MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 281

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022118	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022118	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022118	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022118	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022118	AG	3	6	9351	9356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022118	TA	3	6	11249	11254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022118	TA	3	6	13340	13345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022118	TA	4	8	13564	13571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022118	AG	3	6	17516	17521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022118	GA	3	6	17529	17534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022118	AG	3	6	20517	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022118	GA	3	6	20675	20680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022118	AG	3	6	21192	21197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022118	CT	3	6	21261	21266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022118	GA	3	6	26513	26518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022118	CT	3	6	26520	26525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022118	TC	3	6	27888	27893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022118	AG	3	6	27971	27976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022118	GA	3	6	36384	36389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022118	AT	3	6	36486	36491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022118	CT	3	6	38753	38758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022118	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022118	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022118	GA	5	10	42591	42600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022118	AG	3	6	42715	42720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022118	TC	3	6	43807	43812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022118	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022118	TG	4	8	51391	51398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022118	GA	3	6	55607	55612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022118	AG	4	8	64773	64780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022118	TA	3	6	85201	85206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022118	TC	3	6	90422	90427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022118	GA	3	6	90554	90559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022118	CT	3	6	92903	92908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022118	GA	3	6	93431	93436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022118	TA	3	6	94047	94052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022118	TC	3	6	99928	99933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022118	AT	3	6	99979	99984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022118	TA	3	6	106654	106659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022118	TG	3	6	115896	115901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022118	AG	4	8	118482	118489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022118	GA	3	6	120304	120309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022118	TA	3	6	122539	122544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022118	GT	3	6	123528	123533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022118	CT	3	6	128064	128069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022118	TG	3	6	133295	133300	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022118	AG	3	6	138150	138155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022118	AT	3	6	142435	142440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022118	AG	3	6	157238	157243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022118	TC	3	6	171700	171705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022118	AG	3	6	171832	171837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022118	CT	3	6	171850	171855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022118	TG	3	6	178341	178346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022118	GA	3	6	183777	183782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022118	AG	3	6	196735	196740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022118	CT	3	6	203482	203487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022118	GA	4	8	206541	206548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022118	CT	4	8	206589	206596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_022118	TA	3	6	216644	216649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022118	AG	4	8	217823	217830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022118	CA	3	6	217882	217887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022118	TA	3	6	219377	219382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022118	CT	3	6	221019	221024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022118	TC	3	6	224020	224025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022118	AG	3	6	224051	224056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022118	TC	3	6	238247	238252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_022118	AG	3	6	238273	238278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022118	CA	3	6	243197	243202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022118	GT	3	6	243414	243419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022118	GA	3	6	250281	250286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022118	TG	3	6	250391	250396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022118	AG	3	6	251193	251198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022118	AG	3	6	251218	251223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022118	AG	3	6	252201	252206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022118	TA	3	6	254007	254012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022118	TC	3	6	256323	256328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_022118	AG	3	6	257801	257806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022118	TA	3	6	264161	264166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022118	TA	3	6	273422	273427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022118	AT	4	8	283982	283989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022118	TC	4	8	284925	284932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022118	TC	3	6	286615	286620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022118	TC	3	6	286672	286677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022118	CT	3	6	287145	287150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022118	CA	3	6	301490	301495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022118	AC	3	6	301531	301536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_022118	GA	3	6	306221	306226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022118	AG	3	6	315441	315446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022118	CA	3	6	330723	330728	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_022118	CT	3	6	347419	347424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_022118	CT	3	6	350490	350495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022118	CT	3	6	358631	358636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022118	AC	3	6	361964	361969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022118	TA	3	6	364154	364159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022118	CT	4	8	381271	381278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022118	CG	3	6	391110	391115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022118	CA	3	6	392160	392165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_022118	TC	3	6	394707	394712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022118	CT	3	6	395197	395202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022118	GA	3	6	395327	395332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022118	GA	3	6	395458	395463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022118	CT	3	6	410548	410553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_022118	AG	3	6	430645	430650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022118	GA	3	6	432340	432345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022118	AC	3	6	436338	436343	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_022118	CT	3	6	440609	440614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_022118	AC	3	6	440647	440652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022118	CT	3	6	453797	453802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022118	CT	3	6	456250	456255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_022118	AG	3	6	459938	459943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022118	TC	3	6	466476	466481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022118	AT	3	6	466545	466550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022118	TA	3	6	467962	467967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022118	GA	3	6	468060	468065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022118	AC	3	6	485369	485374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022118	GA	4	8	485414	485421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022118	CA	3	6	485451	485456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022118	TC	3	6	485492	485497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022118	AC	3	6	489926	489931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022118	AG	3	6	490087	490092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022118	CT	3	6	490106	490111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022118	TA	3	6	492242	492247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022118	CT	3	6	493385	493390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022118	TG	3	6	493936	493941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022118	TA	3	6	494049	494054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022118	CT	4	8	499706	499713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022118	CT	4	8	502673	502680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_022118	TG	3	6	512149	512154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022118	TA	3	6	514521	514526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022118	AG	3	6	516419	516424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022118	GA	3	6	517432	517437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022118	AG	3	6	517468	517473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022118	AT	3	6	523700	523705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022118	AC	3	6	534960	534965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022118	CT	3	6	535083	535088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022118	CT	3	6	536877	536882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022118	AT	3	6	540454	540459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022118	TC	3	6	541170	541175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_022118	CT	3	6	557974	557979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_022118	TC	3	6	558208	558213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_022118	GA	3	6	561766	561771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022118	CT	3	6	565046	565051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_022118	AG	3	6	575100	575105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022118	CT	3	6	589098	589103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_022118	CA	3	6	596707	596712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_022118	AG	3	6	597897	597902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022118	GA	3	6	602896	602901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022118	TA	3	6	605808	605813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022118	TC	3	6	605910	605915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_022118	AC	3	6	611301	611306	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_022118	CT	3	6	616555	616560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_022118	AG	3	6	616597	616602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022118	CT	3	6	629082	629087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_022118	AT	3	6	633474	633479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_022118	GA	3	6	648622	648627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.