MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain Ia20-97 genome

Total Repeats: 2472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022120	A	8	8	424955	424962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1004	NC_022120	AGG	2	6	426452	426457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_022120	TTCT	2	8	428592	428599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_022120	CTCTT	2	10	428613	428622	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1007	NC_022120	A	6	6	428654	428659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_022120	T	7	7	428662	428668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_022120	T	6	6	429780	429785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_022120	AACT	2	8	430824	430831	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_022120	GAT	2	6	430856	430861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_022120	A	8	8	430904	430911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_022120	A	6	6	430973	430978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022120	TTG	2	6	431025	431030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_022120	AGC	2	6	431040	431045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_022120	A	6	6	431065	431070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_022120	A	7	7	431109	431115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_022120	AG	3	6	431124	431129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_022120	TAAAA	2	10	431156	431165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_022120	CAAA	2	8	431172	431179	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_022120	A	7	7	431177	431183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_022120	GA	3	6	432819	432824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_022120	CTT	2	6	432826	432831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1033	NC_022120	GAC	2	6	434946	434951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1054	NC_022120	GTA	2	6	440911	440916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1067	NC_022120	TCT	2	6	443689	443694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1101	NC_022120	AG	3	6	460422	460427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_022120	AGGA	2	8	460464	460471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_022120	AAC	2	6	462826	462831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_022120	ACA	2	6	465212	465217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_022120	A	6	6	465303	465308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_022120	AAG	2	6	465348	465353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_022120	TAAAA	2	10	465391	465400	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_022120	A	8	8	465444	465451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_022120	CAC	2	6	465453	465458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_022120	CTTT	2	8	465503	465510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_022120	GTA	2	6	465530	465535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1114	NC_022120	TC	3	6	466960	466965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_022120	CAAA	2	8	466969	466976	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_022120	A	6	6	466981	466986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_022120	ATA	2	6	466990	466995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_022120	AT	3	6	467029	467034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_022120	T	6	6	467055	467060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_022120	TGA	2	6	468424	468429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_022120	TA	3	6	468446	468451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_022120	T	6	6	468515	468520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_022120	TAT	2	6	468522	468527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_022120	GA	3	6	468544	468549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_022120	CTT	2	6	468561	468566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1129	NC_022120	TAC	2	6	469935	469940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_022120	GTT	2	6	469946	469951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_022120	A	6	6	469962	469967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_022120	TCT	2	6	474942	474947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_022120	TC	3	6	480275	480280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_022120	T	9	9	480312	480320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_022120	ATC	2	6	480344	480349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1137	NC_022120	A	6	6	485773	485778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_022120	CAAAA	2	10	485791	485800	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1139	NC_022120	A	8	8	485797	485804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_022120	AC	3	6	485806	485811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1141	NC_022120	GA	4	8	485851	485858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_022120	CA	3	6	485888	485893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1143	NC_022120	TC	3	6	485929	485934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1149	NC_022120	A	6	6	486061	486066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1272	NC_022120	T	6	6	524180	524185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1273	NC_022120	TTGGA	2	10	524203	524212	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1275	NC_022120	ACA	2	6	524234	524239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1276	NC_022120	AACC	2	8	524267	524274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1442	NC_022120	TGG	2	6	601674	601679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1453	NC_022120	AGA	2	6	606271	606276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_022120	TTCT	2	8	622045	622052	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

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