MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 2593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022117	CT	3	6	171941	171946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_022117	AAAC	2	8	171951	171958	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_022117	T	6	6	172925	172930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022117	AAG	2	6	172945	172950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022117	ATA	2	6	172998	173003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022117	AAC	2	6	173022	173027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_022117	ATT	2	6	173050	173055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022117	AGA	2	6	173074	173079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_022117	T	7	7	173084	173090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_022117	A	6	6	173094	173099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022117	GTAT	2	8	173133	173140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
512	NC_022117	TTA	2	6	173147	173152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_022117	A	6	6	173152	173157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_022117	ATT	2	6	173244	173249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022117	TTCA	2	8	173302	173309	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
516	NC_022117	GGAA	2	8	178320	178327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022117	TGA	2	6	178354	178359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_022117	TG	3	6	178431	178436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_022117	TTGA	2	8	179513	179520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022117	ATG	2	6	179532	179537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022117	TGA	3	9	179541	179549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022117	TGA	2	6	179575	179580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_022117	CTG	2	6	179596	179601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_022117	CTG	2	6	179604	179609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_022117	AGA	3	9	179638	179646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022117	T	7	7	179671	179677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022117	TCA	2	6	179709	179714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_022117	TGTT	2	8	179721	179728	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022117	CCT	2	6	179819	179824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_022117	CAG	2	6	179870	179875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_022117	TAG	2	6	179981	179986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_022117	TTG	2	6	179992	179997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022117	CTC	2	6	180015	180020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_022117	AG	3	6	180091	180096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_022117	ATT	2	6	180132	180137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022117	AAG	2	6	180144	180149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022117	TGA	2	6	180388	180393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022117	AGAGT	2	10	180396	180405	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022117	GAA	2	6	180451	180456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_022117	AGG	2	6	180473	180478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_022117	AAG	3	9	180479	180487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022117	TGA	2	6	180600	180605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022117	TTCC	2	8	180730	180737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_022117	ACA	2	6	180757	180762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_022117	TGT	2	6	180798	180803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_022117	AAAC	2	8	180833	180840	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
547	NC_022117	T	6	6	180903	180908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_022117	TTGAA	2	10	180929	180938	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022117	TTTG	2	8	180943	180950	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
550	NC_022117	TGCA	2	8	181061	181068	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_022117	TGT	2	6	181079	181084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022117	AGT	2	6	181098	181103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022117	CT	3	6	181143	181148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_022117	T	6	6	181148	181153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022117	CTC	2	6	181177	181182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_022117	GA	3	6	181222	181227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022117	GAT	2	6	181277	181282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022117	AAAG	2	8	181430	181437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_022117	CA	3	6	181535	181540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NC_022117	ACA	2	6	181593	181598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_022117	CGA	2	6	181611	181616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_022117	AAT	2	6	181637	181642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_022117	ATT	2	6	181677	181682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_022117	GTTT	2	8	181733	181740	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022117	CTT	2	6	181821	181826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_022117	AGA	2	6	181901	181906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022117	TG	3	6	181934	181939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022117	G	9	9	181939	181947	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022117	GA	3	6	181975	181980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022117	AGA	2	6	182003	182008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_022117	GAA	2	6	182016	182021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022117	AGA	3	9	182060	182068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_022117	AAAG	2	8	182105	182112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_022117	AAGA	2	8	182123	182130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
575	NC_022117	T	8	8	182147	182154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022117	AGAAAA	2	12	182165	182176	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_022117	A	7	7	182173	182179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_022117	TCG	2	6	182214	182219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_022117	TAT	2	6	183822	183827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_022117	GA	3	6	183862	183867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_022117	AGA	2	6	183904	183909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022117	TC	3	6	183951	183956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_022117	TGT	2	6	183965	183970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_022117	TCT	3	9	184034	184042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_022117	TTTC	2	8	184107	184114	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_022117	CTG	2	6	184155	184160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_022117	GGA	2	6	184182	184187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_022117	TAG	2	6	184207	184212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022117	AGT	2	6	184337	184342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_022117	ATCG	2	8	184364	184371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
591	NC_022117	GTT	2	6	185186	185191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_022117	GTT	4	12	185576	185587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022117	T	6	6	185593	185598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_022117	T	7	7	185601	185607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_022117	T	6	6	185613	185618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_022117	T	7	7	185663	185669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_022117	A	7	7	185685	185691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_022117	T	6	6	185708	185713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022117	CGATA	2	10	187425	187434	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
600	NC_022117	T	6	6	187438	187443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022117	TCC	2	6	187458	187463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_022117	ACA	3	9	187464	187472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_022117	AGT	2	6	187482	187487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022117	AAAC	2	8	187507	187514	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
605	NC_022117	TGC	2	6	187573	187578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_022117	AGT	2	6	187641	187646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_022117	AGT	2	6	187664	187669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022117	TTG	2	6	187672	187677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022117	TAT	2	6	187752	187757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_022117	T	6	6	187771	187776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022117	GCA	2	6	187824	187829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_022117	CTT	2	6	187839	187844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_022117	GGAC	2	8	187866	187873	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
614	NC_022117	AAG	2	6	187976	187981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022117	TTG	2	6	187998	188003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_022117	CAT	2	6	188008	188013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_022117	T	7	7	188047	188053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022117	TAA	2	6	188126	188131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022117	TTG	2	6	188154	188159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022117	AAG	2	6	191969	191974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022117	TGT	2	6	192340	192345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022117	ATGC	2	8	192697	192704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_022117	GTT	2	6	192705	192710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_022117	T	6	6	192935	192940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022117	ATT	2	6	192948	192953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_022117	T	6	6	192964	192969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022117	AAACAT	2	12	193011	193022	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
628	NC_022117	AGA	2	6	194996	195001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_022117	AAC	2	6	195003	195008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_022117	ATA	2	6	195023	195028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022117	T	7	7	195048	195054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_022117	TGA	2	6	195158	195163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_022117	CTA	2	6	196249	196254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_022117	ATTT	2	8	196282	196289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_022117	AACT	2	8	196293	196300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
636	NC_022117	GAC	2	6	196309	196314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_022117	AG	3	6	196790	196795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_022117	AAT	2	6	196800	196805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_022117	T	13	13	196814	196826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_022117	T	6	6	196865	196870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_022117	TAC	2	6	196909	196914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_022117	ATT	2	6	196918	196923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_022117	T	6	6	199837	199842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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647	NC_022117	CT	3	6	203537	203542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
648	NC_022117	AAT	2	6	203584	203589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
649	NC_022117	TAG	2	6	203620	203625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
650	NC_022117	AAT	2	6	203633	203638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
651	NC_022117	AAG	2	6	203731	203736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
652	NC_022117	CTT	2	6	203742	203747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_022117	T	7	7	206625	206631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
654	NC_022117	CT	4	8	206643	206650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
655	NC_022117	A	6	6	206652	206657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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663	NC_022117	AG	4	8	217878	217885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
664	NC_022117	A	6	6	217903	217908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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675	NC_022117	A	8	8	220970	220977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
676	NC_022117	TAA	2	6	221025	221030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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764	NC_022117	A	6	6	256468	256473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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769	NC_022117	A	8	8	257871	257878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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777	NC_022117	CTA	2	6	264194	264199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
778	NC_022117	TA	3	6	264211	264216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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