MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain Ia20-97 genome

Total Repeats: 2472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022120	CAT	2	6	188419	188424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_022120	T	6	6	188458	188463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_022120	TAA	2	6	188536	188541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022120	TTG	2	6	188566	188571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022120	CTC	2	6	188640	188645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_022120	CAC	2	6	188686	188691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_022120	ACA	2	6	188722	188727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_022120	TAC	2	6	188767	188772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_022120	CAT	2	6	188783	188788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_022120	GGT	2	6	188830	188835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022120	TTA	2	6	189045	189050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_022120	TGT	2	6	192752	192757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_022120	ATGC	2	8	193112	193119	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
514	NC_022120	T	6	6	193350	193355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022120	ATT	2	6	193363	193368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_022120	T	6	6	193379	193384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022120	AGA	2	6	195411	195416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_022120	AAC	2	6	195418	195423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_022120	ATA	2	6	195438	195443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022120	T	6	6	195458	195463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022120	TGA	2	6	195567	195572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022120	CTC	2	6	196339	196344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_022120	CTA	2	6	196661	196666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_022120	ATTT	2	8	196694	196701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022120	AACT	2	8	196705	196712	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
526	NC_022120	A	7	7	197180	197186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022120	AG	3	6	197202	197207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022120	AAT	2	6	197212	197217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022120	T	8	8	197232	197239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022120	T	6	6	197278	197283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_022120	TAC	2	6	197322	197327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_022120	ATT	2	6	197331	197336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022120	TAT	2	6	198971	198976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022120	CTAAG	2	10	202978	202987	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
535	NC_022120	T	6	6	203086	203091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022120	GAAA	2	8	203098	203105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022120	A	7	7	203103	203109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022120	T	6	6	203876	203881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022120	CAT	2	6	203905	203910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_022120	CT	3	6	203951	203956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_022120	AAT	2	6	203998	204003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022120	TAG	2	6	204034	204039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022120	AAT	2	6	204047	204052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_022120	AAG	2	6	204145	204150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_022120	CTT	2	6	204156	204161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_022120	GA	4	8	207010	207017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022120	T	7	7	207040	207046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_022120	CT	4	8	207058	207065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_022120	A	6	6	207067	207072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_022120	GAA	2	6	207101	207106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_022120	CCTT	2	8	216230	216237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_022120	GAA	2	6	216252	216257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022120	TTG	2	6	216269	216274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_022120	A	6	6	216281	216286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022120	TA	3	6	217150	217155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_022120	A	7	7	218297	218303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022120	TAA	2	6	218304	218309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022120	AG	4	8	218329	218336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_022120	A	6	6	218354	218359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022120	GAA	2	6	218364	218369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_022120	TA	3	6	219883	219888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_022120	GTC	2	6	219902	219907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_022120	CTAT	2	8	219957	219964	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
564	NC_022120	T	6	6	219973	219978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022120	ATT	2	6	220075	220080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_022120	TCT	2	6	220101	220106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_022120	GTC	2	6	220129	220134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_022120	TCC	2	6	220153	220158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_022120	ATG	2	6	220176	220181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022120	GCAA	2	8	220201	220208	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
571	NC_022120	TTTTAC	2	12	221360	221371	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
572	NC_022120	A	7	7	221422	221428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_022120	TAA	2	6	221476	221481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_022120	ATTTC	2	10	221503	221512	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
575	NC_022120	CT	3	6	221524	221529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_022120	AATT	2	8	221536	221543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_022120	CAA	2	6	221565	221570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_022120	T	6	6	221940	221945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022120	TC	3	6	224525	224530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_022120	AG	3	6	224556	224561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_022120	CAATA	2	10	224626	224635	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
582	NC_022120	CTA	2	6	224647	224652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_022120	AAAC	2	8	225615	225622	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_022120	T	8	8	228090	228097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_022120	TCCT	2	8	228240	228247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_022120	AGA	2	6	228292	228297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_022120	ATT	2	6	228329	228334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_022120	GTC	2	6	230583	230588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_022120	AGA	2	6	234758	234763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_022120	GAG	2	6	234775	234780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022120	GCT	2	6	234827	234832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_022120	ACC	2	6	234836	234841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_022120	A	6	6	234867	234872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_022120	ACT	2	6	234931	234936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_022120	TC	3	6	238756	238761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_022120	AG	3	6	238782	238787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_022120	AATCT	2	10	240767	240776	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
598	NC_022120	CA	3	6	243706	243711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_022120	AAAT	2	8	243855	243862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_022120	AAGA	2	8	243874	243881	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022120	GT	3	6	243923	243928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_022120	T	6	6	243934	243939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022120	CAT	2	6	245039	245044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_022120	TAAA	2	8	247308	247315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022120	ATA	2	6	247330	247335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022120	TTA	2	6	247351	247356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_022120	T	6	6	248307	248312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022120	TACAA	2	10	248336	248345	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
609	NC_022120	ATA	2	6	248368	248373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_022120	GA	3	6	250789	250794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022120	ACT	2	6	250849	250854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_022120	TG	3	6	250899	250904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_022120	AATA	2	8	250966	250973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_022120	T	6	6	250988	250993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022120	T	7	7	251007	251013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_022120	A	6	6	251015	251020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022120	CAA	2	6	251656	251661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_022120	AG	3	6	251701	251706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022120	A	8	8	251707	251714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022120	AAG	2	6	251725	251730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022120	GAAA	2	8	252586	252593	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022120	T	7	7	252607	252613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022120	GCAG	2	8	252635	252642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
624	NC_022120	AG	3	6	252710	252715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022120	TAT	2	6	252733	252738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_022120	ACA	2	6	252774	252779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_022120	A	6	6	252823	252828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_022120	CCCA	2	8	253491	253498	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
629	NC_022120	AAC	2	6	253882	253887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_022120	A	6	6	253896	253901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022120	TAA	2	6	253947	253952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_022120	TA	3	6	254516	254521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_022120	CCAA	2	8	254551	254558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_022120	A	7	7	254575	254581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_022120	TAT	2	6	254594	254599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_022120	A	7	7	255016	255022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_022120	ATA	2	6	255029	255034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_022120	AACCCT	2	12	255075	255086	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
639	NC_022120	AAAC	2	8	255148	255155	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
640	NC_022120	AAG	2	6	255272	255277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_022120	GAG	2	6	255997	256002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
642	NC_022120	ATT	2	6	256009	256014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_022120	T	6	6	256013	256018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_022120	TAT	2	6	256701	256706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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651	NC_022120	TTG	2	6	258260	258265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
652	NC_022120	ACT	2	6	258291	258296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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654	NC_022120	A	8	8	258320	258327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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777	NC_022120	ATA	2	6	322275	322280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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779	NC_022120	CCT	2	6	326905	326910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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784	NC_022120	ATT	2	6	327916	327921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
785	NC_022120	GCTA	2	8	328592	328599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
786	NC_022120	A	6	6	328677	328682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
787	NC_022120	A	6	6	330552	330557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
788	NC_022120	TTAG	2	8	330602	330609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
789	NC_022120	ATT	2	6	331117	331122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
790	NC_022120	A	6	6	331167	331172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
791	NC_022120	GCA	2	6	331180	331185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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793	NC_022120	T	6	6	333998	334003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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802	NC_022120	CAGT	2	8	334281	334288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
803	NC_022120	TCA	2	6	334336	334341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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822	NC_022120	A	7	7	341379	341385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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