MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 genome

Total Repeats: 401

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022353	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022353	TAAT	2	8	6559	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022353	ATTA	2	8	6570	6577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022353	ATTT	3	12	8040	8051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022353	AAAT	2	8	17497	17504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022353	TTTA	2	8	19825	19832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022353	CCTT	2	8	23397	23404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022353	TGAT	2	8	27382	27389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022353	AAGG	2	8	29726	29733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022353	TTAT	2	8	37644	37651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022353	GTAT	2	8	37671	37678	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022353	ATTA	2	8	37793	37800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022353	ATTT	2	8	38880	38887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022353	TAAA	2	8	51136	51143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022353	TAAA	2	8	55992	55999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022353	CTTT	2	8	60254	60261	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_022353	GATT	2	8	61235	61242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022353	ATTT	2	8	61470	61477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022353	AATT	2	8	63177	63184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022353	AAAT	2	8	64832	64839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022353	GTTT	2	8	66496	66503	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022353	TTTA	2	8	66578	66585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022353	AATC	2	8	67214	67221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022353	TATT	2	8	68115	68122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022353	TTTA	2	8	76612	76619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022353	TTTA	2	8	77917	77924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022353	TAAA	2	8	83513	83520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022353	ATCA	2	8	88842	88849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_022353	AATT	2	8	89663	89670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022353	ATTT	2	8	89710	89717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022353	TAAA	2	8	89719	89726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022353	TAAA	2	8	90540	90547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022353	AGGA	2	8	95347	95354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022353	ATTA	2	8	113333	113340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022353	AAGG	2	8	127650	127657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022353	ATTT	2	8	140971	140978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022353	GTAT	2	8	148410	148417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022353	ATTT	2	8	157873	157880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022353	TTAA	2	8	165919	165926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022353	TGGG	2	8	165979	165986	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022353	GAAA	2	8	166044	166051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022353	CCTT	2	8	169484	169491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_022353	ATAG	2	8	173860	173867	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022353	ATTT	2	8	179262	179269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022353	ATTA	2	8	179433	179440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022353	TAAT	2	8	179656	179663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022353	CTTT	2	8	183007	183014	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022353	ACAA	2	8	190167	190174	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_022353	CATT	2	8	190235	190242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022353	AACA	2	8	190264	190271	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_022353	ATAA	2	8	190298	190305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022353	CAAA	2	8	196600	196607	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_022353	TTAA	2	8	196635	196642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022353	AAAT	2	8	196651	196658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022353	TAAA	2	8	197257	197264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022353	AGCA	2	8	203627	203634	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_022353	ATTT	2	8	224645	224652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022353	TTTA	2	8	227042	227049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022353	ATTG	2	8	228222	228229	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022353	AAGA	2	8	228474	228481	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022353	CAAG	2	8	238328	238335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_022353	AAAT	2	8	239692	239699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022353	CAAG	2	8	240014	240021	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022353	TAAA	2	8	244457	244464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022353	TAAA	2	8	244510	244517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022353	TAAA	2	8	249449	249456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022353	TAAA	2	8	250270	250277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022353	GGTT	2	8	250356	250363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022353	TTTA	2	8	255115	255122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022353	ATTA	3	12	255713	255724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022353	TTGA	2	8	259605	259612	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022353	TAAT	2	8	259624	259631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022353	ATTT	2	8	259824	259831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022353	ATTA	2	8	259911	259918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022353	TAAA	2	8	262746	262753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022353	TTTG	2	8	262779	262786	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022353	TTTA	2	8	268747	268754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022353	AGAT	2	8	268781	268788	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022353	AAAG	2	8	269796	269803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022353	ATTA	2	8	269814	269821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022353	GCCT	2	8	270792	270799	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022353	TAAA	2	8	270903	270910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022353	GTTT	2	8	275620	275627	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022353	TCCC	2	8	275704	275711	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_022353	TTGA	2	8	275754	275761	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022353	AAAT	2	8	285314	285321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022353	CTTT	2	8	295264	295271	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_022353	TTAA	2	8	296969	296976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022353	ATTG	2	8	297800	297807	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022353	GCAA	2	8	297895	297902	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_022353	ATGA	2	8	303570	303577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022353	AAGT	2	8	303580	303587	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022353	AATA	2	8	324470	324477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022353	AAAG	2	8	332383	332390	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022353	TAAA	2	8	332777	332784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022353	TTTA	2	8	333630	333637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022353	TAAA	2	8	344693	344700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022353	ATTT	2	8	345695	345702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022353	AATT	2	8	345737	345744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022353	ATTT	2	8	345921	345928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022353	TAAA	2	8	354653	354660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022353	ATAA	2	8	356436	356443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022353	ATTA	2	8	356475	356482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022353	TTTA	2	8	356512	356519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022353	TAAA	2	8	361350	361357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022353	TATT	2	8	369895	369902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022353	TTAT	2	8	392960	392967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022353	TTGT	2	8	393138	393145	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022353	TTTA	2	8	402173	402180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022353	TAAA	2	8	411384	411391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022353	AAGG	2	8	414012	414019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022353	TTTA	2	8	414447	414454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022353	ATTA	2	8	417656	417663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022353	TTTA	2	8	417698	417705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022353	TTGT	2	8	417871	417878	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022353	AAGT	2	8	419026	419033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022353	AATT	2	8	419040	419047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022353	AATT	2	8	419074	419081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022353	TTTA	2	8	424269	424276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022353	TTAC	2	8	424458	424465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_022353	GATA	2	8	428529	428536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022353	TTAA	2	8	429725	429732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022353	TTAA	2	8	429746	429753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022353	ATTT	2	8	429842	429849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022353	ATCT	2	8	429860	429867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_022353	GTTT	2	8	429948	429955	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022353	AAAG	2	8	434809	434816	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022353	TAAA	2	8	434852	434859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022353	CGAG	2	8	435114	435121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_022353	AAAG	2	8	435418	435425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022353	AATT	2	8	435515	435522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022353	TTAA	2	8	437066	437073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022353	ATAA	2	8	439298	439305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022353	ATTT	2	8	458743	458750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022353	ATTT	2	8	459183	459190	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022353	TAAA	2	8	460719	460726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022353	GTAA	2	8	481984	481991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022353	AAAG	2	8	482026	482033	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022353	TCAT	2	8	482429	482436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_022353	GTAA	2	8	490182	490189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022353	ATTC	2	8	491466	491473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_022353	TAAA	2	8	494350	494357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022353	TTTA	2	8	502059	502066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022353	CTTT	2	8	502460	502467	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_022353	GAAA	2	8	510405	510412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022353	ATTT	2	8	510431	510438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022353	GTTT	2	8	518788	518795	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022353	AAAC	2	8	518804	518811	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_022353	ATTT	2	8	534853	534860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022353	CAAA	2	8	538015	538022	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_022353	ATCA	2	8	538335	538342	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.