MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2426 genome

Total Repeats: 369

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022352	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022352	TAAT	2	8	6559	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022352	ATTA	2	8	6570	6577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022352	ATTT	3	12	8040	8051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022352	AAAT	2	8	17497	17504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022352	TTTA	2	8	19825	19832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022352	CCTT	2	8	23397	23404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022352	TGAT	2	8	27382	27389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022352	AAGG	2	8	29726	29733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022352	TTAT	2	8	37644	37651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022352	ATTT	2	8	39029	39036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022352	TAAA	2	8	51285	51292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022352	TAAA	2	8	56141	56148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022352	CTTT	2	8	60403	60410	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022352	GATT	2	8	61384	61391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022352	ATTT	2	8	61619	61626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022352	AATT	2	8	63326	63333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022352	AAAT	2	8	64981	64988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022352	GTTT	2	8	66645	66652	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022352	TTTA	2	8	66727	66734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022352	AATC	2	8	67363	67370	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022352	TATT	2	8	68264	68271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022352	TTTA	2	8	76761	76768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022352	TTTA	2	8	78066	78073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022352	TAAA	2	8	83662	83669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022352	AATT	2	8	89812	89819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022352	ATTT	2	8	89859	89866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022352	TAAA	2	8	89868	89875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022352	TAAA	2	8	90689	90696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022352	AGGA	2	8	95496	95503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022352	ATTA	2	8	113482	113489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022352	AAGG	2	8	127799	127806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022352	ATTT	2	8	140856	140863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022352	ATTA	2	8	141027	141034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022352	TAAT	2	8	141246	141253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022352	CTTT	2	8	144597	144604	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_022352	CAAA	2	8	158190	158197	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022352	TTAA	2	8	158225	158232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022352	AAAT	2	8	158241	158248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022352	TAAA	2	8	158847	158854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022352	ATTT	2	8	186237	186244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022352	TTTA	2	8	188634	188641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022352	ATTG	2	8	189814	189821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022352	AAGA	2	8	190066	190073	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022352	CAAG	2	8	199920	199927	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_022352	AAAT	2	8	201284	201291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022352	CAAG	2	8	201606	201613	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022352	TAAA	2	8	201776	201783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022352	TAAA	2	8	206049	206056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022352	TAAA	2	8	206102	206109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022352	TAAA	2	8	211041	211048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022352	TAAA	2	8	211862	211869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022352	GGTT	2	8	211948	211955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022352	TTTA	2	8	216707	216714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022352	ATTA	3	12	217305	217316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022352	TTGA	2	8	221197	221204	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022352	TAAT	2	8	221216	221223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022352	ATTT	2	8	221416	221423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022352	ATTA	2	8	221503	221510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022352	TAAA	2	8	224338	224345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022352	TTTG	2	8	224371	224378	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022352	AAAG	2	8	231388	231395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022352	ATTA	2	8	231406	231413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022352	GCCT	2	8	232380	232387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022352	TAAA	2	8	232491	232498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022352	GTTT	2	8	237208	237215	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022352	TCCC	2	8	237292	237299	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_022352	TTGA	2	8	237342	237349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022352	AAAT	2	8	246902	246909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022352	CTTT	2	8	256852	256859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_022352	TTAA	2	8	258557	258564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022352	ATTG	2	8	259388	259395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022352	GCAA	2	8	259483	259490	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_022352	ATGA	2	8	265158	265165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022352	AAGT	2	8	265168	265175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022352	AATA	2	8	285906	285913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022352	AAAG	2	8	293819	293826	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022352	TAAA	2	8	294213	294220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022352	TTTA	2	8	295066	295073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022352	TAAA	2	8	306129	306136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022352	ATTT	2	8	307357	307364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022352	TAAA	2	8	316089	316096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022352	ATAA	2	8	317872	317879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022352	ATTA	2	8	317911	317918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022352	TTTA	2	8	317948	317955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022352	TAAA	2	8	322786	322793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022352	TATT	2	8	331331	331338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022352	TTTA	2	8	363609	363616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022352	TAAA	2	8	372821	372828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022352	AAGG	2	8	375449	375456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022352	TTTA	2	8	375884	375891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022352	ATTA	2	8	379093	379100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022352	TTTA	2	8	379135	379142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022352	AAGT	2	8	380463	380470	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022352	AATT	2	8	380477	380484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022352	AATT	2	8	380511	380518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022352	TTTA	2	8	385706	385713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022352	TTAC	2	8	385891	385898	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_022352	GATA	2	8	389962	389969	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022352	TTAA	2	8	391158	391165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022352	TTAA	2	8	391179	391186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022352	ATTT	2	8	391275	391282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022352	ATCT	2	8	391293	391300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_022352	GTTT	2	8	391381	391388	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022352	TTAA	2	8	398400	398407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022352	ATAA	2	8	400632	400639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022352	ATTT	2	8	420077	420084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022352	ATTT	2	8	420517	420524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022352	GTAA	2	8	443318	443325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022352	AAAG	2	8	443360	443367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022352	TCAT	2	8	443763	443770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_022352	GTAA	2	8	451573	451580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022352	ATTC	2	8	452857	452864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_022352	TAAA	2	8	455741	455748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022352	TTTA	2	8	463450	463457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022352	CTTT	2	8	463851	463858	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_022352	GAAA	2	8	471796	471803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022352	ATTT	2	8	471822	471829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022352	GTTT	2	8	480179	480186	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022352	AAAC	2	8	480195	480202	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_022352	ATTT	2	8	496244	496251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022352	CAAA	2	8	499404	499411	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_022352	TTTC	2	8	499547	499554	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022352	ATCA	2	8	499724	499731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_022352	ATTT	2	8	500395	500402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022352	TTTA	2	8	507690	507697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022352	TTTA	2	8	508781	508788	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022352	TGTT	2	8	511188	511195	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022352	AATT	2	8	511298	511305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022352	CTTT	2	8	512775	512782	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_022352	ATCA	2	8	516057	516064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_022352	ATTT	2	8	519285	519292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022352	AATA	2	8	519488	519495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022352	ATTT	2	8	519527	519534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022352	ATTT	2	8	563175	563182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022352	TAAT	2	8	563201	563208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022352	GAAA	2	8	570295	570302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022352	ATTT	2	8	573853	573860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022352	TAAA	2	8	573861	573868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022352	GGAT	2	8	574137	574144	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022352	AATA	2	8	581468	581475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022352	CTTT	2	8	587506	587513	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_022352	TTTA	2	8	599351	599358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022352	TTAG	2	8	599503	599510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022352	CTTT	2	8	601034	601041	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_022352	TTTA	2	8	611600	611607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022352	TAAA	2	8	611624	611631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022352	TTTA	2	8	611843	611850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022352	TTAA	2	8	620190	620197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022352	AATT	2	8	620199	620206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022352	TGAT	2	8	623392	623399	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022352	TAAA	2	8	623564	623571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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361	NC_022352	GTTA	2	8	1594364	1594371	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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365	NC_022352	AAAT	2	8	1607869	1607876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
366	NC_022352	TTTA	2	8	1609974	1609981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.