MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2426 genome

Total Repeats: 2679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022352	T	6	6	599433	599438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1003	NC_022352	TTAG	2	8	599503	599510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_022352	T	8	8	599522	599529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_022352	T	7	7	600236	600242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_022352	TAT	2	6	600248	600253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_022352	TAA	2	6	600276	600281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_022352	A	6	6	600289	600294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_022352	AAT	2	6	600298	600303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_022352	T	6	6	600338	600343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_022352	T	6	6	600346	600351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_022352	CTTT	2	8	601034	601041	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_022352	T	8	8	601039	601046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022352	TAATAG	2	12	601066	601077	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_022352	AATTA	2	10	601084	601093	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_022352	T	8	8	601109	601116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_022352	ATA	3	9	601117	601125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_022352	ATA	2	6	601135	601140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_022352	A	6	6	607279	607284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_022352	T	8	8	607324	607331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_022352	ATTTAA	2	12	610009	610020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_022352	ATA	2	6	610026	610031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_022352	A	6	6	610033	610038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_022352	ATT	2	6	610061	610066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_022352	TTTAA	2	10	610068	610077	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_022352	AAT	2	6	610089	610094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_022352	TTC	2	6	611585	611590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_022352	TTTA	2	8	611600	611607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_022352	TAAA	2	8	611624	611631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_022352	CTTTG	2	10	611726	611735	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1031	NC_022352	T	6	6	611765	611770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1033	NC_022352	TTTA	2	8	611843	611850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_022352	TAT	2	6	611861	611866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_022352	TAA	2	6	611906	611911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_022352	A	7	7	611977	611983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1038	NC_022352	A	6	6	612048	612053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_022352	T	6	6	612110	612115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_022352	T	6	6	612125	612130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022352	T	6	6	612146	612151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1043	NC_022352	T	7	7	615668	615674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1048	NC_022352	A	6	6	616233	616238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1050	NC_022352	TTTATT	2	12	620151	620162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_022352	A	6	6	620167	620172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1053	NC_022352	AATT	2	8	620199	620206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_022352	TAAATT	2	12	620220	620231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_022352	T	7	7	620230	620236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_022352	ATA	2	6	620252	620257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_022352	T	6	6	620276	620281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1059	NC_022352	T	6	6	623356	623361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_022352	TAT	2	6	623373	623378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_022352	T	6	6	623384	623389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_022352	TGAT	2	8	623392	623399	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_022352	TAT	2	6	623456	623461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_022352	TTA	2	6	623488	623493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1066	NC_022352	ATTTA	2	10	624449	624458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_022352	TA	4	8	624457	624464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_022352	AT	3	6	624497	624502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_022352	TTAA	2	8	624518	624525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_022352	AAG	2	6	625655	625660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_022352	ATTTTT	2	12	626398	626409	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_022352	ATG	2	6	626467	626472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_022352	TGA	2	6	626486	626491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_022352	TGA	2	6	626502	626507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_022352	TAT	2	6	626517	626522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_022352	ATAC	2	8	626589	626596	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1079	NC_022352	ATCA	2	8	626638	626645	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1081	NC_022352	GGA	2	6	626688	626693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1084	NC_022352	TA	3	6	629187	629192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_022352	AATT	2	8	633055	633062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_022352	A	6	6	633085	633090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_022352	T	6	6	635534	635539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_022352	ATAAA	2	10	641415	641424	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_022352	T	6	6	641438	641443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_022352	TTAA	2	8	642957	642964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_022352	TAAT	2	8	642969	642976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_022352	AT	3	6	642975	642980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_022352	T	8	8	642980	642987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_022352	ATTTA	2	10	643001	643010	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_022352	A	6	6	643019	643024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_022352	ATT	2	6	643074	643079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_022352	A	6	6	643094	643099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_022352	AG	3	6	646096	646101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_022352	A	6	6	650307	650312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_022352	TTTAA	2	10	650330	650339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_022352	TTTA	2	8	651703	651710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_022352	TAAA	2	8	651733	651740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_022352	T	6	6	653475	653480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_022352	ATT	2	6	653844	653849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1116	NC_022352	ATAATT	2	12	653873	653884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_022352	ATT	3	9	653893	653901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_022352	ATT	2	6	653914	653919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_022352	AAT	2	6	653920	653925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_022352	GA	3	6	653962	653967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_022352	GAAA	2	8	654394	654401	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_022352	A	6	6	654399	654404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_022352	T	6	6	656096	656101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1125	NC_022352	AGA	2	6	656169	656174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1127	NC_022352	TTC	2	6	656260	656265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_022352	TCA	2	6	656325	656330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1130	NC_022352	TAT	2	6	656378	656383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_022352	TTTC	2	8	656443	656450	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_022352	A	6	6	656501	656506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_022352	GAA	2	6	656513	656518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_022352	A	6	6	660773	660778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_022352	ATTT	2	8	661572	661579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_022352	T	6	6	662874	662879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_022352	T	6	6	664089	664094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_022352	AAT	2	6	664111	664116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_022352	ATA	2	6	664146	664151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_022352	TA	3	6	664171	664176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_022352	A	6	6	664182	664187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_022352	TAA	2	6	664933	664938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_022352	T	6	6	666025	666030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_022352	TTAA	2	8	673307	673314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_022352	TGT	2	6	673347	673352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_022352	ATA	2	6	673361	673366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_022352	AAT	2	6	673371	673376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1149	NC_022352	AT	3	6	673422	673427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1150	NC_022352	TTAAAT	2	12	673453	673464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1151	NC_022352	AAAAT	2	10	673470	673479	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1152	NC_022352	AAT	2	6	673530	673535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1155	NC_022352	ATG	2	6	674398	674403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1158	NC_022352	TTGTA	2	10	678739	678748	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1159	NC_022352	AACA	2	8	679168	679175	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1165	NC_022352	AAC	2	6	679530	679535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1166	NC_022352	TGA	2	6	679637	679642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1177	NC_022352	TTTA	2	8	680587	680594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1219	NC_022352	A	7	7	681820	681826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1256	NC_022352	TAA	2	6	687915	687920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1261	NC_022352	AATAA	2	10	690000	690009	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_022352	TAA	2	6	690041	690046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_022352	A	6	6	691140	691145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_022352	AAT	2	6	691521	691526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_022352	ATTTA	2	10	692774	692783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_022352	ATA	3	9	692849	692857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1272	NC_022352	TGCT	2	8	701374	701381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1273	NC_022352	TAA	2	6	701389	701394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_022352	GAA	2	6	701413	701418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_022352	TTG	2	6	701431	701436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1276	NC_022352	CAT	2	6	701461	701466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1277	NC_022352	T	8	8	701481	701488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1278	NC_022352	A	7	7	701500	701506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1279	NC_022352	AAT	2	6	707148	707153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1281	NC_022352	TAT	2	6	709294	709299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1421	NC_022352	TGA	2	6	790427	790432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1423	NC_022352	AAT	2	6	790580	790585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_022352	AAT	2	6	790612	790617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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