MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 413

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022351	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022351	TAAT	2	8	6559	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022351	ATTA	2	8	6570	6577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022351	ATTT	3	12	8040	8051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022351	AAAT	2	8	17497	17504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022351	TTTA	2	8	19825	19832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022351	CCTT	2	8	23397	23404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022351	TGAT	2	8	27382	27389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022351	AAGG	2	8	29726	29733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022351	TTAT	2	8	37644	37651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022351	ATTT	2	8	39026	39033	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022351	TAAA	2	8	51282	51289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022351	TAAA	2	8	56138	56145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022351	CTTT	2	8	60400	60407	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022351	GATT	2	8	61381	61388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022351	ATTT	2	8	61616	61623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022351	AATT	2	8	63323	63330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022351	AAAT	2	8	64978	64985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022351	GTTT	2	8	66642	66649	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022351	TTTA	2	8	66724	66731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022351	AATC	2	8	67360	67367	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022351	TATT	2	8	68261	68268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022351	TTTA	2	8	76758	76765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022351	TTTA	2	8	78063	78070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022351	TAAA	2	8	83659	83666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022351	ATCA	2	8	88988	88995	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022351	AATT	2	8	89809	89816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022351	ATTT	2	8	89856	89863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022351	TAAA	2	8	89865	89872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022351	TAAA	2	8	90686	90693	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022351	AGGA	2	8	95493	95500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022351	ATTA	2	8	113479	113486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022351	AAGG	2	8	127796	127803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022351	ATTT	2	8	140853	140860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022351	ATTA	2	8	141024	141031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022351	TAAT	2	8	141247	141254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022351	CTTT	2	8	144598	144605	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022351	ACAA	2	8	151758	151765	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_022351	CATT	2	8	151826	151833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022351	AACA	2	8	151855	151862	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022351	ATAA	2	8	151889	151896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022351	CAAA	2	8	158191	158198	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_022351	TTAA	2	8	158226	158233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022351	AAAT	2	8	158242	158249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022351	TAAA	2	8	158848	158855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022351	AGCA	2	8	165216	165223	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022351	ATTT	2	8	186234	186241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022351	TTTA	2	8	188631	188638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022351	AAGA	2	8	190063	190070	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022351	CAAG	2	8	199917	199924	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_022351	AAAT	2	8	201281	201288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022351	CAAG	2	8	201603	201610	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_022351	TAAA	2	8	201773	201780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022351	TAAA	2	8	206046	206053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022351	TAAA	2	8	206099	206106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022351	TAAA	2	8	211038	211045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022351	TAAA	2	8	211859	211866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022351	GGTT	2	8	211945	211952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022351	TTTA	2	8	216704	216711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022351	ATTA	3	12	217302	217313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022351	TTGA	2	8	221194	221201	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022351	TAAT	2	8	221213	221220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022351	ATTT	2	8	221413	221420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022351	ATTA	2	8	221500	221507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022351	TAAA	2	8	224335	224342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022351	TTTG	2	8	224368	224375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022351	TTTA	2	8	230336	230343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022351	AGAT	2	8	230370	230377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022351	AAAG	2	8	231385	231392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022351	ATTA	2	8	231403	231410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022351	GCCT	2	8	232381	232388	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_022351	TAAA	2	8	232492	232499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022351	GTTT	2	8	237208	237215	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022351	TCCC	2	8	237292	237299	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_022351	TTGA	2	8	237342	237349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022351	AAAT	2	8	246902	246909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022351	CTTT	2	8	256852	256859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_022351	TTAA	2	8	258557	258564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022351	ATTG	2	8	259388	259395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022351	GCAA	2	8	259483	259490	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_022351	ATGA	2	8	265158	265165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022351	AAGT	2	8	265168	265175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022351	ATTT	2	8	270540	270547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022351	GTAT	2	8	277979	277986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022351	ATTT	2	8	287442	287449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022351	TTAA	2	8	295488	295495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022351	TGGG	2	8	295548	295555	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022351	GAAA	2	8	295613	295620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022351	CCTT	2	8	299053	299060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_022351	ATAG	2	8	303428	303435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022351	AATA	2	8	324460	324467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022351	AAAG	2	8	332373	332380	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022351	TAAA	2	8	332767	332774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022351	TTTA	2	8	333620	333627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022351	TAAA	2	8	344683	344690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022351	ATTT	2	8	345685	345692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022351	AATT	2	8	345727	345734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022351	ATTT	2	8	345911	345918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022351	TAAA	2	8	354643	354650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022351	ATAA	2	8	356426	356433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022351	ATTA	2	8	356465	356472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022351	TTTA	2	8	356502	356509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022351	TAAA	2	8	361340	361347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022351	TATT	2	8	369885	369892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022351	TTAT	2	8	392950	392957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022351	TTGT	2	8	393128	393135	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022351	TTTA	2	8	402163	402170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022351	TAAA	2	8	411375	411382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022351	AAGG	2	8	414003	414010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022351	TTTA	2	8	414438	414445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022351	ATTA	2	8	417647	417654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022351	TTTA	2	8	417689	417696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022351	TTGT	2	8	417862	417869	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022351	AAGT	2	8	419017	419024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022351	AATT	2	8	419031	419038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022351	AATT	2	8	419065	419072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022351	TTTA	2	8	424260	424267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022351	CTAT	2	8	424659	424666	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_022351	ATTT	2	8	426535	426542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022351	TAGA	2	8	426571	426578	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022351	CAAG	2	8	426690	426697	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_022351	TAGC	2	8	427355	427362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_022351	CTTA	2	8	428017	428024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022351	AAAG	2	8	428088	428095	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022351	AGTA	2	8	428148	428155	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022351	TAAT	2	8	428271	428278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022351	GGAT	2	8	428541	428548	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022351	GGTG	2	8	428626	428633	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022351	TCCC	2	8	428768	428775	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_022351	TTAC	2	8	429209	429216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_022351	AAAT	2	8	429641	429648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022351	CATT	3	12	430029	430040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_022351	AAGA	2	8	430093	430100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022351	GATA	2	8	433280	433287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022351	TTAA	2	8	434476	434483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022351	TTAA	2	8	434497	434504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022351	ATTT	2	8	434593	434600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022351	ATCT	2	8	434611	434618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_022351	GTTT	2	8	434699	434706	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022351	TTAA	2	8	441718	441725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022351	ATAA	2	8	443950	443957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022351	ATTT	2	8	463394	463401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022351	ATTT	2	8	463834	463841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022351	ATTA	2	8	465154	465161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022351	TAAA	2	8	465370	465377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022351	GTAA	2	8	486635	486642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022351	AAAG	2	8	486677	486684	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022351	TCAT	2	8	487080	487087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_022351	GTAA	2	8	494834	494841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022351	ATTC	2	8	496118	496125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_022351	TAAA	2	8	499002	499009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022351	TTTA	2	8	506711	506718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.