MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 2520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022121	A	7	7	431154	431160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1003	NC_022121	TAAAA	2	10	431201	431210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_022121	CAAA	2	8	431217	431224	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_022121	A	7	7	431222	431228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_022121	GA	3	6	432864	432869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_022121	CTT	2	6	432871	432876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_022121	AGA	2	6	434429	434434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_022121	AAG	2	6	434703	434708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_022121	TTA	2	6	434720	434725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_022121	ATAG	2	8	434763	434770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_022121	ATG	2	6	434781	434786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_022121	AAT	2	6	434791	434796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022121	ATC	2	6	434836	434841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_022121	T	6	6	434954	434959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_022121	GGA	2	6	434980	434985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_022121	GAC	2	6	434991	434996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_022121	TTCC	2	8	435045	435052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_022121	A	7	7	435068	435074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_022121	GAA	2	6	435086	435091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_022121	ATA	2	6	435104	435109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_022121	A	8	8	435961	435968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_022121	TCT	2	6	436832	436837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_022121	AC	3	6	436862	436867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_022121	AGAAA	2	10	436875	436884	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_022121	A	7	7	436903	436909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_022121	CTCTT	2	10	436914	436923	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1030	NC_022121	TAT	2	6	437167	437172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_022121	A	6	6	437195	437200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1033	NC_022121	AATTT	2	10	437224	437233	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_022121	T	6	6	437279	437284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1061	NC_022121	ATAGA	2	10	450499	450508	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_022121	T	8	8	454304	454311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_022121	A	6	6	454312	454317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_022121	CT	3	6	454326	454331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_022121	TCTT	2	8	454332	454339	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_022121	TAAT	2	8	454345	454352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_022121	CAT	2	6	454426	454431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1092	NC_022121	A	8	8	465489	465496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_022121	CAC	2	6	465498	465503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1103	NC_022121	GA	4	8	468448	468455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_022121	TGA	2	6	468469	468474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_022121	TA	3	6	468491	468496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_022121	T	6	6	468560	468565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_022121	TAT	2	6	468567	468572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_022121	GA	3	6	468589	468594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_022121	CTT	2	6	468606	468611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1111	NC_022121	TTC	2	6	469962	469967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_022121	TAC	2	6	469980	469985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1118	NC_022121	ATC	2	6	480390	480395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1120	NC_022121	A	6	6	485819	485824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_022121	CAAAA	2	10	485837	485846	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1122	NC_022121	A	8	8	485843	485850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_022121	AC	3	6	485852	485857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_022121	GA	4	8	485897	485904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_022121	CA	3	6	485934	485939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_022121	TC	3	6	485975	485980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_022121	A	6	6	485983	485988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1131	NC_022121	T	6	6	486055	486060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_022121	T	6	6	486078	486083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_022121	A	6	6	486107	486112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_022121	A	6	6	486165	486170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_022121	CAA	2	6	486248	486253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1137	NC_022121	GTT	2	6	486268	486273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_022121	ATA	2	6	486285	486290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1140	NC_022121	A	7	7	489642	489648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_022121	TAAA	2	8	489698	489705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_022121	TTG	2	6	490342	490347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1145	NC_022121	AAC	2	6	490428	490433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1149	NC_022121	TCT	2	6	490525	490530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1152	NC_022121	CT	3	6	490591	490596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1155	NC_022121	AAG	2	6	491597	491602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1176	NC_022121	ACT	2	6	496605	496610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1261	NC_022121	TTGGA	2	10	524253	524262	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1263	NC_022121	ACA	2	6	524284	524289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1272	NC_022121	CTA	2	6	525184	525189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1274	NC_022121	A	9	9	531423	531431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_022121	TTA	2	6	531436	531441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1276	NC_022121	TTTG	2	8	531453	531460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1419	NC_022121	TACA	2	8	598359	598366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1420	NC_022121	AG	3	6	598373	598378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_022121	GCA	2	6	598420	598425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1422	NC_022121	A	7	7	598459	598465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_022121	T	6	6	598494	598499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_022121	TAT	2	6	601638	601643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_022121	T	12	12	601646	601657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_022121	AGCA	2	8	601658	601665	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1427	NC_022121	A	6	6	601675	601680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_022121	TAC	2	6	601682	601687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1429	NC_022121	GA	3	6	603374	603379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_022121	TAG	2	6	603977	603982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_022121	AGA	2	6	603992	603997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_022121	GGA	2	6	604015	604020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_022121	T	6	6	605958	605963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_022121	TTC	2	6	605986	605991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1435	NC_022121	CCT	2	6	606005	606010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1437	NC_022121	TAGGGG	2	12	606116	606127	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1439	NC_022121	AGA	2	6	606323	606328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_022121	CCA	2	6	606340	606345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1441	NC_022121	TTA	2	6	606373	606378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_022121	TC	3	6	606388	606393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1443	NC_022121	TCT	2	6	606480	606485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1444	NC_022121	CTT	2	6	606496	606501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1445	NC_022121	CAA	2	6	606504	606509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1447	NC_022121	CCT	2	6	606621	606626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1449	NC_022121	TTC	2	6	608232	608237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_022121	A	9	9	608321	608329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_022121	T	7	7	611439	611445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_022121	ACC	2	6	611460	611465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1456	NC_022121	TAT	2	6	611520	611525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_022121	AC	3	6	611538	611543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1461	NC_022121	TCT	2	6	611620	611625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1471	NC_022121	AG	3	6	617084	617089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1472	NC_022121	A	6	6	617097	617102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1482	NC_022121	T	7	7	622036	622042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1483	NC_022121	T	6	6	622047	622052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1497	NC_022121	ATC	2	6	623111	623116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1500	NC_022121	TC	3	6	623325	623330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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