MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022354	TCT	2	6	483	488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022354	TAA	2	6	1506	1511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022354	TAA	2	6	2881	2886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022354	TAT	2	6	3073	3078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022354	CTC	2	6	3253	3258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_022354	ATT	2	6	3295	3300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022354	TTA	2	6	3340	3345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022354	TTA	2	6	3357	3362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022354	TAG	2	6	3369	3374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022354	ATA	2	6	3428	3433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022354	ATT	2	6	3474	3479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022354	TTA	2	6	3607	3612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022354	TAT	3	9	3920	3928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022354	CAT	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022354	CTG	2	6	4632	4637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022354	TCC	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_022354	TAT	2	6	5781	5786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022354	TTC	2	6	8035	8040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022354	GAT	2	6	8241	8246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022354	TGA	2	6	8300	8305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022354	TTA	2	6	8401	8406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022354	TCA	2	6	8450	8455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022354	TTA	2	6	10678	10683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022354	ATC	2	6	10785	10790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022354	AAT	2	6	10803	10808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022354	TTC	2	6	10840	10845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022354	AGT	2	6	10892	10897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022354	CCT	2	6	12412	12417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_022354	ATT	2	6	12467	12472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022354	TTA	2	6	12502	12507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022354	TAA	2	6	15393	15398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022354	ATA	3	9	15399	15407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022354	TCA	2	6	23715	23720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022354	TAA	2	6	23771	23776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022354	TTG	2	6	26503	26508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022354	ACC	2	6	30620	30625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_022354	TAA	2	6	30650	30655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022354	AAT	2	6	30666	30671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022354	TAT	2	6	30726	30731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022354	ATT	2	6	30776	30781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022354	TTA	2	6	30823	30828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022354	TAA	2	6	32218	32223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022354	GTT	2	6	34143	34148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022354	CTT	2	6	34281	34286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022354	GCA	2	6	34627	34632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022354	CAA	2	6	34691	34696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022354	CTC	2	6	34710	34715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_022354	TTA	2	6	34861	34866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022354	ATT	2	6	35026	35031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022354	TAA	2	6	35268	35273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022354	TAA	2	6	35331	35336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022354	TAT	2	6	35707	35712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022354	TAA	2	6	35717	35722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022354	TAT	2	6	37980	37985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022354	AGT	2	6	37991	37996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022354	TAA	2	6	38016	38021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022354	AAT	2	6	38043	38048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022354	TTA	2	6	41565	41570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022354	GTC	2	6	41588	41593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022354	ATG	2	6	41605	41610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022354	ATG	2	6	41635	41640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022354	ATC	2	6	46559	46564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022354	ATT	2	6	46565	46570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022354	ATA	2	6	46608	46613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022354	TAA	2	6	46684	46689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022354	TGA	2	6	46722	46727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022354	TCA	2	6	46884	46889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.