MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 287

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022117	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022117	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022117	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022117	GA	3	6	6997	7002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022117	AG	3	6	9352	9357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022117	TA	3	6	11250	11255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022117	TA	3	6	13341	13346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022117	TA	4	8	13565	13572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022117	AG	3	6	17517	17522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022117	GA	3	6	17530	17535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022117	AG	3	6	20518	20523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022117	GA	3	6	20676	20681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022117	AG	3	6	21193	21198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022117	CT	3	6	21262	21267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022117	GA	3	6	26515	26520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022117	CT	3	6	26522	26527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022117	TC	3	6	27890	27895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022117	AG	3	6	27973	27978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022117	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022117	AT	3	6	36488	36493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022117	CT	3	6	38755	38760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022117	CT	3	6	40126	40131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022117	CT	3	6	42318	42323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022117	GA	5	10	42593	42602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022117	AG	3	6	42717	42722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022117	TC	3	6	43808	43813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022117	AG	3	6	48044	48049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022117	TG	4	8	51392	51399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022117	GA	3	6	55716	55721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022117	AG	4	8	64883	64890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022117	TA	3	6	85313	85318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022117	TC	3	6	90534	90539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022117	GA	3	6	90666	90671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022117	CT	3	6	93016	93021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022117	GA	3	6	93544	93549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022117	TA	3	6	94160	94165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022117	TC	3	6	100040	100045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022117	AT	3	6	100091	100096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022117	GA	3	6	100368	100373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022117	AG	3	6	100504	100509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022117	GA	3	6	101159	101164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022117	AG	3	6	101229	101234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022117	AC	3	6	101311	101316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022117	TC	3	6	101339	101344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022117	GA	3	6	101385	101390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022117	AG	3	6	101630	101635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022117	TA	3	6	106766	106771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022117	TG	3	6	116017	116022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022117	AG	4	8	118603	118610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022117	GA	3	6	120425	120430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022117	TG	3	6	120684	120689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022117	CT	3	6	121309	121314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022117	AT	3	6	122012	122017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022117	TC	3	6	122222	122227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022117	GA	3	6	122552	122557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022117	GT	3	6	123606	123611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022117	GA	3	6	123728	123733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022117	AG	3	6	124140	124145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022117	GA	3	6	124510	124515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022117	CT	3	6	128142	128147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022117	AG	3	6	138228	138233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022117	GA	3	6	138291	138296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022117	AT	3	6	142523	142528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022117	AG	3	6	157328	157333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022117	TC	3	6	171791	171796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022117	AG	3	6	171923	171928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022117	CT	3	6	171941	171946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_022117	TG	3	6	178431	178436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022117	AG	3	6	180091	180096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022117	CT	3	6	181143	181148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022117	GA	3	6	181222	181227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022117	CA	3	6	181535	181540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022117	TG	3	6	181934	181939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022117	GA	3	6	181975	181980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022117	GA	3	6	183862	183867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022117	TC	3	6	183951	183956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_022117	AG	3	6	196790	196795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022117	CT	3	6	203537	203542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_022117	CT	4	8	206643	206650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_022117	AG	3	6	209907	209912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022117	AG	4	8	217878	217885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022117	CA	3	6	217937	217942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022117	CT	3	6	221073	221078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022117	CT	3	6	221136	221141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022117	AG	3	6	224105	224110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022117	AG	3	6	238327	238332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022117	CA	3	6	243251	243256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022117	GT	3	6	243468	243473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022117	TG	3	6	250443	250448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022117	AG	3	6	251243	251248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022117	AG	3	6	251268	251273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022117	AG	3	6	252251	252256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022117	TC	3	6	256373	256378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022117	TC	3	6	256459	256464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_022117	AG	3	6	257851	257856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022117	CA	3	6	259891	259896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022117	TA	3	6	264211	264216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022117	TC	3	6	267918	267923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022117	TA	3	6	273471	273476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022117	AT	4	8	284031	284038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022117	TC	4	8	284974	284981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022117	TC	3	6	286665	286670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_022117	TC	3	6	286722	286727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_022117	CT	3	6	287195	287200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_022117	TG	3	6	297586	297591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022117	AC	3	6	301579	301584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_022117	AG	3	6	315489	315494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022117	TA	3	6	327538	327543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022117	CA	3	6	330772	330777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_022117	CT	3	6	348345	348350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022117	CT	3	6	350524	350529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022117	CT	3	6	358666	358671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022117	AC	3	6	361999	362004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022117	GA	3	6	363909	363914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022117	TC	3	6	363987	363992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022117	CT	4	8	381299	381306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022117	CA	3	6	392188	392193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022117	CT	3	6	395225	395230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022117	GA	3	6	395355	395360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022117	GA	3	6	395486	395491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022117	CA	3	6	426046	426051	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022117	AG	3	6	430672	430677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022117	AC	3	6	436365	436370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022117	CT	3	6	440641	440646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_022117	AC	3	6	440679	440684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_022117	TC	3	6	440726	440731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022117	CT	3	6	453830	453835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_022117	CT	3	6	456283	456288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022117	AG	3	6	459971	459976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022117	AT	3	6	466578	466583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022117	GA	3	6	468093	468098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022117	AC	3	6	485401	485406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022117	GA	4	8	485446	485453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022117	CA	3	6	485483	485488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022117	TC	3	6	485524	485529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022117	AC	3	6	489959	489964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022117	AG	3	6	490120	490125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022117	CT	3	6	490139	490144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_022117	AG	3	6	490432	490437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022117	GA	3	6	491516	491521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022117	TA	3	6	492275	492280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022117	TA	3	6	494082	494087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022117	TG	3	6	512175	512180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022117	TA	3	6	514484	514489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022117	AG	3	6	516382	516387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022117	GA	3	6	517394	517399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022117	AG	3	6	517430	517435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022117	AT	3	6	523662	523667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022117	AC	3	6	534767	534772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_022117	CT	3	6	534890	534895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_022117	CT	3	6	536684	536689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_022117	CA	3	6	547419	547424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_022117	CT	4	8	548440	548447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_022117	CT	3	6	557781	557786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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156	NC_022117	CT	3	6	564853	564858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.