MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 2520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022121	GCA	2	6	188266	188271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_022121	CTT	2	6	188281	188286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_022121	GGAC	2	8	188308	188315	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
504	NC_022121	AAG	2	6	188418	188423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022121	TTG	2	6	188440	188445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022121	CAT	2	6	188450	188455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_022121	T	6	6	188489	188494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022121	TAA	2	6	188567	188572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_022121	TTG	2	6	188597	188602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_022121	CTC	2	6	188671	188676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_022121	CAC	2	6	188717	188722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_022121	ACA	2	6	188753	188758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_022121	TAC	2	6	188798	188803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_022121	CAT	2	6	188814	188819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_022121	CTC	2	6	189052	189057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_022121	AT	3	6	192769	192774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022121	TGT	2	6	192783	192788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_022121	AAG	2	6	193331	193336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_022121	T	6	6	193381	193386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022121	ATT	2	6	193394	193399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022121	T	6	6	193410	193415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022121	TATGAA	2	12	195386	195397	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_022121	AGA	2	6	195442	195447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022121	AAC	2	6	195449	195454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_022121	ATA	2	6	195469	195474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022121	T	6	6	195489	195494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022121	TGA	2	6	195598	195603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022121	CTC	2	6	196372	196377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_022121	CTA	2	6	196694	196699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_022121	ATTT	2	8	196727	196734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_022121	A	7	7	197213	197219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_022121	AG	3	6	197235	197240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022121	AAT	2	6	197245	197250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022121	T	8	8	197265	197272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_022121	T	6	6	197311	197316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022121	TAC	2	6	197355	197360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_022121	ATT	2	6	197364	197369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022121	ACGA	2	8	202845	202852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_022121	CTAAG	2	10	203011	203020	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
540	NC_022121	T	6	6	203119	203124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_022121	GAAA	2	8	203131	203138	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022121	A	7	7	203136	203142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022121	T	6	6	203909	203914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_022121	CAT	2	6	203938	203943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_022121	CT	3	6	203984	203989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_022121	AAT	2	6	204031	204036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022121	TAG	2	6	204067	204072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_022121	AAT	2	6	204080	204085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022121	AAG	2	6	204178	204183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_022121	CTT	2	6	204189	204194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_022121	GA	4	8	207043	207050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022121	T	7	7	207073	207079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022121	CT	4	8	207091	207098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_022121	A	6	6	207100	207105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022121	CCTT	2	8	216265	216272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_022121	GAA	2	6	216287	216292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022121	TTG	2	6	216304	216309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022121	A	6	6	216316	216321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_022121	A	7	7	218332	218338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022121	TAA	2	6	218339	218344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_022121	AG	4	8	218364	218371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_022121	A	6	6	218389	218394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_022121	GAA	2	6	218399	218404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_022121	TA	3	6	219918	219923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022121	GTC	2	6	219937	219942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_022121	CTAT	2	8	219992	219999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
567	NC_022121	T	6	6	220008	220013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022121	ATT	2	6	220110	220115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022121	TCT	2	6	220136	220141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_022121	GTC	2	6	220164	220169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_022121	TCC	2	6	220188	220193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_022121	ATG	2	6	220211	220216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_022121	GCAA	2	8	220236	220243	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
574	NC_022121	TTTTAC	2	12	221395	221406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
575	NC_022121	A	7	7	221457	221463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022121	TAA	2	6	221511	221516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_022121	ATTTC	2	10	221538	221547	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
578	NC_022121	CT	3	6	221559	221564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_022121	AATT	2	8	221571	221578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_022121	CTTG	2	8	221920	221927	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_022121	T	6	6	221975	221980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022121	TC	3	6	224560	224565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_022121	AG	3	6	224591	224596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_022121	CAATA	2	10	224661	224670	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
585	NC_022121	CTA	2	6	224682	224687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_022121	TAA	2	6	225634	225639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_022121	AAAC	2	8	225650	225657	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
588	NC_022121	T	8	8	228125	228132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022121	TCCT	2	8	228275	228282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
590	NC_022121	AGA	2	6	228327	228332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022121	AAC	2	6	234766	234771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_022121	AGA	2	6	234793	234798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022121	GAG	2	6	234810	234815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_022121	GCT	2	6	234862	234867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_022121	ACC	2	6	234871	234876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_022121	A	6	6	234902	234907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_022121	ACT	2	6	234966	234971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_022121	TGT	2	6	238771	238776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022121	TC	3	6	238791	238796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_022121	AG	3	6	238817	238822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022121	AGAA	2	8	241982	241989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
602	NC_022121	CA	3	6	243741	243746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_022121	AAAT	2	8	243890	243897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022121	AAGA	2	8	243909	243916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022121	GT	3	6	243958	243963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022121	T	6	6	243969	243974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_022121	TAAA	2	8	247344	247351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022121	ATA	2	6	247366	247371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022121	TTA	2	6	247387	247392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_022121	T	6	6	248343	248348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022121	TACAA	2	10	248372	248381	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
612	NC_022121	ATA	2	6	248404	248409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_022121	GA	3	6	250825	250830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_022121	ACT	2	6	250885	250890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_022121	TG	3	6	250935	250940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_022121	AATA	2	8	251002	251009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022121	T	6	6	251024	251029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022121	T	7	7	251043	251049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022121	A	6	6	251051	251056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022121	CTC	2	6	251648	251653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_022121	CAA	2	6	251692	251697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_022121	AG	3	6	251737	251742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022121	A	8	8	251743	251750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_022121	AAG	2	6	251761	251766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022121	TCC	2	6	252601	252606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_022121	GAAA	2	8	252622	252629	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022121	T	7	7	252643	252649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_022121	GCAG	2	8	252671	252678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
629	NC_022121	AG	3	6	252746	252751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_022121	TAT	2	6	252769	252774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022121	ACA	2	6	252810	252815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_022121	A	6	6	252859	252864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_022121	AAC	2	6	253918	253923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_022121	A	6	6	253932	253937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_022121	TAA	2	6	253983	253988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_022121	TA	3	6	254552	254557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_022121	CCAA	2	8	254587	254594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_022121	A	7	7	254611	254617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_022121	TAT	2	6	254630	254635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_022121	A	7	7	255052	255058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_022121	ATA	2	6	255065	255070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_022121	AACCCT	2	12	255111	255122	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
643	NC_022121	AAAC	2	8	255185	255192	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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647	NC_022121	AAT	2	6	256771	256776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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651	NC_022121	TTG	2	6	258236	258241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
652	NC_022121	TTG	2	6	258297	258302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
653	NC_022121	ACT	2	6	258328	258333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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655	NC_022121	CAG	2	6	260285	260290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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657	NC_022121	TTG	2	6	264221	264226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
658	NC_022121	TTTCA	2	10	264483	264492	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
659	NC_022121	A	8	8	264577	264584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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661	NC_022121	CTA	2	6	264683	264688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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665	NC_022121	ACT	2	6	264832	264837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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672	NC_022121	GTT	2	6	268393	268398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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685	NC_022121	ATATTA	2	12	279906	279917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
686	NC_022121	AAAG	2	8	279918	279925	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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688	NC_022121	T	6	6	279997	280002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
689	NC_022121	AGG	2	6	280008	280013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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788	NC_022121	TTAA	2	8	333978	333985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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