MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2426 genome

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022352	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022352	AATTTA	2	12	21111	21122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022352	TTTTCT	2	12	23500	23511	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022352	GTTTTT	2	12	60416	60427	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022352	TAAAAT	2	12	90848	90859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022352	ATTAAA	2	12	135107	135118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022352	AAATAA	2	12	140864	140875	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022352	ATTTTT	2	12	158266	158277	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022352	ATATTA	2	12	165303	165314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022352	AATATT	2	12	165445	165456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022352	AAAATT	2	12	201526	201537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022352	TTTGAA	2	12	201701	201712	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022352	TATTTT	2	12	201801	201812	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022352	TTAATT	2	12	216680	216691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022352	TATATT	2	12	217253	217264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022352	AAAAAT	2	12	218663	218674	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022352	AATAAC	2	12	232068	232079	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022352	AAAATT	2	12	260973	260984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022352	TATTTT	2	12	356187	356198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022352	TGTGTT	2	12	363618	363629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022352	TTTATT	2	12	385918	385929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022352	TTTTAT	2	12	434618	434629	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022352	AATTTA	2	12	463894	463905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022352	AAAATA	2	12	480252	480263	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022352	TTTTAA	2	12	508838	508849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022352	TAATAG	2	12	601066	601077	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022352	ATTTAA	2	12	610009	610020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022352	TTTATT	2	12	620151	620162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022352	TAAATT	2	12	620220	620231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022352	ATTTTT	2	12	626398	626409	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022352	ATAATT	2	12	653873	653884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022352	TTAAAT	2	12	673453	673464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022352	TCTTAT	2	12	680765	680776	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022352	GGGTTG	2	12	681122	681133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022352	GTTTGG	2	12	681304	681315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022352	AATTAA	2	12	682609	682620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022352	TCAAAA	2	12	682641	682652	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022352	TTAGCT	2	12	683090	683101	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022352	CTTCTA	2	12	683108	683119	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022352	AAATTT	2	12	747541	747552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022352	AAGCAA	2	12	757510	757521	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022352	ATATTT	2	12	784824	784835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022352	AAATTA	2	12	788617	788628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022352	ACAAAG	2	12	801447	801458	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022352	TTTTTA	2	12	803924	803935	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022352	AATAAA	2	12	850320	850331	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022352	TTTTAT	2	12	878311	878322	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022352	ATCTTA	2	12	879104	879115	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022352	ATCTTA	2	12	884318	884329	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022352	TATAAA	2	12	884575	884586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022352	ATCTTA	2	12	884601	884612	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022352	ATTTTA	2	12	1008963	1008974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022352	TAAATT	2	12	1084376	1084387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022352	TTAATT	2	12	1106705	1106716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022352	TTAATT	2	12	1134692	1134703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022352	AATTTT	2	12	1170151	1170162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022352	TTTATT	2	12	1198915	1198926	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022352	AATTTA	2	12	1198945	1198956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022352	GAAAAA	2	12	1203526	1203537	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022352	TTTGTA	2	12	1205397	1205408	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022352	TATAAT	2	12	1206007	1206018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022352	GCAAGG	2	12	1222035	1222046	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022352	ATAAAA	2	12	1229084	1229095	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022352	CATTAT	2	12	1250196	1250207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022352	CTTTAT	2	12	1253471	1253482	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022352	CAAAAA	2	12	1299879	1299890	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022352	TTAATT	2	12	1309930	1309941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022352	TATAAT	2	12	1438413	1438424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022352	TAGCTT	2	12	1469005	1469016	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022352	ATAAAA	2	12	1470491	1470502	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022352	TAAAAA	2	12	1502132	1502143	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022352	ATTTTT	2	12	1560316	1560327	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022352	TAAAAA	2	12	1599996	1600007	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022352	TAAAAT	2	12	1611536	1611547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022352	AAGCCT	2	12	1611640	1611651	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.