MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium argentoratense DSM 44202

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022198	CCCCA	2	10	396	405	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_022198	TCCTC	2	10	1010	1019	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_022198	ACCAC	2	10	1517	1526	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_022198	CCCCG	2	10	13053	13062	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5	NC_022198	TTTGG	2	10	17534	17543	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022198	GGGCC	2	10	34813	34822	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_022198	TTGGG	2	10	41948	41957	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022198	CCCAC	2	10	42330	42339	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
9	NC_022198	CCGCC	2	10	49128	49137	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10	NC_022198	AAGCG	2	10	50464	50473	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022198	ACTGC	2	10	55957	55966	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_022198	GCCCC	2	10	57468	57477	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13	NC_022198	GGTGG	2	10	60954	60963	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022198	TTTAC	2	10	62927	62936	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_022198	GGGTG	2	10	73018	73027	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022198	CGAGG	2	10	82743	82752	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022198	GACGC	2	10	83119	83128	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_022198	CGCGG	2	10	84754	84763	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_022198	TGGGG	2	10	97538	97547	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022198	TACCA	2	10	97566	97575	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_022198	TGCGG	2	10	99962	99971	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022198	GCGGT	2	10	114611	114620	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022198	GTGGA	2	10	121438	121447	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022198	TGGGT	2	10	124565	124574	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022198	GGTGT	2	10	124820	124829	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022198	TGGTG	2	10	125169	125178	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022198	CTGCG	2	10	126686	126695	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_022198	GTGGG	2	10	126906	126915	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022198	TGCGA	2	10	128547	128556	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022198	CTGTG	2	10	157360	157369	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022198	ACCTA	2	10	157483	157492	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_022198	GGTAG	2	10	164206	164215	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022198	CCTTT	2	10	172359	172368	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_022198	AGTCG	2	10	172388	172397	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_022198	CACAA	2	10	195013	195022	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_022198	ACCCA	2	10	201027	201036	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_022198	ACAAA	2	10	219836	219845	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_022198	GCACA	2	10	223267	223276	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_022198	GGCGC	2	10	231895	231904	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_022198	AAGCG	2	10	242918	242927	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022198	CCACC	2	10	246461	246470	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
42	NC_022198	CAAAT	2	10	252020	252029	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_022198	AAAGA	2	10	253496	253505	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022198	ACGCA	2	10	253821	253830	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_022198	TGGCA	2	10	254907	254916	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022198	TGCGG	2	10	282150	282159	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022198	GGCAC	2	10	286523	286532	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_022198	GTGCT	2	10	333278	333287	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022198	GCGGT	2	10	346160	346169	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022198	GCGAC	2	10	363120	363129	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_022198	TTTGC	2	10	380982	380991	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022198	ATGCA	2	10	421605	421614	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022198	CCTGC	2	10	433952	433961	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_022198	CAGCC	2	10	436892	436901	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_022198	CTTTC	2	10	440327	440336	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_022198	GTGAA	2	10	449648	449657	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022198	TCGTG	2	10	451135	451144	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_022198	GGGAG	2	10	452516	452525	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022198	CGAAG	2	10	452705	452714	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_022198	GATCT	2	10	453527	453536	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_022198	TTCGG	2	10	454228	454237	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_022198	AAGCT	2	10	455195	455204	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_022198	CAGCC	4	20	462670	462689	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_022198	CCGAC	2	10	478065	478074	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_022198	GGCGG	2	10	491763	491772	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022198	AGAAC	2	10	503569	503578	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_022198	TTGTT	2	10	525083	525092	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022198	GGGGC	2	10	525577	525586	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022198	CCCCG	2	10	556449	556458	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
70	NC_022198	GGGGC	2	10	576269	576278	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022198	AGTAA	2	10	580251	580260	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022198	CCGCC	2	10	588618	588627	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
73	NC_022198	TCTTT	2	10	591942	591951	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022198	TCTGT	2	10	602538	602547	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_022198	CGTGG	2	10	614548	614557	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022198	AGGGG	2	10	627369	627378	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022198	TCAAA	2	10	648410	648419	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_022198	CCACG	2	10	666868	666877	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_022198	GTTGT	2	10	684370	684379	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022198	GCGGG	2	10	689875	689884	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
81	NC_022198	GCGTC	2	10	694512	694521	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_022198	CCCAC	2	10	696227	696236	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
83	NC_022198	GATCA	2	10	699621	699630	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_022198	CAGTA	2	10	699808	699817	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_022198	TAAAC	2	10	731896	731905	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022198	TGTGG	2	10	738602	738611	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022198	GGCTA	2	10	748773	748782	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022198	GGGTG	2	10	781557	781566	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022198	GCCGG	2	10	803960	803969	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_022198	GTGTG	2	10	838090	838099	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022198	TCGTG	2	10	881370	881379	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_022198	GGGAG	2	10	882751	882760	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022198	CGAAG	2	10	882940	882949	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022198	GATCT	2	10	883762	883771	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022198	TTCGG	2	10	884463	884472	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_022198	AAGCT	2	10	885430	885439	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022198	GGCGC	2	10	930277	930286	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
98	NC_022198	CGGCC	2	10	971351	971360	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
99	NC_022198	CGGGG	2	10	971371	971380	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
100	NC_022198	GAAAA	2	10	981506	981515	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022198	CCCGG	2	10	992496	992505	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
102	NC_022198	ATTCA	2	10	1004583	1004592	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022198	ACTCA	2	10	1004593	1004602	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_022198	GCCCA	2	10	1005484	1005493	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NC_022198	CCCCA	2	10	1015951	1015960	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
106	NC_022198	ATCTG	2	10	1054040	1054049	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_022198	GCCCC	2	10	1060423	1060432	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
108	NC_022198	TGCAC	2	10	1096626	1096635	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_022198	GAACG	2	10	1120059	1120068	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_022198	TGTTT	2	10	1120431	1120440	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022198	CGCGT	2	10	1138178	1138187	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_022198	TGCGC	2	10	1148562	1148571	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_022198	ACGGA	2	10	1165485	1165494	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_022198	GTGGG	2	10	1173682	1173691	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022198	CACAC	2	10	1184399	1184408	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_022198	ATTTC	2	10	1221693	1221702	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022198	CCCCT	2	10	1243757	1243766	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
118	NC_022198	GGGCT	2	10	1249835	1249844	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_022198	ACGCT	2	10	1261487	1261496	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_022198	TCAAT	2	10	1274540	1274549	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_022198	GCAAC	2	10	1299695	1299704	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_022198	GCCAC	2	10	1314905	1314914	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_022198	AATCG	2	10	1335585	1335594	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_022198	CCACG	2	10	1335868	1335877	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_022198	CGCAT	2	10	1336133	1336142	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_022198	GCGGT	2	10	1355614	1355623	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_022198	TAAAT	2	10	1370058	1370067	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022198	AACAA	2	10	1400602	1400611	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_022198	ACCCC	2	10	1431059	1431068	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
130	NC_022198	GTCGA	2	10	1439565	1439574	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_022198	GGGTG	2	10	1442174	1442183	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022198	TGTGT	2	10	1478199	1478208	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022198	CACGT	2	10	1515689	1515698	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_022198	GAATG	2	10	1518850	1518859	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022198	CTTTT	2	10	1549649	1549658	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_022198	GCAGC	2	10	1551866	1551875	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_022198	CACCG	2	10	1552022	1552031	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_022198	CACCC	2	10	1567078	1567087	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
139	NC_022198	AGTTC	2	10	1602790	1602799	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_022198	GATCT	2	10	1604042	1604051	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_022198	TGCTT	2	10	1609126	1609135	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_022198	TGCCG	2	10	1644211	1644220	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_022198	GGTTT	2	10	1649568	1649577	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022198	CTGCA	2	10	1667630	1667639	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_022198	CCGCA	2	10	1680560	1680569	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
146	NC_022198	AGGAA	2	10	1709985	1709994	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022198	GTGCG	2	10	1717515	1717524	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
148	NC_022198	AGCTT	2	10	1725996	1726005	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_022198	ACCGA	2	10	1726962	1726971	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
150	NC_022198	CAGAT	2	10	1727663	1727672	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_022198	CTTCG	2	10	1728486	1728495	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_022198	CACAC	2	10	1728617	1728626	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
153	NC_022198	CTCCC	2	10	1728675	1728684	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
154	NC_022198	CACGA	2	10	1730056	1730065	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
155	NC_022198	CACCC	2	10	1734545	1734554	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
156	NC_022198	ACCCC	2	10	1744069	1744078	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
157	NC_022198	AGGCC	2	10	1795581	1795590	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
158	NC_022198	GACTA	2	10	1795600	1795609	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
159	NC_022198	CGTCC	2	10	1805801	1805810	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
160	NC_022198	TGGCG	2	10	1830820	1830829	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
161	NC_022198	GGCGT	2	10	1830902	1830911	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
162	NC_022198	GTGTG	2	10	1830912	1830921	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022198	GGGCT	2	10	1856263	1856272	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
164	NC_022198	GATGC	2	10	1871439	1871448	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
165	NC_022198	TCCGC	2	10	1871539	1871548	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
166	NC_022198	CGCAG	2	10	1914698	1914707	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
167	NC_022198	CCATA	2	10	1920251	1920260	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
168	NC_022198	ACATT	2	10	1929040	1929049	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
169	NC_022198	CCGCG	2	10	1940248	1940257	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
170	NC_022198	GCTGC	2	10	1940330	1940339	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
171	NC_022198	GCCAC	2	10	1944414	1944423	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
172	NC_022198	ACCCC	2	10	1951907	1951916	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
173	NC_022198	TCTCC	2	10	1959212	1959221	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
174	NC_022198	AGCTT	2	10	1974739	1974748	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
175	NC_022198	ACCGA	2	10	1975705	1975714	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
176	NC_022198	CAGAT	2	10	1976406	1976415	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
177	NC_022198	CTTCG	2	10	1977229	1977238	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
178	NC_022198	CACAC	2	10	1977360	1977369	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
179	NC_022198	CTCCC	2	10	1977418	1977427	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
180	NC_022198	CACGA	2	10	1978799	1978808	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
181	NC_022198	AAGGC	2	10	1980416	1980425	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
182	NC_022198	CTAGC	2	10	1992977	1992986	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
183	NC_022198	CACAG	2	10	1993432	1993441	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
184	NC_022198	CCAAC	2	10	2013202	2013211	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
185	NC_022198	ACGAC	2	10	2013230	2013239	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
186	NC_022198	ACCAC	2	10	2013858	2013867	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
187	NC_022198	TGGTT	2	10	2017047	2017056	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
188	NC_022198	TAAAA	2	10	2030942	2030951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_022198	GCGAT	2	10	2031069	2031078	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.