MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022351	TTTTA	2	10	6527	6536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022351	TAAAA	2	10	6619	6628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022351	GTATT	2	10	17431	17440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022351	AAAAT	2	10	19799	19808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022351	ACCAA	2	10	23482	23491	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_022351	AAAAT	2	10	23623	23632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022351	GTTAA	2	10	23650	23659	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022351	TATAT	2	10	38743	38752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022351	AGCTT	2	10	46761	46770	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022351	AAAAT	2	10	61327	61336	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022351	ATTAC	2	10	61683	61692	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_022351	TTTAT	2	10	65040	65049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022351	TCTCT	2	10	71245	71254	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_022351	TAGGA	2	10	77981	77990	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022351	AAAAT	2	10	78007	78016	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022351	ATTTT	2	10	78017	78026	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022351	TTAAT	2	10	78742	78751	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022351	TATTT	2	10	78810	78819	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022351	TATAA	2	10	78827	78836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022351	TAAAA	2	10	83576	83585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022351	TTGGC	2	10	88937	88946	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022351	AAGAT	2	10	89024	89033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022351	TTAAT	2	10	140883	140892	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022351	TATTT	2	10	144622	144631	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022351	TTATT	2	10	158833	158842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022351	AAAGC	2	10	165224	165233	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022351	TATTT	2	10	171854	171863	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022351	TAAAA	2	10	182044	182053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022351	AAAAT	2	10	186212	186221	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022351	AAGTG	2	10	189092	189101	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022351	AGGAT	2	10	190274	190283	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022351	TAAAA	2	10	191632	191641	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022351	TAGAT	2	10	201315	201324	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022351	AAAAT	2	10	216762	216771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022351	AAATT	2	10	218599	218608	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022351	TTTTA	2	10	218645	218654	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022351	TAAAT	2	10	221512	221521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022351	CATAA	2	10	227092	227101	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022351	AAAGC	2	10	230471	230480	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022351	ATTCA	2	10	231826	231835	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022351	CTATT	2	10	232879	232888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_022351	ATATT	2	10	237373	237382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022351	ATTAA	2	10	240650	240659	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022351	TTAAT	2	10	242566	242575	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022351	ATAAA	2	10	260926	260935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022351	AAAAT	2	10	265255	265264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022351	AAAAT	2	10	265276	265285	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022351	ATTTT	2	10	265302	265311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022351	AAGAA	2	10	270920	270929	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022351	ATTTT	2	10	299116	299125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022351	TTTTG	2	10	300279	300288	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022351	AATTT	2	10	307433	307442	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022351	TTAAA	3	15	332381	332395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022351	GAGTA	2	10	339029	339038	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022351	TTTTA	2	10	351304	351313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022351	ATTAA	2	10	367378	367387	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022351	ATTAA	2	10	369871	369880	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022351	AATTT	2	10	393107	393116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022351	CTTTT	2	10	424441	424450	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_022351	CTTTT	2	10	424611	424620	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_022351	GGTAA	2	10	424923	424932	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022351	TCGTG	2	10	425719	425728	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_022351	TCTTT	2	10	426748	426757	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_022351	TAACT	2	10	426762	426771	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_022351	CCGTA	2	10	428606	428615	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_022351	TAAAT	2	10	429385	429394	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022351	GCTTA	2	10	430052	430061	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_022351	AGTGT	2	10	430151	430160	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022351	CTTAT	2	10	434629	434638	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022351	ATTTT	2	10	439156	439165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022351	TAAAT	2	10	460460	460469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022351	TTGCT	2	10	463822	463831	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022351	TTTAT	2	10	486581	486590	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022351	GATTT	2	10	487104	487113	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022351	TTTTA	2	10	494648	494657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022351	TTTTA	2	10	515119	515128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022351	TTTAA	2	10	516001	516010	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022351	AAATA	2	10	516057	516066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022351	AAAAT	2	10	539557	539566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022351	GTTTT	2	10	542653	542662	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022351	AAATA	2	10	542962	542971	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022351	CATTC	2	10	543679	543688	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_022351	TTTTA	2	10	551969	551978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022351	AAAAT	2	10	552003	552012	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022351	AATTA	2	10	554463	554472	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022351	AATAT	2	10	556760	556769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022351	TTTGA	2	10	569626	569635	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022351	ATTTG	2	10	570787	570796	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022351	TAAAA	2	10	584649	584658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022351	GATAA	2	10	607801	607810	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022351	TTTAA	2	10	617191	617200	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022351	GAAAA	2	10	626049	626058	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022351	TTTGC	2	10	629570	629579	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022351	AATTA	2	10	645611	645620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022351	TTTAA	2	10	654595	654604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022351	CTTTG	2	10	656253	656262	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022351	ATTTT	2	10	656520	656529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022351	ATTTA	2	10	668978	668987	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022351	TAAAA	3	15	685122	685136	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022351	ATAAA	2	10	685945	685954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022351	ATTTA	2	10	687531	687540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022351	TTTAA	2	10	694860	694869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022351	TAAAA	2	10	717930	717939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022351	AAAAT	2	10	718000	718009	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022351	TTTTA	2	10	718088	718097	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022351	TTGTA	2	10	723269	723278	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022351	TTTAT	2	10	725601	725610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022351	TAAAT	2	10	725869	725878	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022351	AATTA	2	10	725893	725902	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022351	TTTTA	2	10	725997	726006	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022351	GCAAA	2	10	726689	726698	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_022351	ATTTT	2	10	728398	728407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022351	ATTAA	2	10	728642	728651	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022351	AATAA	2	10	734508	734517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022351	ATTTA	2	10	737282	737291	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022351	TTTTC	2	10	767642	767651	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022351	TAAAA	2	10	802381	802390	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022351	AGACA	2	10	813064	813073	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_022351	ATTTT	2	10	829314	829323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022351	TTTTA	2	10	833305	833314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022351	TTGCC	2	10	837158	837167	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_022351	AGGTT	2	10	837961	837970	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022351	AAAAT	2	10	846027	846036	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022351	AAAAT	2	10	876914	876923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022351	ATTTT	2	10	882578	882587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022351	AAAAT	2	10	914835	914844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022351	TTAAT	2	10	926813	926822	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022351	ATAAA	2	10	929403	929412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022351	AATTA	2	10	951399	951408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022351	TAAAA	2	10	951442	951451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022351	TAAAA	2	10	980038	980047	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022351	TTTAT	2	10	985863	985872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022351	TTAAT	2	10	990962	990971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022351	CTTTT	2	10	1034185	1034194	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_022351	AAAAT	2	10	1043313	1043322	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022351	TATAT	2	10	1070072	1070081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022351	TTTTA	2	10	1075506	1075515	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022351	AGTTT	2	10	1133339	1133348	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022351	ATTTT	2	10	1137532	1137541	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022351	TATCA	2	10	1143495	1143504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_022351	TAAAA	2	10	1145902	1145911	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022351	TTTTA	2	10	1150981	1150990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022351	TTTAT	2	10	1172680	1172689	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022351	AAACT	2	10	1172709	1172718	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_022351	TTTAA	2	10	1172730	1172739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022351	ATTTA	2	10	1176724	1176733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022351	TATTT	2	10	1192704	1192713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022351	TTTAT	2	10	1192752	1192761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_022351	ATGTG	2	10	1275512	1275521	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_022351	TATAT	2	10	1305361	1305370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022351	TAAAG	2	10	1323943	1323952	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_022351	TAAAA	2	10	1487198	1487207	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_022351	TAAAA	2	10	1566105	1566114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_022351	TATTT	2	10	1566257	1566266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_022351	ATATA	2	10	1600475	1600484	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_022351	TAACT	2	10	1600718	1600727	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
189	NC_022351	TAAAT	2	10	1615655	1615664	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_022351	TAGTA	2	10	1656887	1656896	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
195	NC_022351	TCAAA	2	10	1657069	1657078	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_022351	ATATT	2	10	1658068	1658077	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_022351	ATTAA	2	10	1661113	1661122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.