MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 2435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022119	T	6	6	202625	202630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_022119	GAAA	2	8	202637	202644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
503	NC_022119	A	7	7	202642	202648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022119	T	6	6	203415	203420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022119	CAT	2	6	203444	203449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_022119	CT	3	6	203490	203495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_022119	AAT	2	6	203537	203542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022119	TAG	2	6	203573	203578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_022119	AAT	2	6	203586	203591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_022119	AAG	2	6	203684	203689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022119	CTT	2	6	203695	203700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_022119	GA	4	8	206549	206556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_022119	T	7	7	206579	206585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_022119	CT	4	8	206597	206604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_022119	A	6	6	206606	206611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_022119	CCTT	2	8	215771	215778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_022119	TTG	2	6	215797	215802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_022119	A	6	6	215809	215814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_022119	A	7	7	217801	217807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022119	TAA	2	6	217808	217813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022119	AG	4	8	217833	217840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022119	A	6	6	217858	217863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_022119	CA	3	6	217892	217897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_022119	TA	3	6	219387	219392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022119	GTC	2	6	219406	219411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_022119	CTAT	2	8	219461	219468	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
527	NC_022119	T	6	6	219477	219482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022119	ATT	2	6	219579	219584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022119	TCT	2	6	219605	219610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_022119	GTC	2	6	219633	219638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_022119	TCC	2	6	219657	219662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_022119	ATG	2	6	219680	219685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022119	GCAA	2	8	219705	219712	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
534	NC_022119	TTTTAC	2	12	220863	220874	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
535	NC_022119	A	8	8	220926	220933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022119	TAA	2	6	220981	220986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022119	ATTTC	2	10	221008	221017	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
538	NC_022119	CT	3	6	221029	221034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_022119	AATT	2	8	221041	221048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_022119	T	6	6	221445	221450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_022119	TC	3	6	224030	224035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_022119	AG	3	6	224061	224066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022119	CAATA	2	10	224131	224140	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
544	NC_022119	CTA	2	6	224152	224157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_022119	TAA	2	6	225104	225109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_022119	AAAC	2	8	225120	225127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
547	NC_022119	T	8	8	227595	227602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_022119	AGA	2	6	227793	227798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022119	AGA	2	6	234259	234264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_022119	GAG	2	6	234276	234281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_022119	GCT	2	6	234328	234333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_022119	ACC	2	6	234337	234342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_022119	A	6	6	234368	234373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_022119	ACT	2	6	234432	234437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_022119	TGT	2	6	238237	238242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_022119	TC	3	6	238257	238262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_022119	AG	3	6	238283	238288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022119	CA	3	6	243207	243212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_022119	AAAT	2	8	243356	243363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022119	AAGA	2	8	243375	243382	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
561	NC_022119	GT	3	6	243424	243429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_022119	T	6	6	243435	243440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_022119	TAAA	2	8	246810	246817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_022119	ATA	2	6	246832	246837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022119	TTA	2	6	246853	246858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_022119	T	6	6	247809	247814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022119	TACAA	2	10	247838	247847	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
568	NC_022119	ATA	2	6	247870	247875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022119	GA	3	6	250291	250296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022119	ACT	2	6	250351	250356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_022119	TG	3	6	250401	250406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022119	AATA	2	8	250468	250475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_022119	T	6	6	250490	250495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_022119	T	7	7	250509	250515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_022119	A	6	6	250517	250522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022119	CAA	2	6	251158	251163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_022119	AG	3	6	251203	251208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_022119	A	8	8	251209	251216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022119	AG	3	6	251228	251233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_022119	GAAA	2	8	252087	252094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_022119	T	7	7	252108	252114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022119	GCAG	2	8	252136	252143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
583	NC_022119	AGAA	2	8	252169	252176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_022119	AG	3	6	252211	252216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_022119	TAT	2	6	252234	252239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_022119	ACA	2	6	252275	252280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_022119	A	6	6	252324	252329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_022119	AAC	2	6	253383	253388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_022119	A	6	6	253397	253402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_022119	TAA	2	6	253448	253453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022119	TA	3	6	254017	254022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_022119	CCAA	2	8	254052	254059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_022119	A	7	7	254076	254082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_022119	TAT	2	6	254095	254100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_022119	A	7	7	254517	254523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_022119	ATA	2	6	254530	254535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_022119	AACCCT	2	12	254576	254587	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_022119	AAAC	2	8	254659	254666	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
599	NC_022119	ATTTTT	2	12	255380	255391	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_022119	GAG	2	6	255508	255513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022119	ATT	2	6	255520	255525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_022119	TAT	2	6	256212	256217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022119	ATA	2	6	256221	256226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022119	AAT	2	6	256245	256250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022119	A	8	8	256325	256332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022119	TC	3	6	256333	256338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_022119	TTG	2	6	257710	257715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022119	TTG	2	6	257771	257776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022119	ACT	2	6	257802	257807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_022119	AG	3	6	257811	257816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022119	CAG	2	6	259759	259764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_022119	TAG	2	6	263215	263220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_022119	TTG	2	6	263692	263697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_022119	TTTCA	2	10	263954	263963	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
615	NC_022119	A	8	8	264048	264055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_022119	TAAA	2	8	264064	264071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022119	CTA	2	6	264154	264159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_022119	TA	3	6	264171	264176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022119	CAA	2	6	264181	264186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_022119	AGA	2	6	264253	264258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022119	A	6	6	264269	264274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022119	ACT	2	6	264303	264308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_022119	CAAA	2	8	266999	267006	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
624	NC_022119	A	6	6	267010	267015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022119	A	7	7	267747	267753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_022119	GAG	2	6	267772	267777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022119	AGT	2	6	267959	267964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_022119	AGGAGA	2	12	270479	270490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_022119	GAG	2	6	271076	271081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022119	TCTA	2	8	273366	273373	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_022119	T	9	9	273397	273405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_022119	CAG	2	6	273425	273430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_022119	TA	3	6	273431	273436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_022119	ATTT	2	8	273512	273519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_022119	TCT	2	6	276885	276890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_022119	GTTT	2	8	279354	279361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
639	NC_022119	ATATTA	2	12	279377	279388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_022119	AAAG	2	8	279389	279396	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
641	NC_022119	A	6	6	279444	279449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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643	NC_022119	AGG	2	6	279479	279484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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