATT	2	12	930911	930922	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022362	ATCTTA	2	12	941106	941117	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022362	ATCTTA	2	12	946320	946331	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022362	TATAAA	2	12	946577	946588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022362	ATCTTA	2	12	946603	946614	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_022362	ATTTTG	2	12	996522	996533	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022362	ATTTTA	2	12	1070964	1070975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022362	TTAATT	2	12	1171185	1171196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022362	TTAATT	2	12	1199172	1199183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022362	AATTTT	2	12	1234631	1234642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022362	TTTATT	2	12	1263395	1263406	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022362	AATTTA	2	12	1263425	1263436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022362	GAAAAA	2	12	1268006	1268017	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022362	TTTGTA	2	12	1269877	1269888	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022362	TATAAT	2	12	1270487	1270498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022362	GCAAGG	2	12	1286515	1286526	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022362	ATAAAA	2	12	1293564	1293575	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022362	CTTTAT	2	12	1319292	1319303	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022362	CAAAAA	2	12	1390095	1390106	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022362	TTAATT	2	12	1400146	1400157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022362	AAATGA	2	12	1404058	1404069	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022362	AAAGAA	2	12	1404074	1404085	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022362	TGCTTG	2	12	1431170	1431181	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022362	TTCCAG	2	12	1431680	1431691	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022362	ATTTTT	2	12	1431723	1431734	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022362	ATTATA	2	12	1432611	1432622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022362	TACTTC	2	12	1432623	1432634	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022362	AAGGAT	2	12	1433120	1433131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022362	AATATT	2	12	1504563	1504574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022362	TATAAT	2	12	1537328	1537339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022362	TAGCTT	2	12	1567920	1567931	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022362	ATAAAA	2	12	1569406	1569417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022362	TAAAAA	2	12	1602776	1602787	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022362	ATTTTT	2	12	1660960	1660971	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022362	TGCTAA	2	12	1674593	1674604	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_022362	ACTCTT	2	12	1674840	1674851	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022362	TGGTAG	2	12	1676527	1676538	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022362	CTTATG	2	12	1677375	1677386	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_022362	AAACAA	2	12	1687837	1687848	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_022362	TTTTTA	2	12	1688370	1688381	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022362	TAAAAA	2	12	1703833	1703844	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022362	TAAAAT	2	12	1715373	1715384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022362	AAGCCT	2	12	1715477	1715488	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.