MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 483

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022108	A	6	6	1203	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022108	T	7	7	1247	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022108	A	6	6	1258	1263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022108	T	6	6	1639	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022108	T	7	7	1661	1667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022108	A	6	6	1733	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022108	A	6	6	5066	5071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022108	A	6	6	7011	7016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022108	A	6	6	9130	9135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022108	A	6	6	9215	9220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022108	A	6	6	9285	9290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022108	T	6	6	19897	19902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022108	T	6	6	19904	19909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022108	A	6	6	20477	20482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022108	A	6	6	20552	20557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022108	A	7	7	24557	24563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022108	T	9	9	24585	24593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022108	A	6	6	26539	26544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022108	T	7	7	26551	26557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022108	T	7	7	27865	27871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022108	T	9	9	36414	36422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022108	T	6	6	38832	38837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022108	A	8	8	40110	40117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022108	T	6	6	40125	40130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022108	T	8	8	40306	40313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022108	A	6	6	42576	42581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022108	A	7	7	42625	42631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022108	A	7	7	42646	42652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022108	A	6	6	42716	42721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022108	A	8	8	43849	43856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022108	T	9	9	45952	45960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022108	T	8	8	48602	48609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022108	T	8	8	48885	48892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022108	A	6	6	48936	48941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022108	T	6	6	49046	49051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022108	T	7	7	49698	49704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022108	T	6	6	51430	51435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022108	T	6	6	52279	52284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022108	T	6	6	53337	53342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022108	T	6	6	53352	53357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022108	T	6	6	54168	54173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022108	T	6	6	59115	59120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022108	T	6	6	59142	59147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022108	A	9	9	60958	60966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022108	T	7	7	60978	60984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022108	G	6	6	67514	67519	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022108	A	6	6	69165	69170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022108	T	6	6	71126	71131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022108	T	8	8	71147	71154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022108	T	6	6	74794	74799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022108	A	6	6	76729	76734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022108	A	6	6	78497	78502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022108	A	6	6	78727	78732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022108	A	7	7	78735	78741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022108	T	7	7	79310	79316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022108	T	6	6	79388	79393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022108	T	7	7	79413	79419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022108	T	7	7	79706	79712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022108	T	6	6	85138	85143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_022108	A	6	6	94427	94432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022108	T	6	6	97766	97771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022108	A	6	6	97807	97812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022108	A	6	6	97838	97843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022108	T	6	6	100063	100068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022108	A	7	7	114040	114046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022108	A	8	8	114049	114056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022108	A	6	6	115901	115906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022108	A	7	7	115954	115960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022108	T	6	6	122684	122689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_022108	T	6	6	187797	187802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022108	T	7	7	188073	188079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022108	T	6	6	192944	192949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022108	T	6	6	192973	192978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022108	T	7	7	195057	195063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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121	NC_022108	T	13	13	197130	197142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022108	T	6	6	197181	197186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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124	NC_022108	T	7	7	203038	203044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022108	T	7	7	206941	206947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022108	A	6	6	206968	206973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_022108	T	6	6	221805	221810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022108	A	6	6	234730	234735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_022108	A	8	8	256676	256683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022108	A	6	6	256779	256784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_022108	T	6	6	285242	285247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.