MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter coli CVM N29710

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022347	TTTAAA	2	12	7242	7253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022347	AATTTA	2	12	21282	21293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022347	TATTTT	2	12	24663	24674	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022347	TCTTAT	2	12	42496	42507	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022347	ATGTTT	2	12	42662	42673	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022347	GTTTGG	2	12	43441	43452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022347	ATTTTT	2	12	83268	83279	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022347	ATATAA	2	12	93126	93137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022347	ATTTTT	2	12	102021	102032	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022347	AAATAA	2	12	112396	112407	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022347	AAAAAT	2	12	115124	115135	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022347	ATTAAT	2	12	139262	139273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022347	TGCTAA	2	12	139627	139638	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022347	AATAAA	2	12	146132	146143	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022347	TAAAAA	2	12	180996	181007	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022347	ATTTTT	2	12	181071	181082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022347	TCTTTT	2	12	187742	187753	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022347	TGCATT	2	12	187993	188004	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022347	AAATTC	2	12	188912	188923	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022347	ATTTTT	2	12	217488	217499	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022347	ATTTTT	2	12	220114	220125	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022347	TACACT	2	12	223380	223391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022347	ATTTTT	2	12	224082	224093	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022347	AAAATA	2	12	251437	251448	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022347	TATTTT	2	12	260032	260043	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022347	TAATTT	2	12	270955	270966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022347	TCATTT	2	12	276521	276532	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022347	TTAAAA	2	12	281652	281663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022347	ATAAAA	2	12	302097	302108	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022347	AAAATT	2	12	387677	387688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022347	TTTTAA	2	12	389359	389370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022347	ATTTTT	2	12	421797	421808	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022347	TTGGAT	2	12	422865	422876	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022347	TAAAAA	2	12	458246	458257	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022347	AAAAAT	2	12	458683	458694	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022347	TTTTAA	2	12	488874	488885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022347	ATTTTT	2	12	550965	550976	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022347	GGATCA	2	12	553317	553328	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022347	TATTCT	2	12	554180	554191	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022347	CTTAAT	2	12	555252	555263	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022347	ATGCAA	2	12	555492	555503	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022347	AATTAA	2	12	597564	597575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022347	TAAAAA	2	12	603363	603374	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022347	TTTAAC	2	12	631353	631364	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022347	TATGAA	2	12	691950	691961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022347	TTAAAA	2	12	694218	694229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022347	AATTTT	2	12	719730	719741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022347	TTTTAT	2	12	733356	733367	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022347	ATTTTT	2	12	733689	733700	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022347	TTAAAA	2	12	733830	733841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022347	AGTTTT	2	12	790866	790877	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022347	TGATAT	2	12	816034	816045	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022347	TTGCAT	2	12	822262	822273	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022347	ATTTTA	2	12	822287	822298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022347	TTTTAA	2	12	824741	824752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022347	GATAAA	2	12	835648	835659	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022347	ATTTTG	2	12	838606	838617	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022347	TTTAAA	2	12	874086	874097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022347	TAAATT	2	12	878515	878526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022347	TTTATA	2	12	878639	878650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022347	ATCTTA	2	12	921271	921282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022347	ATTAAA	2	12	924149	924160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022347	TTTTCT	2	12	928738	928749	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022347	TGAAGT	2	12	929783	929794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022347	TATAAT	2	12	929810	929821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022347	ATTAAT	2	12	968755	968766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022347	TATAAT	2	12	974888	974899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022347	TAAAGA	2	12	990540	990551	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022347	TTTTTA	2	12	998825	998836	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022347	GATTAA	2	12	1015333	1015344	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022347	TATAAA	2	12	1030997	1031008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022347	AGCTAA	2	12	1034407	1034418	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022347	TAAACA	2	12	1036586	1036597	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022347	AACAAA	2	12	1042867	1042878	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022347	TAAAAA	2	12	1064526	1064537	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022347	TAAATT	2	12	1073266	1073277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022347	TATTTT	2	12	1093149	1093160	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022347	TGGTTT	2	12	1124513	1124524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022347	GAAAAT	2	12	1124674	1124685	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022347	TAAAAC	2	12	1125548	1125559	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022347	TAAAAA	2	12	1160444	1160455	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022347	CTTTTT	2	12	1161643	1161654	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_022347	AAATTT	2	12	1167199	1167210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022347	ATTTTG	2	12	1299339	1299350	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022347	TAAACT	2	12	1299565	1299576	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_022347	TAAACA	2	12	1309284	1309295	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_022347	AACAAA	2	12	1315565	1315576	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_022347	TTTTAA	2	12	1322799	1322810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022347	TAAAAA	2	12	1377577	1377588	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022347	TAAACT	2	12	1382383	1382394	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022347	TAATTT	2	12	1415762	1415773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022347	TCTTTT	2	12	1457138	1457149	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022347	ATTTTA	2	12	1490752	1490763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022347	ATACCA	2	12	1530792	1530803	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022347	TTAAAA	2	12	1543668	1543679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022347	TTTTTA	2	12	1551045	1551056	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022347	ATATTA	2	12	1557857	1557868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022347	AATATT	2	12	1557998	1558009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022347	TCTTTA	2	12	1584115	1584126	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_022347	TTTAAT	2	12	1586829	1586840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022347	AAAAAT	2	12	1623058	1623069	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022347	AGAAAA	2	12	1624494	1624505	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022347	AAAATG	2	12	1655449	1655460	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022347	TGATAA	2	12	1656460	1656471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022347	AAGCCT	2	12	1669775	1669786	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.